国家卫健委与国家中医药管理局联合发布《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第七版）》及《新型冠状病毒肺炎轻型、普通型病例管理规范》，两个国家级方案中均推荐连花清瘟胶囊、颗粒用于医学观察期临床表现为乏力伴发热的治疗。广州、山东、武汉、陕西、河北、黑龙江、浙江、辽宁、海南等二十个省市发布的新冠肺炎防治方案中，也都对连花清瘟胶囊、颗粒进行推荐。
连花清瘟在药名中即有一个“瘟”字，它的研发源于当年的SARS，所以在连花清瘟颗粒的说明书中即有抑制SARS病毒的作用。不论是SARS，还是当下发生的新冠肺炎，都属于“瘟疫”，都具有流行性与传染性的特点。那么连花清瘟治疗“瘟疫”是如何发挥作用的呢？
首先连花清瘟汇聚了汉代张仲景《伤寒论》治瘟疫的“麻杏石甘汤”，明代吴又可《温疫论》治疗“瘟疫”用大黄的经验，清代吴鞠通《温病条辨》治温病的银翘散，将三朝名方汇成一药，同时结合现代科学研究发现的抗病毒、抗炎、止咳、化痰、增强免疫的有效中药研制而成。
麻杏石甘汤首见于伤寒论第63条:“发汗后不可更行桂枝汤。汗出而喘无大热者,可与麻黄杏仁甘草石膏汤。”为解表剂，具有辛凉宣泄，清肺平喘之功效。主治外感风邪，邪热壅肺证。身热不解，咳逆气急，鼻煽，口渴，有汗或无汗，舌苔薄白或黄，脉滑而数者。临床常用于治疗感冒、上呼吸道感染、急性支气管炎、肺炎、支气管哮喘、麻疹合并肺炎等属表证未尽，热邪壅肺者。
银翘散，辛凉透表，清热解毒。用于风热感冒，发热头痛，口干咳嗽，咽喉疼痛，小便短赤。
银翘散的药理作用 《中医杂志》1986（3）：59，1.解热：在大鼠实验性体温增高时，分别给予银翘散袋泡剂和片剂，动物体温得以下降，尤其以袋泡剂作用明显。2.抗炎：银翘散袋泡剂对不同原因所致之炎症均有显着性的抗炎作用，而片剂与煎剂对某些炎症作用甚弱或无作用。3.抗过敏：对天花粉所致大、小鼠被动皮肤过敏反应、速发型超敏反应均有明显抑制作用，降低过敏性休克死亡率。4.促进免疫功能：在不增加免疫器官重量的情况下，袋泡剂能明显促进小鼠腹腔巨噬细胞吞噬能力。上述作用，无疑是临床应用银翘散治疗外感热病的重要药理学基础。
连花清瘟处方中应用麻杏石甘汤与银翘散之外，方中还采用通便泄热的大黄，热毒袭肺引起患者发热喘促气短，大黄通肺泄热，肺与大肠相表里，让“疫毒”从大便排出，使邪有出路；使用大黄另一价值是先证用药，截断病势。明代吴又可曾指出：瘟疫治疗宜在人体正气未衰之时，及早攻逐邪气，提前应用通便的大黄，可以截断病情向危重传变。本次新冠肺炎有些患者大便溏薄，这是瘟邪秽浊聚集在肠道，并不妨碍应用大黄逐邪外出，这也正是中医通因通用之法。而且，现代药效研究证实大黄具有抑制肺部炎症，改善肺功能作用。
连花清瘟中还有关键的一味药是红景天，它生长在高寒、高海拔地区，具有补肺平喘活血作用，可以提高人体抗疲劳、耐缺氧能力，以应对新冠肺炎患者普遍表现的乏力、气短、血氧含量低造成的多脏器损害。同时红景天的增强免疫作用可以改善患者淋巴细胞及亚群偏低造成的机体抗病能力下降，提高机体的抗病康复能力。
2月18日，在广东省政府召开的疫情防控发布会上，钟南山院士团队广州医科大学呼吸疾病国家重点实验室杨子峰教授指出，针对连花清瘟抗新型冠状病毒及抗炎活性展开了细胞模型研究，发现连花清瘟对常见冠状病毒（HCoV-229E）和新型冠状病毒（COVID-19）感染引起细胞病变具有良好的抑制作用。此外，连花清瘟对HCoV-229E和COVID-19感染细胞引起的TNF-α、IL-6、CCL2/MCP-1和CXCL-10/IP-10炎症因子表达显示出抑制作用。连花清瘟在细胞水平对新型冠状病毒显示出抗病毒与抗炎效果，为新型冠状病毒感染的治疗带来了希望。中药的疗效只有获得现代科学研究的证据，才能得到医学界的认可。2月18日，在广东省政府召开的疫情防控发布会上，钟南山院士团队广州医科大学呼吸疾病国家重点实验室研究表明，连花清瘟在细胞水平对新型冠状病毒显示出抗病毒与抗炎效果。
广东省中医院等全国13家三甲医院参与的临床循证医学研究表明，连花清瘟在改善病毒性肺炎患者发热、咳嗽、咳痰、胸痛、肌肉酸痛、呼吸困难等临床症状方面显示出良好疗效。中国中医科学院、广州呼吸病国家重点实验室等机构也通过实验表明，连花清瘟对甲型H1N1、H3N2、H9N2、H7N9，乙型流感病毒等均有抑制作用。
只要症候群相同，不论是新冠肺炎，还是流感、普通感冒，都可以使用连花清瘟进行治疗，这也正是中药治疗疾病的特点。
