在慢性乙肝自然感染史研究中，母婴垂直传播导致的幼年时期感染，约为五岁以下已感染乙肝病毒者，今后发展为乙肝患者的几率很高。而国内近三千万慢乙肝者，也多属于这种类型。
重建慢乙肝，抗病毒特异性免疫应答，主要参照乙肝DNA和e抗原
我们探究其长期携带原因，主要可归纳为：第一，乙肝病毒的DNA进入肝细胞核内部和染色体聚合，产生乙肝病毒复制模版，即临床医学所称的CCCDNA。该CCCDNA就是乙肝病毒长期存在与复制的基础。
第二，我们所称乙肝免疫耐受期。指的是人体免疫系统多种抗病毒细胞失去抗病毒识别与清除能力，导致患者对乙肝病毒免疫应答不理想，呈现长期的耐受状态。
乙肝病毒携带者所处免疫耐受期，往往与自身免疫功能健全程度有关联，例如，幼年期由于免疫功能不健全无法自发主动识别体内乙肝病毒，导致长期慢性携带。但是，免疫耐受期并非长期稳定无变化。随着年龄增长、外界环境因素等，乙肝病毒携带者的免疫清除期可进入下一个阶段，也就是免疫清除期。
国内在慢乙肝防治，主要有两个方向。第一，长期强效抑制乙肝病毒，并实现彻底清除；第二，建立在打破免疫耐受期，实现慢乙肝修复自身抗病毒特异性免疫应答。通常第一种情况已处于免疫清除期，即免疫系统已展开清除乙肝病毒，抗病毒特异性免疫应答良好。
第二种情况，重建慢乙肝的抗病毒特异性免疫应答，通过抗病毒药物以及自身的抗病毒免疫应答，实现长期抑制乙肝病毒，并真正清除乙肝病毒复制模版（CCCDNA）。
自身特异性病毒免疫重建修复，主要依据患者的乙肝DNA转阴以及e抗原消失。（这种情况实现率较高）因此，不少应用抗病毒治疗后实现重建与修复，再继续延长抗病毒疗程，已达到临床停药标准。标准参照为乙肝DNA与e抗原转阴，e抗体由阴性转为阳性。
还可见慢乙肝原本转氨酶反复升高，达到临床停药标准后，转氨酶恢复正常水平。通常提示这种发生血清学转换的慢乙肝，复发率低，病情将长期处于稳定状态。实现以上前提为，按照医院指导足够疗程，停药标准后继续复查三年；期间若病情变化，及时由医生调整方案，规范治疗。