北京时间3月29日上午，中国足协在北京召开新闻发布会，公布了2023赛季各级职业联赛准入名单。其中，陕西长安竞技没能获得准入资格。同日，陕西长安竞技官方宣布球队在成立7周年的前一天解散。
2016年3月30日，球队成立。同年，陕西长安竞技参加了陕西省足球协会超级联赛，并夺得冠军，从而晋级中国足协业余联赛西北大区赛。2016年10月，在呼和浩特举办的2016年中国足协业余联赛西北大区赛中，陕西长安竞技4战全胜晋级全国总决赛。全国总决赛上，陕西长安竞技一路披荆斩棘，在最后的决赛中，他们在点球大战中6-5战胜吉林百嘉取得了进入2017年中乙的门票。
2017年3月，陕西水务集团秦之泉饮品有限公司冠名球队，2017赛季开始以陕西大秦之水队参加2017中乙联赛。在十三运男子足球城市组别的比赛中，陕西大秦之水代表西安历史性的夺得了冠军。同年的中乙联赛中，陕西大秦之水12胜7平5负位列第七。
2018年的中乙联赛，陕西长安竞技18胜4平9负位列第三，得到了和中甲倒数第三的升降级附加赛的机会。在附加赛中，陕西长安竞技两回合2-3不敌梅县铁汉生态，但由于中甲延边富德解散，陕西长安竞技递补升级。
2019年中甲联赛中，球队频繁换帅，最终取得13胜5平12负的成绩，排名中甲第九。2020年，陕西长安竞技5胜6平4负位列第十。2021年，陕西长安竞技17胜11平6负位列第六。2021年9月9日，陕西省水务集团和陕西长安竞技足球俱乐部召开发布会，宣布战略控股。
2022赛季，计划冲超的陕西长安竞技大规模招兵买马。然而突发意外，球队股改不了了之，随后便陷入了严重的财政困难，王宝山和一众球员中途离队，球队也被罚6分，最终仍拿到第六名。
2023年年初，球队为了生存，俱乐部发起了会员制筹款。3月29日由于无法解决清欠问题，陕西长安竞技未能获得中甲联赛的准入资格，同日，球队宣布解散。
