这种情况是不能按特殊工种办理退休的。
因为该提问者从事特殊工种的年限只有三年的年限，显然是未达到特殊工种退休所规定的年限。
参保者按特殊工种退休的首要条件，就是必须满足从事特殊工种种类所规定的累计工作年限，才能按特殊工种办理退休。
例如：
从事有毒有害特殊工种的年限，必须累计8年或8年以上，才能按有毒有害特殊工种办理退休。
从事井下或高温作业的特殊工种年限，必须累计9年或9年以上，才能按特殊工种办理退休。
从事高空作业和特别繁重体力劳动的特殊工种年限，必须是累计10年或10年以上，才能按特殊工种办理退休。
而我们标题中的提问者，虽然档案中记载的工种一直是特殊工种，但该提问者实际从事特殊工种的年限，只有三年，且该提问者在从事特殊工种三年以后，一直未上班未实际从事特殊工种工作。
所以该提问者不能按特殊工种办理退休。
对于特殊工种提前退休的审批，国家的要求是很严格的。
因为特殊工种不仅可以提前5年退休，有的地方的特殊工种，还会给特殊工种的参保者多折算工龄。
所以如果出现不符合特殊工种办理退休标准的参保者，按特殊工种提前办理了退休。
那这种行为，不仅侵害了广大参保者的利益，还侵害了国家社保基金的利益，所以国家才会对特殊工种提前办理退休，要求的极其严格。
那有参保者问：
灵活就业人员可以从事特殊工种吗？可以按特殊工种办理退休吗？
按照国家的规定，灵活就业人员是不可以从事特殊工种的。
因为劳动者所从事的工种，是否属于特殊工种，是要经过国家劳动部，也就是现在的人力资源和社会保障部进行审批认定后，才能被认定为特殊工种，同时从事特殊工种的劳动者，还必须具有从事特殊工种的资格证书，才能从事特殊工种。
而对于灵活就业的劳动者，所在的用人单位，基本都是小型的私人企业居多，而这些小型的私人企业及私人企业的劳动者，都不具备上述的两个认定条件。
所以也就无法从事特殊工种
另外从事特殊工种的劳动者，是必须有档案的，因为劳动者从事特殊工种时，是必须在社保局和本人档案中进行备案后，才能从事特殊工种工作。
而灵活就业的劳动者，所在的小型私企，都没有建立档案和管理档案的资质，且多数的小型私人企业，都不给参保者缴纳社保费，所以也无法为劳动者在社保局和劳动者的档案中进行备案。
所以灵活就业的劳动者，即使从事的确实是特殊工种4，但由于劳动者没有档案，不能在档案中给劳动者进行备案，所以灵活就业的劳动者，在办理退休时，也就无法认定所从事的特殊工种和特殊工种年限。
因此，灵活就业的劳动者，虽然也有从事特殊工种的劳动者，但由于无法认定。
所以也就无法按特殊工种办理退休，更无法享受特殊工种办理退休所应该应该享受的特殊工种待遇。
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