水草在植入缸中前，大多数属于陆上水耕型的栽植，因此在购买后需要作前置处理，才可入缸。其中最重要的就是消毒工作，以消灭附着水草枝叶或根部的病原菌、寄生虫、水蛭、蜗牛、白线虫等为目的。尤其以蜗牛为最。
1、消毒缸的水温可提高至28℃（待消毒工作完毕，再慢慢调整至22～24℃），以加速藻类孢仔的孵化，缩短消毒日数。
2、消毒方法：
（1）硫酸铜消毒液浸10分钟后在流动的清水（随时注入新水）中清洗一小时，每日一次，连续三天。
硫酸铜30g冲泡10公升水，即为硫酸铜消毒液。使用后可装瓶密封，保存续用。
注：消毒工作时，请戴手套以免毒液进入毛细孔，造成中毒。若有头晕、呕吐现象时，即刻至空气新鲜场所，并及时就医，有轻微感觉时可饮”绿豆汤”解毒。
（2）过氧化氢(工业用双氧水)：将双氧水以喷雾器喷雾全株(含根部)，喷透至发泡滴水为止，然后再以清水喷雾清洗药水，再浸入流水中十分钟。
（3）稀浓度漂白水浸泡五秒钟后以清水冲洗漂白水，再浸入流水中漂浮片刻。如此反复三次。(本法限有茎水草适用)
（4）高锰酸钾10g冲泡10公升水，将水草浸入该消毒液中10分钟后取出，并以清水清洗。
（5）甲基蓝5g冲泡10公升水后，将水草浸入10钟后取出，后在流动水中漂洗一小时，否则叶片较薄的水草叶片，则会染上浅蓝色的小点。