2003年随着罗纳尔迪尼奥登陆诺坎普球场，哈维被进一步激活。在2004到零五赛季初，犹如犹如节拍器作用一般的哈维用沉稳的中场调度给了攻击线上的小罗等人充分展示自我的空间。
2005年12月正在上升期的哈维在训练中遭受到了被视为球员健康的一号杀手—膝盖韧带撕裂，这个“杀手”的出现可能让哈维长达六个月无缘赛场，果然连续两个月他几乎每天很早就跟随理疗师徒步登山促进肌肉力量的恢复，但是最终哈维还是几乎错过了巴萨梦二队辉煌的2005到2006赛季。经过了5个月的治疗，哈维赶上了欧冠决赛和世界杯。正如西班牙国家队老帅阿拉贡内斯所说：“西班牙国家队离不开哈维”。小罗低迷引发了巴萨王朝坠落，哈维度过了巴萨毫无作为的2006至2007赛季。
直到瓜迪奥拉的到来，2008—2009赛季，巴萨迎来了最巅峰的赛季，在新任主教练瓜迪奥拉带领下，巴萨实现了该赛季的“大满贯”：西甲联赛冠军、西班牙国王杯冠军、西班牙超级杯冠军、欧洲冠军联赛冠军、欧洲超级杯冠军和世界俱乐部杯冠军。
高举奖杯的哈维
也正是从2008开始，西班牙足球蓬勃发展，而开启那个时代的标志性人物又是谁呢？是阿拉贡美斯？他开创了斗牛士军团统治集团的全新战术。是瓜迪奥拉？他让巴塞罗那足球革命的影响力向整个欧洲传递并且达到了前无古人的高度，这场西班牙足球革命的核心代名词就是传控，而传控的最佳代言人就是哈维。
从2008到2012年，一个最好的哈维在一个几乎完美的巴塞罗那达到了个人职业生涯的巅峰。
2009年8月5月2日，哈维在伯纳乌上演助攻大四喜帮助巴萨客场6:2击沉银河战舰。2010至2011赛季在诺坎普的国家德比，伊涅斯塔的直传，哈维洞穿卡西防守的皇马球门，引领了又一场巴萨5:0对皇马的血洗。同样是那个赛季的欧冠决赛哈维在红魔紧密的防线中找到一条缝隙助攻佩德罗破门得分。无论是何种对手，哈维总能洞悉球场，送出致命的助攻，足球界的“最强大脑”名副其实！
