水稻产生黑根是一种比较普遍的现象，尤其是长期淹水、低洼及排水不良地块，出现黑根更为严重。水稻出现黑根后吸水、吸肥能力下降，影响正常生长。水稻黑根是一种生理性病害，根据受害程度不同，可分为三种类型：
1、轻度黑根
地上部分长势好，根部只有部分或少部分发黑，拔起根时不沾泥，没有明显臭味，将拔起的根置于空气中，这种黑色物质（少量的硫化亚铁）不久将逐渐消失。这对根的吸收功能未受严重损害，根部尚未腐烂，秧苗生长后期根系生长可恢复正常。
2、严重黑根
部分根为黑色或蓝黑色，沾泥，刚拔起时可嗅到臭味，地上部分生长较差。这种黑色物质是由于根部表面形成硫化亚铁的缘故。把黑根放在极稀的石灰水中（万分之一），黑色很难褪去，而轻度黑根的黑色则可以褪色。严重黑根的根部呼吸和吸收作用都已减弱，根内碳水化合物的含量减少，但根的内部组织还未破坏，无腐烂中毒现象。
3、中毒腐烂型黑根
根初期为半透明，根内充满硫化氢的水溶液及少量硫化亚铁黑色物质，刚拔起时有刺鼻臭味，根系无弹性，内部组织已破坏，部分腐烂变质，稻苗长势弱，有时造成死亡。
产生黑根原因
黑根是否产生与土壤还原性有毒物质的数量以及根向外扩散氧气的能力有关，因此凡是影响硫化氢等毒物形成和根系氧化力的条件都会引起黑根，主要有以下几个方面：
第一，地下水位高，长期浸水缺氧，还原作用强烈，有机肥和无机肥在缺氧状态下产生大量硫化氢等还原性物质毒害稻根；
第二，大量施用末腐熟的有机肥料，长期淹水缺氧下分解不完全，产生大量还原性的中间产物，使稻根受害严重；
第三，过量施用硫酸铵，硫酸根在硫酸还原细菌的作用下形成硫化氢等硫化物，稻根中毒。
第四，土壤质地粘重，通透性不良，硫化氢扩散差，导致黑根增多。
第五，植株生长不良，如插秧过深，根部周围还原性较强；病株的光合作用不正常，对根部输送的氧气和糖分都减少，根部氧化力低，氧化有毒物质的能力就降低，等等，都易产生黑根。
解决措施
防治黑根产生的途径主要是下列几个方面：
第一，晒田是最基本的办法，可以增加土壤通气，降低土壤的还原作用。
第二，整治排灌系统，降低地下水位，排灌分家，是解决低洼地区水稻黑根的根本方法。
第三，合理施肥，有机肥要加工腐熟，避免施用过量的硫酸盐肥料。
第四，土壤酸性过大的稻田可施用石灰或钙镁磷肥，以中和土壤酸度，创造局部的暂时的弱碱性环境，减少硫化氢的积累。
第五，改土，对粘重土、反酸田等，按照不同情况综合治理。
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