通常情况下，番茄茎基部出现“黑秆子”是由茎基腐病、疫霉根腐病这两种病害引起的。
一、番茄茎基腐病
1、症状
也称大苗立枯病，该病的识别关键点是茎基部病斑绕茎一周，缢缩，后期可见淡褐色蛛丝状霉，植株逐渐枯萎而死。主要为害大苗或定植后番茄的茎基部或地下主侧根，病部初呈暗褐色，后绕茎基或根茎扩展，致皮层腐烂，地上部叶片变黄，果实膨大后因养分供不应求逐渐萎蔫枯死。后期，病部表面常形成黑褐色大小不一的菌核。
2、发病规律
由真菌引起的病害。病菌在土壤中越冬，腐生性强，可以在土中生存2-3年，大水漫灌且遇到地温过高最易发病。
3、防治方法
在定植时或定植后和发病初期用25%嘧菌酯（阿米西达）+1500倍液+2.5%咯菌腈（适乐时）1000倍液+嘉美红利1000倍液淋根灌根，l地上部分同时进行喷雾，每5天用药1次。
二、番茄疫霉根腐病
1、症状
番茄疫霉根腐病多发生在茎基部。发病初期茎基部呈仿长条形水浸状的暗褐色病斑，病斑扩大后斑面凹陷，严重时病斑绕茎一周，地上部分逐渐枯死。茎基和根部纵剖面可见维管束变为深褐色。发病后期根茎腐烂，不发新根，使整株枯死。高温条件下病部产生白色棉絮状稀疏的霉状物。
2、发病规律
该病为真菌性病害，病原菌在病残体上过冬，借灌溉水和雨水传播。高温、高湿、地温低、易发病。棚室栽培碰上连阴雨或大水漫灌后，棚内湿度过大，若不及时通风排湿，易诱发病害并流行。
3、防治方法
施足基肥，增施有机活化营养肥；平整土地；适量浇水；防止长期沤根。定植后做好棚室内温度湿度及地温管理，湿度大时放风排湿，地温低时松土提温。夏季覆膜要在缓苗后适当晚盖，避免土温过高，湿度过大。出现中心发病株要及时拔除。
来源：菜农之家联合社