我们自身的思维方式会为整体思维状态奠定一个特定的基调，或者 说味道。当深层边缘系统存在过度激活时，它会给思维装一个“消极过 滤器”。患抑郁症的人会持续产生沮丧的念头：回忆过去的时候，他们会感到遗憾；展望未来的时候，他们会感到焦虑和悲观；关注此时此刻时，他们也一定能找到令自己不满之处。看待自己、他人以及这个世界的时候，他们面前仿佛有一层不透明的玻璃。他们因脑中自动的消极想法而痛苦。自动的消极想法指的是那些充斥着怀疑、沮丧和抱怨的念头，而且它们自身似乎能不断繁衍。自动的消极想法能使人变得抑郁和听天由命。“我知道自己肯定无法通过星期二的考试”这类的想法会变成自动应验的预言：如果某个人相信自己无法通过考试，那么他便不会努力学习，于是，最终他真的会挂掉考试。如果你一直都很抑郁，那你也不会期待有什么好事发生，这么一来，你也不会努力地促成那些好事发生。消极思维会给人内心带来痛苦，而这种痛苦会使你和他人疏离，最终使得你更加孤立。与之相反的是，积极的思维和态度能使你散发出健康的气息，并使别人更愿意接近你。积极思维还能使你的生活更有效率。所以正如你所看到的，你的所思所想决定了你的行为是自我攻击还是自我提升。
下面是有关自动的消极想法的一些典型例子：
你从来不认真听我说话。
这一年公司的效益还不错，但这根本不能代表什么。
你不喜欢我。
这样下去不行。我知道一定会发生什么糟糕的事情。
我觉得你好像根本不在乎我。
我应该做得更好的。我是个失败者。
你太傲慢了。
你迟到了，这说明你根本不在乎我。
这都是你的错。
治疗深层边缘系统的疾病需要纠正每一刻的思维模式。然而不幸的是，虽然这种思维模式和我们如影随行，但是从来没有人教过我们如何去反省自己头脑中的想法，或者如何去质疑那些脑海中浮现的概念。你的每一个想法都会向你的大脑发送电信号，它们对你身体的每一个细胞都影响深远。当你的脑袋充斥着消极想法时，这些消极想法会影响到你的深层边缘系统，进而引起相关的心理障碍，比如易激惹、心境低落、抑郁等。下面是是一些实践中使用的“思维法则”，它们能够循序渐进地解决深层边缘系统上的问题。
步骤1：你的想法是真实的
你的想法是真实存在的，而且它们对你的感觉和行为会产生真实的影响。
步骤2：注意觉察消极思维如何影响了你的身体
每当你产生一个愤怒的念头，一个残酷的念头，一个悲伤的念头，
或者一个任性的念头时，你的大脑都会释放化学神经物质，使你的身体感觉不适，并激活深层边缘系统。回忆一下最近一次你失去理智的情境：当时你的身体有什么感觉？大部分人愤怒的时候都会肌肉紧张，心跳加速，手心出汗，甚至还可能会晕眩。你的身体会对每一个消极的想法做出反应。
步骤3：注意觉察积极思维如何影响了你的身体
每当你产生一个好的念头，一个快乐的念头，一个充满希望的念 头，或者一个善良的念头时，你的大脑都会释放化学神经物质，使你的身体感觉很舒服，并会使深层边缘系统变得平静。回忆一下最近一次你产生一个快乐的想法时的情境：当时你的身体有什么感觉？大部分人快乐的时候都会肌肉放松，心跳减缓，手心干爽，呼吸平缓。你的身体同样会对每一个积极的想法做出反应。
步骤4：注意觉察你的身体对每一个想法做出的反应
通过脉搏呼吸记录器或者测谎仪，我们已经了解到人类的身体会对自己的思想内容做出反应。在谎言测验中，被试会带上一些测量手心温度、心跳速度、血压、呼吸频率、肌肉紧张度以及手心出汗情况的仪器。施测者会提一些问题，比如：“是不是你偷了那辆车？”如果被试的确偷了车，那么他的身体会呈现出“有压力”的反应；他的手心会变凉、出汗，而且会心跳加速、血压上升、呼吸频率加快、肌肉绷紧。不论被试有没有说话，这些躯体上的反应几乎是即刻发生的。或许你还记得，深层边缘系统负责将我们的情绪状态转化为生理感受。因此，如果他有别的想法，则会刻意向反方向去影响自己的躯体反应。如果被试没有偷车，他的身体就可能表现出一种“放松”的反应。他的手会变暖，他的心跳会比较缓慢，血压会下降，呼吸会变得缓慢而沉重，肌肉会放松，手心会更加干燥。你的身体也会对你的想法做出反应，这种反应和想法几乎同时发生。这种反应不仅仅在你被要求说出真相时才会发生，而且会针对你脑中的每一个念头身体都会做出反应，不论这些念头是关于工作，还是关于朋友、家人或者是其他的事情的。
步骤5：把不好的想法当成污染
一个消极的想法对你的身体来说都像是一种污染。就像洛杉矶地区 的环境污染会影响到每一个出门的人一样，消极的想法也会污染你的深层边缘系统、心理和身体。
步骤6：理解我们自动的消极想法并不一定是真实情况的反映
除非你有意识地反省自己的想法，否则通常它们都是自动产生的，即“它们自然而然地产生了”。但即便你的想法是自动产生的，也并不 一定都是正确的。你的想法并不总会准确反映出真实的情况。有时候，它们甚至会欺骗你。有一次我接诊了一个大学生，他认为自己很笨，之所以这么想，是因为考试失利。而当我们给他测试了智商之后，发现他近乎是天才！所以，你不必相信脑中冒出来的每一个念头。重要的是，我们要有意识地去反省自己的想法，看它们对自己是有益的还是有害的。
步骤7：与自动的消极想法辩论
你可以将自己的思维向积极和充满希望的方向引导，也可以让它变得消极并且扰乱你的心情。一旦你觉察到自己各种想法的存在，你就可以选择去产生一些好的想法并让心情愉快起来，也可以选择产生一些糟糕的想法并感到恶心。没错，这完全取决于你自己！你可以学习如何来改变自己的想法，你可以学习如何借由改变自己的想法而改变自己的情绪。
其中一种改变途径是注意那些自动的消极想法，并且和它们进行辩论，我会在下面做详细介绍。如果你脑中冒出了一个消极的想法，而你却没有去质疑它，那么你的大脑就会相信这个想法，接着你的身体就会对它做出反应。当你纠正了消极的想法之后，就能够消除它的各种影响。
步骤8：检验自动的消极想法
你需要把这些消极想法看成野餐时出现的蚂蚁，像蚂蚁打扰了我们的野餐一样，它们打扰了我们的思维。一个消极的想法就像是野餐布上出现的一只蚂蚁，并没有什么大不了；三四个消极的想法就像野餐布上出现的三四只蚂蚁，这就开始有点烦人了；如果有10个或者20个消极的想法，就像10只或者20只蚂蚁在野餐布上爬来爬去，你一定会愤愤地收起野餐布。不论何时，只要你注意到这些自动的消极想法出现了，就必须消除它们，否则，它们将摧毁你的人际关系、自尊和个人能量。消除自动的消极想法的途径之一是把它们写下来，然后和它们进行辩论。举个例子，如果你发现自己在想“我的丈夫从来不听我说话”，那就把这个想法写下来。然后再写出更加理智的反应，比如“他现在没有听我说话，可能是因为他的注意力被其他事情分散了。其实他经常听我说话的”。当你写下自己的消极想法并试着和它们辩论，最终把它们压下去的时候，你就消除了它们带来的影响，并且心情好起来。在相信自己的想法之前，重要的是先检验它们的真实性。
思维有9种办法骗你，这会使你相信当前状况比实际情况要更糟
糕。你可以把这9种办法理解为不同类型的自动的消极想法。当你辨别出它们时，你就渐渐学会了摆脱这些消极想法的不良影响。 请随时随地注意并检查这些自动的消极想法是否存在于自己的脑中。
自动的消极想法类型小结
总是／从不思维： 想法中带有这样的词语：总是、从没、没有人、人人、每次、一切。
聚焦于消极信息（红色警告）：只看到环境中坏的一面。
预测命运（红色警告）：预测最坏的可能。
读心术（红色警告）：你相信，即便别人不告诉你，你也能知道别人在想什么。
用情绪代替思维： 相信自己的情绪，完全不去质疑情绪的真实性。
内疚感的鞭挞：常常使用应该、必须、理应、不得不这些词语。
贴标签： 给自己或者别人贴消极的标签。
个体化： 把一些中性事件的发生归咎于自己的个人原因。
责备（红色警告，最危险的一种）： 因为自己的问题而责备他 人。