01 根管治疗中治疗器械超出根尖空损伤根尖周围的组织，造成组织水肿（根管预备后出现疼痛）
02 根管预备时将根管内的坏死组织和细菌推出了根尖孔，造成根尖的急性炎症（经常是换牙，虽然神经坏死了但是不用，医生治疗后才出现疼痛）
03 根管消毒时药物渗出根尖孔造成化学性根尖周炎（提示患者治疗中应该按时复诊）
04 处理牙髓的过程中根尖出血（一次性根管出现以上情况需要按照急性炎症处理，对牙齿做出适当的调磨，全身输液消炎，待炎症消除后再进行治疗，若是已经经过根管填充治疗的患者经过处理后就会逐渐好转）
05 遗漏有感染的根管，找到被遗漏的根管，然后进行根管填充治疗。
06 根管填充没打位的。需要重新做根管治疗。
07 根管填充时牙胶超出根尖孔会对根尖造成刺激。
08 慢性根尖周炎无法通过根管治疗完全消除。
（注：以上两项只能通过根尖手术将根尖的炎症去除）
09 根尖叉病无法通过根管填充解决问题。
10 牙周牙髓联合病变-逆行性牙髓炎。
（注：这两者需要进行牙周处理，降低咬合，若实在无法保留只能考虑拔除）
11 牙齿本身就有牙隐裂，虽然进行了根管治疗，但是无法解决换牙长时间咬合疼，需要尽早的进行冠修复，若是无法保留，需要尽早拔除。
12 由于患牙本身位置特殊，根管填充中器械容易超出根尖孔或是根尖糊剂超出根尖孔对下齿槽神经造成刺激。这时需要尽早使用营养神经药物、局部理疗、微波处理，一般会在三个月后逐渐好转。
13 周围其他牙齿问题，找到其他牙齿尽早治疗。
总而言之，根管治疗是个非常复杂的过程，治疗过程中难免会碰到难题，一旦出现疼痛或是肿胀，应该对医生有足够的自信，给医生足够的时间去处理。在一般情况下经过处理，牙齿都能修复，但是少数的情况下还是视情况考虑是否需要拔牙。