与所有医学一样，在评估一个可能的感染病患者时，获得完整、详尽的病史是最重要的。病史对进行鉴别诊断及指导体格检查和初步诊断试验非常关键。与感染病相关的特定部分需要特别关注。一般来说，主要集中在两个方面：① 患者可能接触到某种微生物的暴露史；② 可能易患某种感染的宿主因素。《哈里森感染病学》一书中对感染病患者的病史评估作了详尽的论述｡
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暴露史
➤感染或接触耐药菌史
了解患者以前的感染，以及相关的微生物敏感性特征，对于确定可能的病原菌非常有帮助。具体来说，了解患者是否有耐药菌（例如，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、耐万古霉素肠球菌、产超广谱β 内酰胺酶或碳青霉烯酶的肠道细菌）感染史或是否可能接触过耐药菌（例如近期有住医院、护理院或长期急症护理机构史），可影响经验性抗生素的选择。例如，一名脓毒症患者，已知其有多重耐药铜绿假单胞菌侵袭性感染史，经验性抗菌治疗应覆盖铜绿假单胞菌。
➤个人史
尽管医生采集个人史通常仅限于询问患者饮酒和吸烟情况，但完整的个人史可以为潜在诊断提供许多线索。了解患者是否有高风险行为（例如不安全的*行为性**、静脉注射*品毒**）、与爱好相关的可能暴露（例如，热衷园艺者可能有申克孢子丝菌暴露）或职业暴露（例如，丧葬服务人员结核分枝杆菌暴露的风险增加）有助于疾病诊断。２００９年，一位实验室研究人员因工作期间感染鼠疫耶尔森菌而死亡，这一案例说明个人史的重要性。尽管这位患者曾就诊于门诊部和急诊科，但这两个部门均未采集其职业信息，这个信息本可快速指导给予适当的治疗和感染控制措施。
➤饮食习惯
由于某些病原体与特定的饮食习惯有关，询问患者的饮食有助于对可能的暴露做出判断。例如，产志贺毒素的大肠埃希菌和刚地弓形虫与进食生的或未煮熟的肉类有关；鼠伤寒沙门菌、单核细胞增多性李斯特菌和牛分枝杆菌与饮用未经巴氏消毒的牛奶有关；钩端螺旋体、寄生虫和肠道细菌与饮用未经净化的水有关；弧菌、诺如病毒、蠕虫、原虫与进食生海鲜有关。
➤动物暴露
由于动物经常是感染病的重要媒介，因此应询问患者的动物接触情况，包括与自己的宠物接触、参观宠物动物园或偶尔接触（如家鼠的侵扰）。例如，狗可以携带虱子而成为几种感染病的传染媒介，这些感染病包括莱姆病、落基山斑疹热和埃立克病；猫与汉氏巴尔通体感染有关；爬行动物与沙门菌感染有关；啮齿动物与钩端螺旋体病有关；兔子与兔热病有关。
➤旅游史
国际旅行和国内旅行均应关注。对最近从国外回来的发热患者，鉴别诊断的范围需要明显拓宽；即使是远期的国际旅行史，也可能反映患者曾有诸如结核分枝杆菌或粪类圆线虫等病原体的暴露史。同样，国内旅行可能使患者接触当地环境中不能见到的病原体，这些病原体在鉴别诊断中可能不会常规予以考虑。例如，最近访问过加利福尼亚或玛莎葡萄园的患者可能分别有粗球孢子菌或土拉热弗朗西斯菌的暴露。除了简单地确定患者可能到过的地方外，医生还需要更深入地了解患者在旅行期间从事的活动和行为（例如食物种类和饮用水来源、淡水游泳、动物接触），以及患者是否进行了必要的免疫和／或在旅行前服用必要的预防药物。在没有特别提示时，患者可能认为无须报告这些额外的暴露，但其实这些暴露与患者日常生活中的暴露同样重要。
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宿主因素
由于许多机会性感染（例如耶氏肺孢子菌、曲霉或JC病毒感染）只影响免疫功能低下患者，因此确定患者的免疫状态至关重要。免疫系统缺陷可能是由于基础疾病（如恶性肿瘤、HIV感染、营养不良）、药物（如化疗药物、糖皮质激素、针对免疫系统组分的单克隆抗体）、治疗方式（如全身照射、脾切除术）或原发性免疫缺陷所致。不同类型的免疫缺陷导致不同类型的感染风险增加。在确定患者是否存在免疫损害的同时，医生应评估其免疫功能状态，确保患者得到充分保护，以免罹患疫苗能预防的疾病。
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