新城疫野毒(强毒型)的发病率和死亡率都可高达100%，但是临床表现与病毒毒力、家禽种类及其易感性、环境因素、免疫状况关系密切，尤其是部分迁徙鸟类可以携带强毒但并不表现出临床症状。加上病毒变异等原因，目前可能见到的多为非典型的新城疫症状，单纯的非典型新城疫发病率和死亡率都不高，在蛋鸡上有的只表现为蛋壳异常、产蛋率下降等。能见到的出现一定死亡率的多是非典型新城疫与其它病原(大肠杆菌、支原体、球虫、H9型禽流感等)混合感染的病例。强毒型的高发病率和高死亡率的病例鲜有发生。
一、非典型新城疫发生的主要原因
变异毒珠不断出现，是导致非典型新城疫发生的主要原因。在实际养鸡过程中，鸡新城疫病毒在反复的高免疫抗体水平的压力下变异毒株不断出现。这也可能与我们所用疫苗、用苗方法等有一定关系。
有研究证实，目前的商品疫苗，也存在对新城疫野毒已经不能产生良好的保护作用的情况，有必要研制新型疫苗来控制新城疫的传播。
二、流行特点和表现症状
尽管目前对鸡新城疫采取了强制性免疫、扑杀、限用中等毒力疫苗(如I系活苗等)、生物安全措施保障等预防手段，但非典型新城疫还是成了鸡新城疫新的流行趋势。
发病时往往混合感染细菌和病毒， 比如大肠杆菌、支原体、H9型禽流感、传支等。 经过免疫的鸡群多发生在25-40日龄之间。主要表现为轻微的呼吸道症状，食欲减少，产蛋鸡主要出现产蛋率降低。2-3周后产蛋率恢复，但是沙皮蛋、软蛋等劣质蛋数量增多，种蛋孵化率降低。发病严重者有明显的呼吸道症状如呼吸困难、甩头、张口呼吸、绿色粪便增多等症状，与其他一些呼吸道疾病如传染性喉气管炎、传染性支气管炎、慢性呼吸道病等病的症状十分相似。低发病率和低死亡率是非典型新城疫的一个特点。发病率一般在10%-25%，死亡率在15%-35%，蛋鸡产蛋率下降30%左右。有的单纯性的非典型新城疫仅仅表现出轻微的不宜察觉的呼吸道症状或者拉稀现象，混合细菌或者其它病毒感染后，发病率和死亡率均有所提升。
解剖只见少数出现胃肠变化，有时只见肠道坏死溃疡，小肠淋巴滤泡凸起等，同小肠球虫混合感染时还容易误判，并不见腺胃乳头出血、盲肠扁桃体肿大出血等系列的典型新城疫症状。
三、防控措施
对于发生了新城疫的鸡群一定要用疫苗紧急接种免疫，并且辅以药物进行治疗，木易推荐的独败和囊瘟康的配合使用对于治疗新城疫有着很好的疗效，速安对于控制细菌的继发感染也有着可见的效果。