骨质疏松症是一种慢性疾病，其治疗是一个漫长的过程，在患者治疗期间应对如下情况进行监测：疗效，钙和维生素D的摄入是否充足，药物的不良反应，对治疗的依从性，新出现的共患病等。治疗骨质疏松的目的是提高骨强度，降低骨折风险。目前临床上还没有直接检测“骨强度”的工具，所以只能用替代指标，如骨密度，骨标志物及椎体影像学检查等。
1，治疗的依从性：目前，我国乃至于全世界的患者，甚至部分医务人员对骨质疏松的认知度低，坚持治疗的积极性不够，时间愈久，愈容易忽视，依从性愈低。所以依从性差是骨质疏松治疗中普遍存在的问题，提高依从性是治疗骨质疏松的慢性无症状疾病所面临的挑战。
提高治疗骨质疏松依从性需要有效的医患沟通，密切地监测，及早发现存在的问题。牢固树立有效治疗可降低骨折风险的信念，有利于患者维持患者良好的依从性；及时告知骨标志物和骨密度的改善情况，并解释可以降低骨折风险，鼓励患者坚持治疗。另外，应用简便的治疗方案，也有助于改善依从性，例如患者不爱服药或服药过多，则建议应用每年一次注射的唑来膦酸，提高依从性。
2，骨密度检测在疗效监测中的应用：临床上广泛使用DXA监测骨密度作为疗效判定的指标。连续测量骨密度已经成为临床实践中监测疗效的重要手段。美国国家骨质疏松基金会NOF和国际临床骨密度测量学会ISCD均推荐骨密度测量作为治疗的常规监测指标，NOF建议每两年一次；ISCD推荐启动治疗一年后进行；我国中华医学会骨质疏松和骨矿盐疾病分会推荐：药物首次治疗或改变治疗后半年，疗效稳定后1-2年重复骨密度测量，以监测疗效。
QCT,qQCT和QUS目前还不适用于疗效监测。
3，BTMs骨标志物在治疗监测中的应用：在抗骨质疏松药物治疗中，骨标志物的变化明显早于骨密度，用强效的抗骨吸收的药物时，骨标志物快速下降。而促骨形成药物如特立帕肽，早期的骨标志物升高预示着随后的骨密度升高。
4，脊椎影像学检查：患者身高缩短2cm以上，无论是急性还是渐进，均应进行脊椎影像学检查，以明确是否有新椎体骨折的发生。药物假期时，应重复进行椎体影像学检查，以明确有无新发椎体骨折。