染料渗漏法
染料渗漏法操作简单、价格便宜，是目前研究根管系统微渗漏体外实验中最常用的方法。亚甲基蓝作为最常用的染色剂具有价格低、易操作、易着色、相对分子量大小与细菌代谢产物相似的优点。但亚甲基蓝在透明牙法实验样本的脱矿和脱水过程中，少部分会溶解在试剂中，影响结果的准确性。印度墨水可以穿透0.22μm 的细菌过滤器，能够渗入到其它染料不能到达的位置，使测量结果更加准确。
染料渗透法的检测方法主要有：
（1）纵切片法：将牙齿沿长轴劈开，利用解剖显微镜观察染色深度；
（2）横切片法：将牙齿横断成2mm厚的连续切片，观察每个切片有无染料；
（3）透明技术法：对染色后的牙齿进行脱矿处理，在显微镜下观察染料渗透的距离，定量分析微渗漏情况，透明技术的优点是可以从三维的角度观察染料的渗透情况，减少由于切割造成的染料丢失，保持牙齿结构的完整性。
葡萄糖检测法
利用葡萄糖作为微渗漏的示踪物，其原理是葡萄糖在葡萄糖氧化酶作用下生成葡萄糖酸并产生过氧化氢，后者可以分解释放出初态氧，氧化色素原生成有色化合物，后者在波长500nm处有最大吸收峰，有色产物颜色的深浅与葡萄糖的浓度呈正比，通过直接检测根管内漏出葡萄糖的浓度评价根管系统的微渗漏情况。
不同于传统的染色法，葡萄糖氧化酶比色测定法可检测的最小浓度可达0.06mmol/L，是较为理想的标记物，同时相比较于染色法和放射性同位素标记示踪法，葡萄糖微渗漏模型是定量模型，具有更高的灵敏度和更少的干扰性，结果更加客观，准确度更高。
细菌检测法
厌氧链球菌、葡萄球菌、肠球菌、变异链球菌、乳酸杆菌以及放线菌等均可作为示踪菌，唾液中肠球菌和链球菌最常用，根尖储室中培养基发生浑浊即为微渗漏发生，以微渗漏发生所需天数作为评定指标。作为口腔正常菌丛的组成部分，利用细菌检测法所制得的模型与临床病理过程更为接近，相比于染料颗粒分子量大小不同所造成的实验误差，可以得到更为精确的结果。但所得结果较为单一，不同微生物法检测所得出的结果不尽一致，实验结果之间也缺乏可比性。