6月1日上午，2023中国青少年足球联赛女子初、高中年龄段U16组第二阶段在山东潍坊和江苏苏州开赛。从第一阶段晋级的24支球队，通过分档抽签后，分为4个小组展开角逐，每个小组6支球队，进行单循环赛，各小组积分前四名共16支球队将晋级第三阶段比赛。
山东潍坊赛区承办本次比赛的A、B组，A组首日比赛进行得非常胶着。在第一阶段中排名小组第一，以全胜战绩晋级的广东足协二队U16女足，0-0战平在第一阶段排名小组第三晋级的留坝县中学U16女足。另外两场比赛虽然分出胜负，差距也只有一球，成都棠湖中学U16女足3-2战胜重庆十八中U16女足，保定金瑞U16女足同样以3-2战胜河北青年U16女足。
B组三场比赛全部分出胜负。深圳U16女足1-3负于广东足协一队U16女足，杭州体育场U16女足5-2战胜武汉U16女足、山东精花U16女足5-1战胜福建U16女足。
江苏苏州赛区承办C、D两个小组的比赛。C组首轮上海U16女足、辽宁U16女足和北京U16女足都赢下比赛。第一阶段排名小组第一的海南琼中U16女足首轮没有展现出在小组赛中的状态，遭遇失利。
D组首轮的比赛是4个小组中平局最多的。3场比赛有2场踢成平局，共打进5个进球。进入第二阶段之后，D组各队之间的实力也更为接近。
从6月2日到6月8日，中青赛女子U16组第二阶段还将展开剩余4轮赛事。最终将有16支球队晋级到第三阶段的比赛。