1998年的法兰西之下，因扎吉第一次踏上世界杯的赛场，他在对阵奥地利的比赛中替补出场助攻罗伯托•巴乔破门，从而帮助意大利2:1击败对手，犹记得他趴在巴乔的背上开心犹如一个孩子一般。而过了几个月他在对西班牙的友谊赛中收获了自己的首粒国家队进球。
一年后的欧冠半决赛第二回合，因扎吉在上半场11分钟内梅开二度，但曼联之后连进三球，尤文图斯最终以两回合3比4的总比分被红魔军团逆转，无缘决赛。他还经历了2000年欧洲杯决赛法国队金球绝杀。而在1999到2000赛季在榜首保持了将近一个赛季的尤文图斯在最后一轮失利，从而屈居亚军。也许这一次次的遗憾加之后来法国前锋大卫·特雷泽盖的到来，因扎吉的出场时间受到了影响，他选择结束了自己的斑马军团岁月。
2001年7月，因扎吉以4100万欧元的身价来到AC米兰，开启了自己更加辉煌的红黑生涯，他再一次披上了九号球衣，只是这次变成了红黑色。
虽然在自己的第一场米兰德比中，因扎吉就取得进球，但是在对阵切沃时因扎吉在一次争抢头球时与切沃门将卢帕特利相撞，这便让他远离赛场长达四个月之久。
2002到2003赛季，因扎吉在欧冠的赛C米兰4比0大胜拉科鲁尼亚的比赛中，因扎吉在上演了帽子戏法后至此超越了阿尔托贝利成为了在欧战进球最多的意大利球员。欧冠决赛，AC米兰点球击败尤文图斯，即将30岁的因扎吉在老特拉福德第一次站上了欧洲之巅。随后因扎吉捧起意大利超级杯又在欧洲杯预选赛对阵威尔士的比赛中上演了自己在国家队的第一个也是唯一一个帽子戏法，此时的他风光无限。
