1949年11月22日，中央军委做出决定：在 大连创办中国人民解放军海军学校。
1950年2月1日，开学。同年12月，航海指挥系和机械工程系分别扩编为指挥分校和机械分校。
1952年，学校更名为“第一海军学校”，开始招收高中毕业生入学。
1957年，学校更名为“海军指挥学校”。
1985年，学校开办研究生教育。
1986年，学校定名为“海军大连舰艇学院”，并拥有工学学士学位授予权。
1990年，学院成为全军指挥院校中首批获得硕士学位授予权的单位之一。
1995年12月，学院被总部确定为全军“研究生培养单位重点建设院校”，并享有理学及工学学士、硕士学位授予权。
1999年6月，根据中央军委命令，原中国人民解放军海军政治学院并入该院，组建政治系。
2000年，学院被批准为博士学位授予权单位。
中国人民解放军海军政治学院
1958年（1957年9月23日国防部命令），第三海军学校、第五海军学校、海军政治干部学校、海军后勤学校合并，组建中国人民解放军海军高级专科学校（海军高专），位于青岛，首任校长刘中华。设一系指挥系、二系政治系、三系快艇系、四系参谋系、五系后勤系。
1959年5月，增设六系导弹系。
1960年4月10日，后勤系分出，并入武汉总后勤部后勤学校，后于1878年改建海军后勤学校，后为海军后勤学院。
1960年4月19日，更名为中国人民解放军海军高级学校。
1963年5月7日，改建中国人民解放军海军政治学校（海政校），校长康庄少将，政委吴罡少将，执行军级权限，位于青岛。
1963年，海军学院（政治系）分出，并入。
1969年2月19日，撤销海军政治学校。
1977年11月7日，重建中国人民解放军海军政治学校，位于大连。
1986年，升格中国人民解放军海军政治学院。
1992年8月，撤销海军政治学院，成为海军指挥学院分院。
1993年6月，恢复独立。
1999年6月，并入海军大连舰艇学院，作为政治系。
