21集：
金陵城的城门处，百姓们纷纷逃窜出城却被官兵拦了下来，眼看着就要发生冲突，首辅大人出现制止了吵闹声。首辅大人和萧平章一起出现，他指着萧平章说长林王府世子就在此处，而且太子和各位大臣的家眷也在府中未出，他劝说百姓不要慌张镇定下来，朝廷一定会想办法度过此次瘟疫的。萧平章面色凝重地驾着马守在一边，他担心百姓们会做出什么不可挽回的事。
济风堂里，萧平旌陪着林奚一起制药，他将内阁下令封城的事说了出来。林奚说封城能够制止瘟疫蔓延，她倒是觉得内阁做出这个决定很有魄力。大街上，萧元启不顾管家的阻拦到疫情严重的地方查看，他咬牙切齿地说原来这就是濮阳缨一直密谋的事。
王府里，萧平章为了不让小雪出去乱跑就找了一大堆琅琊阁的书让她翻阅，他说其中有可以治疗疫情的办法。另一边，林奚因为连日的操劳而病倒，这可吓坏了萧平旌。
山洞里，濮阳缨从徒弟那里得知朝廷下令封城，他冷笑着当年长林军就是这么对他们的，现在也该轮到这些人尝尝滋味了。济风堂里，老堂主诊出林奚也染上了疫病，她便强撑着身子表示愿意为师父试药。
首辅大人怀疑这场疫病跟濮阳缨脱不开干系，他就去找负责记录的史官查阅关于夜秦国幸存者的名录。果不其然，首辅大人在幸存者的名单里发现了濮阳缨的名字。
萧平旌给林奚喂了药，这药是老堂主亲自开的方子。萧平章把老堂主叫到了一边，他询问林奚的病情。老堂主说若是林奚能挺过今晚，就会无事，但若是今晚又发了高烧，那就凶多吉少了。萧平章问老堂主为何要隐瞒林奚的身份，他和父王都早就知道林奚就是和萧平旌有旧约的林家姑娘了。老堂主解释是因为林夫人的要求，而且林奚自幼主意就大，他也不知道她在想什么。
半夜，林奚突然醒了过来，萧平旌想去帮她擦汗，可她怕传染给他就拒绝了。萧平旌才不怕传染，他帮林奚擦了汗又擦了眼泪。林奚说她曾经无数次幻想过他的样子，没想到说这样的话却是在这个时刻。萧平旌给林奚喂了水，等到她喝完，他借着倒水去了药房里。
皇宫里，皇后在太子的床前守了一夜，她满脸泪痕唯恐太子出什么意外。次日，萧平章被首辅大人叫到了宫里，他得知了濮阳缨在其中搞鬼一事。首辅大人还将濮阳缨是夜秦幸存者的事说了出来，他将李大人故意隐瞒消息一事也栽赃到了濮阳缨身上。萧平章却觉得濮阳缨直接贿赂李大人一事很是蹊跷，而首辅大人说这不是要紧事，要紧的事濮阳缨在城中还有同*党**。
城中的疫情越来越严重，不断有病人死去。济风堂里，萧平旌和萧平章去看林奚，她脸色苍白地躺在床上。萧平旌握着林奚的手哭了起来，就在这时，她慢慢睁开了眼。老堂主知道林奚好转起来后很是吃惊，因为同样的药方只有她服用过后有用。
就在林奚和老堂主不解的时候，萧平旌说那天晚上给林奚的水里加了一味药，他把药递给了老堂主。老堂主看到是解火的药材，他便说原来是肺火未解。
22集：
济风堂里，萧平旌陪着老堂主熬药，他听到老堂主吩咐手下的医官分时辰给病人服药。王府里，萧平章看到小雪还在翻阅古籍，他很是心疼地站在一边。小雪看到萧平章回来就起身走过去抱住他，她询问疫情的事怎么样了，因为这几日府中也开始有人生病了。萧平章让小雪不要太担心，因为老堂主已经研制出治疗疫病的药方。
林奚身体好转一些，她又强撑着帮着师父做事。萧平旌让她多休息，林奚把心中的疑惑说了出来，原来在疫情爆发之前京中曾经有人大量收集过白茵草，她怀疑疫情的事有人故意为之。萧平旌把赤霞镇的事联系了起来，他也觉得这场疫病来得太突然恐怕没有那么简单。
萧元启想了许久，他不甘心一生被人利用就拿着那封还剩下一半的遗书去了长林王府。萧平章拿着遗书问萧元启为何 不早日来报，萧元启解释这封遗书是经由濮阳缨的手转交，所以他不敢轻易拿出来。不过萧元启再得知疫情一事跟濮阳缨有关之后，他也怀疑濮阳缨在谋划着什么。
皇宫中，济风堂的大夫将治疗疫情的药方交给了首辅大人，首辅大人拿到药方后就下令先去熬药给太子治病。
萧平旌急匆匆跑回王府把他跟林奚的猜测告诉了大哥，大哥就让他跟萧元启一同去抓获濮阳缨身边的两位徒弟。等到萧平旌他们走后，萧平章进宫去见首辅大人，他们目前白茵草的数量不多远远不能抵抗这场疫情。
客栈里，萧平旌和萧元启抓到了濮阳缨的两个徒弟，可他们却咬舌自尽了。另一边，因为白茵草数量不足，萧平章向首辅大人建议去西山向皇上求助。首辅大人同意派人去送信，可他为派谁去而犯了难。老堂主主动提议由济风堂的杜掌柜去，因为杜掌柜也是夜秦国的幸存者，凡是得过此疫病的人是绝不会再染病的。
牢房里，萧平旌把两具尸体上的纹身给荀飞盏和萧平章看，原来段桐舟的身上也有此纹身，他猜测这个纹身肯定代表着什么。萧平旌和荀飞盏都觉得这个纹身很是眼熟，可他们想不起来在哪里见过。
荀飞盏受萧平章所托去了天牢审问李大人，他去了之后才得知李大人竟然是奉了首辅大人的命令指认濮阳缨。离开天牢后，荀飞盏心事重重，他怀疑此事跟叔父和皇后有关。
濮阳缨得知金陵城从其他各处调来了白茵草，他很是疑惑为何他们能察觉到白茵草能解毒。另一边，荀飞盏交接班的时候碰见了叔父，可他却从叔父那里得知李大人畏罪自杀了。
济风堂，林奚忙得团团转，萧平旌缠着问她还记不记得在哪里看段桐舟的纹身。眼见着林奚实在脱不开身跟他去天牢，萧平旌就说他去天牢里临摹一幅来给她看。离开济风堂的时候，萧平旌遇到了云嬷嬷，她很是急切地打听关于疫情的事。萧平旌没有怀疑什么，他敷衍了几句就离开了。
莱阳侯府里，管家下水帮萧元启捞玉佩，他却无意中看到管家身上也有那个纹身。趁着管家换衣服的时候，萧元启一剑杀了他。