郑家内弱台湾统一
收复台湾
郑成功收复台湾后，在台湾设一府二县，以赤嵌城为承天府，总曰东都，以杨朝栋为首任承天府尹，设天兴和万年二县，首任知县分别为祝敬、庄子列。此时的台湾土壤肥沃但未开辟，而带来的将士又多，可谓“食之者众，作之者寡”。考虑到台湾的现实，郑成功决定行屯兵之法，兵农合一。除却勇卫、侍卫两个旅外，其余部队赴台湾南北垦荒，三年之后定赋税。即使只有少量部队，郑成功治军也以严厉著称，诸将畏惧。有人建议台湾新立，应该用宽松的法律。郑成功说，这样不行，法贵在严，这样才能长久无积弊，后来守成者，治理才更容易。同是1662年，清人以外通郑成功之罪，杀郑芝龙及其眷属等十一人斩杀，其余家属流放东北宁古塔。郑成功听闻消息，嚎啕痛哭，下令全军将士为父守丧。与此同时，清军因攻克郑成功困难，却卑劣的采纳郑军叛将黄梧建议，挖掘郑成功祖坟以泄地脉，将郑氏先祖骨抛露于野，郑成功为自己的不能为父尽孝而痛苦，也为自己不能守祖宗仙骨而痛心疾首，心中郁闷，偶感风寒，得病。
儿子郑经与乳母的桃色丑闻
与此同时，一个丑闻让病中的郑成功悲愤难忍。郑成功一生有十个儿子，其中大儿子叫郑经，时年19岁，没想到他与四弟乳母陈氏私通，生下一个儿子，还派人前往台湾报喜，说是侍妾所生。郑成功未满四十而获孙子，甚为高兴，当即赏赐金银布帛无数。然而谎言很快被戳穿，郑成功不禁又羞又愤，当即作出杀妻斩子、除灭淫妇的决定。郑成功兄长郑泰及部将等人接到令箭后，思虑成功已病，未来情况未明，如果全部执行命令，未来有可能惹来杀身之祸，最后，诸人建议只将乳母陈氏及所生儿子杀掉了事。郑成功接报，一定要以治家不严之罪将妻子董氏斩首，长子郑经更是不能宽恕，并解下随身所佩宝剑交给使者，带往金厦，严令执行。然而郑泰、黄廷、洪旭、郑经等人仍然不为所动，郑成功闻讯急火攻心，病情恶化。
泉州郑成功墓
1662年6月23日，郑成功与世长辞，年仅39岁。1624年荷兰控制了整个台湾，这年郑成功；1662年荷兰败退，台湾收复，他很快病逝而。因此有人评价说，郑成功是为台湾而生，为台湾而死。郑成功当此明王清兴，国破家亡之际，希以一人之力挽狂澜于既倒，反对先师先父不忠于明，要做有始有终的有明一代的忠孝之子，忠孝之臣。然而，他欲忠孝，结果忠孝不能两全，忠于明，不孝于父，其父被杀，其亦有份。忠于明，甘做孤臣孽子，以台湾为基，成就抗荷收复台湾壮举，可谓失之西隅，收之东隅。郑经丑闻，让郑成功痛感教子无方，令部下杀妻斩子，以正忠孝。郑成功一身可谓毛病众多，但他真正实现了其所期望的有生之年，做明朝忠孝臣子。至于他死之后，天下兴亡，郑家忠义，只看郑家造化。
郑成功死后，在台众将扶力其弟郑袭为继任者。而在厦门，郑经以郑成功之子袭位，一看他叔叔为东都台湾之主，力主兴兵。经过几次战役后，直到1662年冬十月（农历），郑经到达台湾继承其父所有权力，其叔郑袭退位。
郑经继位，继续保持郑成功的战略和实力（剧照）
郑经继位后，基本按照郑成功的策略分配诸镇垦荒，寓兵于农的政策，仿明旧制，设六部，改东都为东宁，*天升**兴、万年二县为州，与西班牙、英国、日本做贸易，贿赂清军将领进行沿海*私走**。在其治理下，台湾经济逐渐发展。与此同时，郑经也时刻关注大陆清军的动向，除了防止被清军攻打外，参与的大陆大事主要有两件：
一是在郑经继位初期。清廷派靖南王耿继茂、福建总督李率泰遣人前往台湾招抚。郑经提出，希望仿照朝鲜事例，以属国的方式与清廷进行朝贡贸易。康熙帝指出：“朝鲜系从来所有之外国，郑经乃中国之人。”清廷和郑经谈不拢，之后清廷多次招抚， 郑经表示，如果清廷仍让我削发、登岸，我将虽死不允。而后清廷屡再招抚，并多次同意，郑家从此不必登岸，不必剃发，不必易衣冠。称臣纳贡可也，不称臣，不纳贡亦可也。以台湾为箕子之朝鲜，为徐福之日本，以属国待之，不过最终都没有实现。
二是，康熙平三藩时期。三藩是指清朝初期投降清的三位明军大将， 即平西王吴三桂、平南王尚可喜、靖南王耿精忠。康熙欲平三藩，三藩叛乱。三藩联合台湾的郑经，共同出兵攻清。郑军开始时形势一片喜人，曾一度将漳州攻陷。为了报复黄梧破坏郑家祖坟，郑经车裂黄梧、黄芳度的尸体，黄芳度留在漳州的族人都被处死。然而随着三藩被逐渐平定，郑家军节节败退，只得再次退守台湾。1681年去世，郑经时年40岁，死因是纵欲过度，痔疮暴胀，大肠紧闭，医治无效。
郑经终欲过度而死亡（剧照）
郑经死前，其长子郑克臧（庶出，即郑经与乳母所生的儿子）一直在负责监国，有“东宁贤主”之称，并娶大将陈永华女儿陈氏为妻。郑经一死，郑克臧照理继承郑经之位。然而在此之前，郑克臧的靠山岳父陈永华已去世。而郑克臧的弟弟郑克塽，时年十二岁，按郑经之命，娶大将冯锡范女儿为妻。在这权力转换之际，冯锡范出于私心考虑，散播郑克臧非郑经真血脉，联合郑经之弟郑聪等人共谋，说服郑成功之妻董国太（郑成功欲杀之的教子无方的妻子）发动了废掉郑克臧的监国职位的宫廷*变政**，而后杀之（一说自杀）。郑克臧妻陈氏已怀有身孕，也于绝食数日后上吊自杀。十二岁郑克塽继位，由岳父冯锡范辅政。
郑克塽通过宫廷*变政**继位，实际是傀儡
郑克塽年幼，冯锡范无治国理政之才，加之连续三年发生自然水旱灾害，粮食歉收，米价飞涨。又加之多年战争的消耗，台湾府库空虚，财政拮据，郑家在台湾加紧控制粮草，兵员，导致民心军心涣散。清廷认为，时机已到，1683年，康熙任命施琅为水师提督，攻伐台湾。郑军很快仗败，接连被攻克厦门、澎湖，台湾岌岌可危。郑克塽大会文武大臣，大家都认为澎湖已失，台湾无险可守。部分将领认为，可以率领余下部将前往吕宋（菲律宾）谋图再举。冯锡范、大将刘国轩等人皆认为不可。同时，施琅派人送来招降书，声明朝廷宽大的条件，并特别强调，施琅忠于朝廷绝对不报私仇，当年杀我家人的人已死，不仅士兵不杀，而且郑家人也不杀。于是，郑家率领台湾民众投降，中国终归一统。
施琅率领清军统一台湾
台湾统一后，郑克塽被封为“海澄公”，但有衔无职，被清廷长期软禁在北京。1707（康熙）年，37岁的郑克塽病逝于北京，爵位无袭，郑家后人重归普通人。