2006年世界棒球经典赛的决赛于2006年3月20日在圣迭戈教士的主场培可球场（Petco Park）举行。这场决赛是 继日本击败韩国和古巴击败多米尼加的半决赛之后，在这座球场举行的第三场比赛 。
这场决赛于下午3点40分开始， 当天有接近43,000名观众来到了现场观赛 。培可球场 以投手公园而闻名 ，因为海边的气候和风速可能导致大量三振出局和故意保送。这一天，在有风的环境中，温度为14°C，风速为10英里每小时。
日本队将他们的先发投手从击败了韩国队的上原浩治（Koji Uehara）更换成了螺旋球（Gyroball）的先驱之一， 拥有多样化的*器武**库的松坂大辅（Daisuke Matsuzaka） 。培可球场鲜明的对投手友好的特点被证明对松坂大埔更加有利， 并反过来使古巴因其强力的击球风格而难以在这座球场展开攻势 。
前四局，松坂大辅强势夺下五次三振 ；为日本队在进攻端扩大领先优势提供了机会。第五局，铃木一朗（Ichiro Suzuki） 击出一支二垒安打再添两分，帮助日本队以6比1的比分领先结束前五局的比赛 。可是在松坂大辅下场后，古巴队便开始了咄咄逼人的反击攻势给予回应。
尤利-古里埃尔（Yuli Gurriel）的一垒安打标志着古巴队的*攻反**号角的开始；不久之后，在第六局中，阿里埃尔-博雷罗（Ariel Borrero）通过一支安打上垒。 随后登场击球的奥斯马尼-乌鲁蒂亚（Osmani Urrutia）一棒成功送回了在垒上的古里埃尔和博雷罗，将日本队的领先优势从五分缩紧到三分 。第七局波澜不惊，两队的投手都各自完成了任务。到了八局下半，弗雷德里希-塞佩达（Frederich Cepeda） 击出一支两分炮让日本队的领先优势仅剩下一分 。
随后日本队调整了击球策略， 不去一味的追求本垒打和得分，而是通过扎实的击球实现打击串联 。而铃木一朗则是最能体现日本队小球策略的代表， 他通过一支飞向右外场的安打送回了川崎宗纪（Munenori Kawasaki），将比分扩大至7比5 。
随后日本队不断击出安打上垒，以至于 比赛进行到九局上半时比分已经来到了10比5 。势头被彻底抑制住的古巴队在九局下半只追回了一分， 全场比赛的比分最终被定格在了10比6，日本队拿下了冠军 。松坂大辅则因为他在比赛开始时为日本队定下的基调和出色的表现最终成功当选该届世界棒球经典赛最有价值的球员。
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