肠道微生物新进展 (肠道微生物治疗方法)

奇点实力派

微生物领域迎来了新时代

链接全球创新医疗

文|BioTalker

上个月,我写了一篇文章,跟大家聊了「肠道微生物是如何在幕后操纵我们的胖瘦的」这个很有意思,又略重口味的话题。在文末,我热心地给大家推荐了由美国马萨诸塞州总医院Elaine Yu教授领导的肠道微生物治疗肥胖的临床试验。

于是,有很多读者在后台留言,跟我们探讨「吃便便」减肥可行性的问题。我发现,大部分读者都是想看别人吃,没想过自己吃。连我司骨骼「清晰」的小前端也在饭前高声叫嚷,「我这里不限量,免费续杯。」

肠道微生物调理,肠道微生物治疗未知之谜

传说中有魔性的透明冻干便便胶囊

这真是……还让不让人吃饭了!

不管是啥时候,一谈起微生物治疗这个话题,最吸引眼球的要数「粪菌移植」和「冻干粪便胶囊」。不管哪一个都绕不开人体的排泄物。要是某些患者只能依靠这种方法治病,那也就认了,当然他们内心可能饱受折磨;换成想减个肥或者治个肠炎的普通人,估计死活都不愿去「找虐」。

这个巨大的缺点,对医疗市场和保健市场的培育和发展都是极其不利的。那怎么办?能不能做成「养乐多」那样?即使不行,至少用人工培养的菌也好啊!肯定会有人举手说,「便便里的也是人工培养的啊!」当然,我的意思是,在实验室培养的,就像种蘑菇那样!(不知道蘑菇也属于微生物的朋友请不要挑错)

诶!既然市场有这样的需求,企业一般都会尽力满足的。在7月7日,微生物治疗领域唯一一家上市公司Seres Therapeutics宣布了一个让人振奋的消息:全球首个合成性微生物药物SER-262即将开展Ib期临床实验。

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作为微生物治疗界的明星企业,Seres成立于2010年;2012年Flagship VentureLabs毕业,先后获得4轮融资,累计超过1.3亿美元;去年6月25日宣布IPO,共筹得1.34亿美元。它的「代表作」是肠道微生物混合药物SER-109,主要用于治疗艰难梭菌感染(Clostridium Difficile Infection,CDI;此菌被美国疾控中心列在最具威胁的耐药菌前三)引起的肠道疾病的治疗。SER-109先后获得FDA「突破性治疗」和「孤儿药」称号。

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Seres Therapeutics去年在纳斯达克挂牌,请记住它的股票代码(MCRB)

与SER-109不同的是,SER-262胶囊中的微生物不是从健康的志愿者粪便中分离出来的,而是在实验室的条件下培养出来的。这就是说SER-262不再依赖于供体了,简单粗暴的说,就是再也不用去倒腾健康人的便便了。于医生,于患者而言,都是一个利好的消息。这种转变不仅解决了患者的接受度问题,还带来了另一个好处,之前依靠健康志愿者捐献的方式不能实现量产,总不能让那些志愿者天天在厕所上班吧。SER-262的好处是不是更加显而易见了。

另一个不同是,SER-109是从健康供体粪便中纯化的一个完整的微生物生态系统,因此,SER-109实际上是一个包含多种微生物的完全移植胶囊。而SER-262的胶囊里,只有12种微生物,但它同样是治疗CDI。转念一想,这好像跟青蒿和青蒿素的关系类似!突然,脑子中浮现四个烂大街的字加一个感叹号,「精准医疗!」微生物治疗的新时*开代**始了。

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治疗流程

据悉,人体肠道细菌大概有1000余种,但是Seres的研究并不是仅仅依赖这1000多种细菌,它同时还会借鉴它那个包含14000余种细菌的庞大数据库。据Seres介绍,他们的微生物数据库应该是世界上最大的了,甚至超过了NIH。

目前Seres已经对它那个巨大细菌库里的细菌「了如指掌」,包括它们的「吃喝拉撒」习惯。在此基础上,Seres再结合健康人群肠道微生物的数据,和SER-109临床I/II期的研究结果。就这样Seres最终确定了SER-262胶囊中的12种细菌。但是目前Seres没有公布这12种细菌是啥,以及在胶囊中所占比例。接下来,就开始折腾小白鼠。SER-262在小鼠实验中表现非常好,可以显著降低患CDI小鼠的死亡率。这才有了这个Ib期临床试验。

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这个图反应的是Clostridium Difficile和SER-262中12中微生物的「食谱」,最上面一行表头是病原菌C. Difficile的「食谱」,下面1-12代表SER-262中12中微生物,他们的饮食多样性不如C. Difficile,但是叠加在一起基本上是全覆盖该了。这是要通过食物竞争,排挤C. Difficile

SER-262治疗CDI的主要机制有两个:一是,如上图所示的食物竞争;二是,

SER-262中12种微生物有一些具备降解胆汁酸的能力,而那些代谢产物可以抑制病原菌C. Difficile的生长。

除了SER-262之外,Seres在研的合成性微生物药物还有SER-301,这一款微生物混合胶囊主要用于治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)。

无论如何,Seres这个微生物治疗领域的霸主又往前迈了一大步,这标志着他们已经具备了通过科学合理地设计细菌混合物的组成,快速开发新型合成微生物疗法的能力。

这对于整个微生物领域而言,也具有里程碑意义。一是,可以化解患者内心的抵触情绪;二是,可以实现药物的大规模量产,惠及更多的患者;三是,利用几种微生物组合治疗疾病成为了现实,后期将会有针对各种疾病的微生物组合诞生。希望科学家能早日拯救肥胖患者于水火之中,我们再也不要听什么「便便胶囊」了。

再无其他话可说,唯有一句,「SER-262,祝临床一切顺利。」

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