引起仔猪腹泻的原因有细菌性、病毒性及饲养管理性。我们首先要了解致病因素，才能保证治疗效果，进而可以做到预防该病的发生。养猪人要谨记：治疗仔猪腹泻以抗菌、补液、收敛、母仔兼治为原则。
细菌引起的仔猪腹泻，病初表现拉稀症状，活动量减少，多数采食正常，无其他明显症状，随着病程的发展，多表现为采食减少，甚至不食，卧地不起，发热，抗病力减退，进一步继发感染其他细菌性疾病或病毒病。发病仔猪腹泻粪便为灰色、黄色、白色、灰白色或黑色水样稀便。
细菌引起的常见仔猪腹泻疾病有大肠埃希菌引起的仔猪黄痢、仔猪白痢，由C型产气荚膜梭菌的外毒素引起仔猪红痢，由沙门菌引起的仔猪副伤寒等。
仔猪病毒性腹泻病原主要通过消化道和呼吸道传染给易感猪，临床上经常表现为病毒与大肠埃希菌或多种病毒与大肠埃希菌等细菌的混合感染，使病死率更高。该病在冬春季节容易发生，多呈现暴发性流行和地方性流行两种形式，其发病率高，传播速度快，病死率高。
寄生虫性腹泻引起仔猪腹泻的寄生虫种类较多，有猪球虫、鞭虫、棘头虫、猪小袋纤毛虫、隐孢子虫、类圆线虫、蛔虫等。目前，造成仔猪腹泻的寄生虫主要是由艾美耳属球虫引起的球虫病，6日龄～10日龄的仔猪易感。在阴雨天、空气湿润的环境下，猪舍潮湿，很适合球虫的繁殖，极易暴发球虫病。感染猪开始拉黄褐色至灰色的糊状粪便，1天～2天后变为水样腹泻，腹泻持续4天～8天，直到严重脱水死亡。
非病原性因素引起仔猪腹泻除了一些病原性因素外，尚有自身及饲养管理的原因：
①仔猪因自身消化功能不健全引起的腹泻；
②外界环境应激引起的腹泻；
③冬季管理不当引起的腹泻；
④断奶后更换饲料引起的腹泻；
⑤饲料霉变中毒、铜盐中毒、砷中毒、硒中毒等引起中毒性腹泻；
⑥营养不良引起的腹泻；
⑦患病母猪造成自身生理紊乱，以及突然改变饲料饲喂母猪等。
治疗仔猪腹泻以抗菌、补液、收敛、母仔兼治为原则。
在发生仔猪腹泻时，补液疗法是减少仔猪死亡的一项重要措施。病仔猪脱水时，机体的水、电解质、酸碱平衡紊乱，必须及时补液，缓解由此而引发的一系列症状。可采用口服补液盐饮水，临床上多用0.9%的氯化钠、5%葡萄糖、氯化钾、维生素C、碳酸氢钠等。
病毒性腹泻目前尚无特效药，主要从抗病毒、防止细菌继发感染、提高机体抵抗力三方面着手。
抗病毒药物有黄芪多糖、干扰素、免疫球蛋白、清开灵注射液等；防止细菌继发感染的药物有阿米卡星、氨苄青霉素、头孢曲松钠等，同时使用收敛药、吸附药，如：鞣酸蛋白、木炭末。对严重下痢者还可辅以神经性止泻药阿托品。仔猪发生细菌性腹泻时，为了保证产品安全，在氯霉素、磺胺药被禁用的情况下，复方新霉素制剂可有效防治细菌性腹泻。
仔猪腹泻是许多因素共同作用导致的结果，对此防治该病应做到“四早”：早发现、早预防、早诊断和早治疗，以避免仔猪腹泻的发生，确保仔猪成活率。仔猪要全价饲料，应易消化、适口性好、粒度适当，注意维生素A、D、E和B族维生素的添加以及微量元素硒、铜、锌、碘的添加。