外贸跨境企业在日常工作中，可能是工作失误或者人员变动没有交接好，导致货物出口后部分单据丢失，这个时候会存在哪些风险？企业又应该如何应对呢？
正常情况下，企业的货物出口后会进行退税申报，申报后15日内，企业需要做好单证备案，用以税务检查时使用。单证备案含有一份目录，注明了所有单证所在位置，这里的单证包括了出口合同、采购合同、出口运输单据（常见的有海运提单、航空运单、铁路运单等），国内运输单据、委托报关协议、银行水单等，这些都需要整理好并做妥善保管，如果税局发现单据有缺失，你这一单的退税申报基本就无望了，如果是已经成功退税的，也会要求你归还。
根据国税局公告2013年第12号 第二条 的规定，出口企业或其他单位退（免）税凭证电子信息不齐的出口货物劳务，可进行正式退（免）税申报，但退（免）税需在税务机关按规定对电子信息审核通过后方能办理。已经申报退税的需要做负数冲减原来的申报。也就是说税局在每年的4月30号以后，如果检查到企业上一年的出口单证备案不齐，那企业执行的就是免税政策，如果审核没通过，甚至连免税政策也无法享受。
如果遇到货物报关单及证明联丢失，可以用书面形式向原签发海关申请补发，海关的报关单数据一般存储一年的时间，需要再此期限内提出，与原件不同，补发的报关单左上角会有“补办”字样。如果丢失的单证期限超过一年不超过三年，企业可以带上“情况说明”、“进出口货物报关情况证明”去当地外汇局报备；外汇局在核实情况后会在“进出口货物报关情况证明”外汇局意见栏内签署意见，并加盖“进口付汇核销监管业务章”或“出口收汇核销监管业务章”。
如果是出口退税证明联丢失，需要抓紧时间向原签发海关提交书面补办申请，时间上需要注意，如果超过6个月海关是不会予以受理，申请时企业需要拿上当地税局签发的“关于申请出具（补办报关单）证明的报告”，海关确认无误后会予以签发并打印出口退税证明联。
各位企业老板在平时就要确立单证管理的工作方针，重视制度和流程的培训工作，明确责任，落实差错追究，做好单证的管理工作，避免增加不必要的工作量。
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