虽然扁桃体切除，是一个比较常见的手术，熟练的专家10多分钟就能完成手术，笔者最快的扁桃体切除1分多钟就完成了。但任何一个知名的专家追求的并不是手术时间，而是追求通过精细的操作达到最微创，同时预防和减少并发症。如今医生的水平提高，设备也极大的改善，严重的并发症已十分罕见。但任何手术均面临出现并发症的可能性，扁桃体切除也不例外，其最常见的并发症主要有：
1、出血：目前低温等离子切除扁桃体，边切除边止血，手术中可达到不出血，但仍有极少部分患者扁桃体术后出血。出血有两个高峰时期，术后24小时内发生者为原发性出血，最常见的原因有术中止血不彻底、术后咽部活动过多，如咳嗽、频繁吞咽等。继发性出血常发生于术后5-7天白膜开始脱落时，由于进食不慎擦伤创面而出血。这也是扁桃体切除术后再次急诊入院的最常见原因。
处理:将口内唾液吐出，不要咽下，唾液中混有少量血丝时，不必担心，如持续口吐鲜血，应检查伤口，考虑止血。全麻手术后儿童出现连续的吞咽动作时，有伤口出血的可能，应叫医生检查咽部情况，若发现出血以便及时止血。若发现出血，应保持冷静，吐出血凝块及血液，保持呼吸道通畅，颈部冷敷（冰敷），局部压迫，及时找医生处理。
医生常常会先查明出血部位，清除血凝块，可能用棉球蘸3%双氧水含漱或1/万肾上腺素冰盐水，用血管钳钳夹好后局部压迫扁桃体窝创面收缩血管，或直接用血管亲钳夹带线的纱布球压迫扁桃体创面止血10-15分钟，或用止血粉、可吸收明胶海绵等贴附于出血处，再用带线纱布球压迫止血。若有可见的活动性出血点，医生可能会使用电凝止血或结扎/缝扎止血。弥漫性渗血，纱球压迫不能止血时，医生可能会用消毒纱球填压在扁桃体窝内，将腭舌弓与腭咽弓缝合，纱球留置1-2天。若失血过多，医生还可能会补液、输血等。由于扁桃体出血可以很轻微，也可能很严重，甚至危及生命。处理好了，病情随之好转。所以，如果操作在局麻下进行，患者及家属需要全力配合，如果配合不好或者局麻下处理风险较大，还可能需要全麻插管后处理，甚至在为了保证生命安全时，选择行气管切开。
2、疼痛：这是术后最常出现的，试想平时舌头或口腔上一点溃疡都疼痛难忍，扁桃体切除后，咽部两个“大溃疡”，肯定会有一些疼痛。但笔者体会，小孩术后疼痛较轻微，成人疼痛往往更为明显。
处理：医生根据病情可使用一些止痛药或术后使用镇痛泵。
3、伤口感染：手术后3天内可有发热现象，可能由于扁桃体手术创面使细菌毒素扩散，一般不超过38.5°C。3天后体温突然升高或术后体温一直持续在38.5℃以上，检查如果见软愕和腭弓肿胀，创面不生长白膜，或白膜污秽、厚薄不匀。患者咽痛加重、张口困难，同侧耳内反射性疼痛，下领角处淋巴结肿胀和触痛，提示局部有感染情况，医生会使用抗生素及补液对症治疗。
4、肺部并发症：手术中如有血液、分泌物或异物被吸入下呼吸道，可引起吸入性肺炎、肺脓肿、肺不张等。经肺部检查检查证实有肺部病变时，除选用足量抗生素治疗外，必要时可行支气管镜检查，吸除血液及异物（目前手术多选择全麻插管下进行，肺部并发症罕见）。
5、嘴唇、口角皮肤黏膜破损：由于小孩口较小，开口器或手术器械可能损伤嘴唇、口角皮肤或黏膜，但一般愈合快，不须过分紧张，注意防止感染即可。
6、牙齿松动或脱落：儿童如果处于换牙期，有可能出现这个并发症，应注意防止牙齿落入下呼吸道。
7、恶心、呕吐、干燥和其他一些全麻后的并发症：大部分会自愈或改善，医生根据情况做对症处理，不必太过紧张。
总之，扁桃体手术虽然也可能出现一些并发症，但总体来讲，并发症出现的概率极低，只要积极配合医生处理，一般还是很安全的。