治疗慢性乙型肝炎的根本措施在于抗病毒治疗，防止或延缓肝硬化及肝癌的发生。干扰素具有抗病毒及免疫调节的双重作用机制，是目前抗病毒药物之一。但是用干扰素会出现不同程度的不良反应，在打干扰素之前要有个心理准备，不然会影响治疗疗效。
1.流感样症状：是最常见的不良反应之一。一般出现在首次注射，患者会出现发热，寒战，肌肉酸痛，心率加快，疲乏等症状。最为常见的是发烧，体温在38.0-39.5℃之间，一般在给药后的12小时内，大部分人都可以耐受得了，随着用药的继续，这个症状会逐渐减轻缓解。若体温不超过39℃，可物理降温，不予药物处理。必要时可以采取药物治疗，在注射前半小时或一小时或在注射时服用解热镇痛药。少数不能耐受的患者也可以选择在周末或晚上睡前注射，这样可以增加休息时间，会自觉症状轻点。
2.胃肠道反应：表现为食欲不振，恶心呕吐，腹泻等。胃肠道反应可以随着治疗的进行会逐步缓解，一般不需要特殊治疗。饮食宜低脂低盐，清淡可口易于消化，含适量蛋白质、糖及足够热量，使机体保持营养平衡。
3.皮肤反应：早期皮肤反应表现为躯干和四肢出现弥漫性红斑，瘙痒，温水洗浴，忌用皂液洗浴，避免抓挠，防止皮肤感染，严重时可以服用抗过敏药物。晚期皮肤反应表现为脱发，一般在治疗期间的1-3个月时发生，停药1个月后毛发可以再生，做好患者的心理护理，消除其紧张情绪。
4.神经系统损害：使用干扰素治疗导致的神经系统损害可以表现为抑郁、忧虑、狂躁等，一般出现在一些易感人群。如本身有家族史或精神病史的患者就不宜使用本品。使用后一旦出现严重的精神问题如抑郁，焦虑或有自杀倾向，应立即停药。寻求医生的帮助。
5.血液系统损害：绝大多数是一过性的骨髓抑制，主要表现为血小板和外周血白细胞( 中性粒细胞)的减少，是可逆性的。当中性粒细胞减少到0.75*109 /L 时，应及时减量，减少到0.5*109 /L 以时，或血小板计数≤30*109 /L，外周血白细胞总数≤1.0*109 /L，时应停药。
干扰素的应用很难避免不良反应的发生，只要处理得当，患者基本可以完成抗病毒治疗。所以，用药需要遵医嘱。