NREM睡眠觉醒障碍的治疗包括推荐所用患者使用的行为策略和预防性策略，还包括通常仅用于更严重且有损伤倾向的患者的药物治疗。关于成人觉醒障碍的前瞻性研究很少且无相关临床试验，相关推荐主要基于临床经验、病例报告和病例系列研究。
对于存在基础OSA或RLS的患者，这些基础疾病可能是NREM异态睡眠的诱因，应予以相应治疗。
行为策略和预防性策略的目的是减少或消除引发因素和促进因素，并为患者及其身边的人创建安全环境。针对可导致发作频率增加的因素进行安慰和教育非常关键，包括：
●避免睡眠剥夺、饮酒或使用觉醒障碍相关药物，尤其是唑吡坦等非苯二氮卓类苯二氮卓受体激动剂。
●维持连续且规律的睡眠-觉醒周期，部分患者应避免轮班工作。
应尽量减少睡眠环境的改变，并保持卧室的安全以免受伤。根据发作事件的频率和严重程度，可能有必要对环境进行不同的调整，如：
●对附近的家具和在床边地板上使用垫子。
●降低床垫到地板的高度，或在多层住宅中将卧室设置在一楼。
●确保门窗锁住、卧室门安装警报和/或在楼梯顶设置障碍物。
●移除卧室中尖锐和危险的物品。如果家中存有枪支，则将其放在其他地方并上锁储存。
●对于SRED患者，受欢迎的食物应放在厨房之外。可能需要对冰箱或厨房橱柜上锁。
应教育父母/照料者、床伴和身边人如何与发作中的患者安全互动，以免加剧激越、加重意识模糊或激发*力暴**的自我保护行为。这通常包括在确保安全的情况下让患者自由行走而身体不被束缚。观察者不应喊叫或尖叫以试图唤醒患者，更适当的做法是温柔地哄患者回到床上。
个别病例报告和观察性病例系列研究显示，针对失眠的认知行为治疗有效，尤其是引导意象、放松训练、催眠和正念减压疗法。预期唤醒(预定唤醒)是指在预计发作前不久将患者唤醒，该方法对儿童的觉醒混淆、睡惊和睡行有效。
一般不需要药物治疗。对于非药物治疗措施无效且存在频繁发作或伤害性发作的患者，苯二氮卓类药物，特别是氯硝西泮，研究最为充分。病例系列研究显示，低剂量氯硝西泮(睡前使用0.5-1mg)可使大多数患者不再出现睡行和睡惊。改善睡眠卫生的初始干预措施无效的睡行患者，褪黑激素也可能具有一定作用。
一些报道中显示有益的其他治疗方法包括：选择性5-羟色胺再摄取*制剂抑**治疗睡眠相关异常*行为性**或SRED，多巴胺受体激动剂治疗RLS相关的SRED。对于非RLS相关性SRED患者，新近数据(包括一项小型试验的结果)显示，托吡酯减少了进食症状和体重。然而，副作用(如认知功能障碍、感觉异常)相对常见。
预后
关于成人觉醒障碍的自然病程或治疗结局，目前仅有极少长期研究。个案报道显示，大多数患者可从教育、安慰和非药物治疗获益。
对于转至失眠专科的患者，在优化睡眠卫生、治疗同时存在的睡眠障碍、处理加重因素以及必要时给予药物治疗后，绝大多数患者的症状可得到控制或完全缓解。一项回顾性病例系列研究纳入了512例就诊于某睡眠障碍中心的NREM异态睡眠或异态睡眠重叠综合征成人患者，发现大约1/3的患者不需要接受药物治疗，13%的患者仅优化睡眠卫生后症状即得到改善(主要为存在觉醒混淆、睡行和睡惊的患者)。最常用的药物为苯二氮卓类，80%的患者效果很好。