正如前文说过的，磨玻璃结节所在的位置、大小、密度决定了手术切除方式的选择。无论哪一种手术方式，医生首先会做到病灶完整切除，然后在切“干净”的基础上尽量多保留正常肺组织，以便术后患者有更好的肺功能和生活质量。
手术方式的选择有以下几个原则：
1. 肺组织按照从内到外大约分为内1/3，中1/3和外1/3三个区域。病灶位于肺组织1/3区域内，可以考虑行肺楔形切除术。病灶位于肺组织内1/3和中1/3区域内，可以考虑行肺段切除术或肺叶切除术。
2. 磨玻璃结节直径小于1.5cm者，可以考虑行肺楔形切除术，直径大约1.5cm者则一般行肺段或肺叶切除术。
3. 纯磨玻璃结节往往恶性程度低，可以考虑行切除较少的楔形或肺段切除；混合性磨玻璃结节，也就是混有实性成分的磨玻璃结节，一般情况下实性成分越多，恶性程度就越高，则一般行切除相对较多的肺段或肺叶叶切除术。
以上的原则并不是一成不变，要结合磨玻璃结节的位置、大小和密度综合考虑，甚至有时还要根据患者身体条件来考虑。这种判断需要外科医生长期经验的积累，比如，很靠近肺门的直径约1.5cm的纯磨玻璃结节，由于解剖位置的关系，很难行楔形和肺段切除术，只能选择肺叶切除术。对于肺功能较差的患者，位于肺周围靠近胸膜处约2cm的磨玻璃结节，即使它含有实性成分，但从患这肺功能及术后康复的角度考虑，也只能放弃肺叶切除，选择能更多保护肺功能的肺楔形或肺段切除术。不论哪一种手术方式，手术过程中会常规快速冰冻病理检查，确保切缘肿瘤阴性。
