抗病毒治疗是长期的过程，艾滋病病毒感染者在服用药物过程可能出现多种不良反应，其中 胃肠道症状 是最常见的不良反应。感染者在治疗开始后的几周内可能较严重，之后逐渐好转。它虽然不是特别严重的问题，但会影响感染者抗病毒治疗依从性，应及时予以相应处理。
胃肠道反应最常见的症状是恶心、呕吐和腹泻。
不同的症状涉及的药物和处理方法略有不同：
恶心和呕吐
可能引起的抗病毒治疗药物： 绝大多数抗病毒药物都可能引起，首先应该考虑齐多夫定（AZT）。
推荐处理方法：
1. 给予抗呕吐剂和充足的水分。
2. 给予抑酸药或 H₂受体拮抗剂。
3. 少食多餐。
4. 避免高脂肪、过辣或过甜的食物，以及奶制品。
5. 清汤、淡茶、未经深加工的米可能有益处。
腹泻
可能引起的抗病毒治疗药物： 最可能是洛匹那韦/利托那韦（LPV/r）引起。
推荐处理方法：
1. 维持水、电解质平衡：比如适当食用可乐、咸饼干、运动饮料或自制电解质溶液（包括柠檬水、苹果水等）。
2. 选择易消化的食物：比如米 粥、燕麦粥等。
3. 一次只摄入少量食物：遵循少食多餐的原则。
4. 避免难消化的食物，尤其 是高脂肪、高糖食物。
5. 适当食用果胶、口服谷氨酰胺。
如果症状严重，应及时就医进行评估，若明确不良反应是因为某一种药物导致的，需在医生指导下进行药物替换和方案调整。