1993年12月10日，上海申花俱乐部挂牌成立，徐根宝是申花俱乐部的首任主教练。首届甲A联赛于1994年拉开大幕，从此中国足球迎来巨大变化。在1995年，徐根宝率朝气十足的上海申花夺得了甲A联赛冠军，1995年是上海申花的丰收年，球队夺得甲A冠军，阵中的范志毅拿到甲A金靴并当选中国足球先生，徐根宝则当选这个赛季甲A最佳主帅。在执教上海申花期间，徐根宝带出了谢晖、祁宏、吴承瑛、申思等多位后来的国脚。
除了执教上海申花，徐根宝还参与创建了上海有线02足球俱乐部，当年由杨礼敏、任彬前往全国各地选材。上海有线02足球俱乐部成立的目的是培养1981、1982年出生的球员，长期目标是为2002年世界杯培养足球人才。最终，这家俱乐部培养出了杜威、孙祥、孙吉、于涛等多位日后活跃在甲A、中超赛场的球员，而且也确实为2002年世界杯培养了一位国脚：杜威。2002年，上海有线02俱乐部并入了上海申花俱乐部。
此外，徐根宝还在上海崇明岛创办了根宝足球基地。“十年磨一剑”，徐根宝当时想要缔造中国的曼联。在弗格森打造的曼联王朝中，以吉格斯、贝克汉姆、斯科尔斯、巴特、内维尔兄弟组成的92班黄金一代令球迷津津乐道，当年弗格森大胆地将这些年轻人提拔到了一线队，并委以重用，最终收获巨大回报。
经过徐根宝的多年耕耘，从根宝足球基地走出了武磊、张琳芃、颜骏凌、蔡慧康、姜至鹏、王燊超、顾超等众多国脚。
徐根宝的弟子：王燊超、武磊、范志毅、颜骏凌、张琳芃、姜至鹏
其中，武磊是徐根宝最得意的弟子。
没有徐根宝，武磊不会拥有今天的光环，甚至难以成为职业球员。提起这位人生导师，武磊曾反复说的一句话是：“给了我很多机会，对我要踢球这件事，有时觉得他比我还要坚持。”
刚到崇明岛时，武磊个子小，并不被人看好。但徐根宝却坚信这是好苗子，时刻关注他成长的每一步，比赛训练生活，都安排得很细。在徐根宝的教导下，武磊相较其他球员，更像个单纯的大男孩。
杜威成名时，武磊还是个孩子
对于看着长大的得意弟子武磊，徐根宝寄予了厚望。在中超2017年颁奖典礼上，徐根宝为武磊颁发中超最佳本土射手奖。
在肯定弟子连续第五次成为中超本土最佳射手很不容易后，徐根宝希望武磊能接受大家的批评，当时徐根宝说的话，很多球迷可能还记忆犹新：
“面对现在很多的批评，你应该接受，应该自己反省为什么国家队一些球进不了。我相信你门前是很清楚的，是得分手。希望你下届世界杯为我们国家队出力，为冲出亚洲走向世界出力！”
在武磊成为首位攻破巴萨球门的中国球员时，即将年满76周岁的徐根宝，正带着根宝足球基地的少年球员在法国海外省留尼汪岛进行集训拉练。
徐根宝给弟子发去了贺电：“武磊：祝贺你为中国足球在最低迷之时添加了一点光彩！基地过去的和现在的足球人为你而骄傲与激励。我们在法国留尼汪集训，已经正式请可可团队来当青训总监，这样我可轻松点。戒骄戒躁继续努力！”
中国足球，需要更多的徐根宝，更多的武磊。
