“藤原将军”赖经
承久元年（1219）正月二十七日，在源实朝遭到*杀暗**的一个月之后，幕府方面邀请后鸟羽院的皇子赴镰仓承继源实朝的将军之位。接下来，笔者将详细介绍一下具体经过。
首先，二月中旬，北条政子意欲迎后鸟羽院的皇子六条宫或冷泉宫至关东。二阶堂行光为此专程赶赴京都，幕府的宿老及御家人也都联名上奏，表示有相同的意愿。《愚管抄》称，将军麾下的武士失去主人后难免心生忧虑，为了安抚众人心绪，迎皇子坐镇镰仓可谓合情合理。
但是，幕府与朝廷的交涉并不顺利。在奔赴京都约一个月后，二阶堂行光向朝廷方面表示，虽无须即刻动身，但务必送出一位皇子前往镰仓。随后三月上旬，内藏头藤原忠纲作为后鸟羽院的使者抵达镰仓，在一番吊唁后，藤原忠纲向北条政子提出，欲罢免摄津国长江庄、仓桥庄的地头。随后，镰仓幕府的北条义时、北条时房、北条泰时等北条氏成员及大江广元，就此事在北条政子的府邸展开商议。十五日，北条政子派北条时房率领千骑兵力奔赴京都。可后鸟羽院依然拒绝派遣皇子。
最终，经双方妥协，藤原兼实之孙藤原道家的儿子、年仅两岁的三寅（后来的藤原赖经）被送往镰仓，他是源赖朝的妹妹与一条能保所生的两个女儿的后代，即无论父系还是母系，三寅都可算得上是源赖朝的亲族。因此，人们认为三寅继承将军之位具有一定的合法性。
那么，后鸟羽院为何不允许皇族就任将军之位，却允许藤原氏这样做呢？后鸟羽院曾表示：“日本国将会一分为二。”因此，如果藤原氏就任将军之位，不管其如何专权，都将不具有取代天皇的合法性，但如果是皇族乃至皇子就任将军之位，那么他们则有可能取代天皇。谁也不能保证两个血统相同的皇子是否会为了争权而将日本分裂为东西两半。所以，当时便已想*翻推**幕府的后鸟羽院，决不能容忍这样的风险发生。再者，藤原氏本就具备辅佐天皇执政的身份，所以根据实际的权力关系，藤原氏甚至有可能将幕府重新规制于朝廷的控制之下。
六月三日，天皇正式下令派遣藤原赖经前往镰仓。于是，藤原赖经于六月二十五日从京都出发，七月十九日抵达镰仓，成为所谓的“藤原将军”。由此，新任幕府将军的政所开始运转，不过由于将军年幼，实际政务仍交由北条政子打理。其后，直至嘉禄二年（1226），藤原赖经才正式就任将军一职。
关于指定藤原赖经的经过，据《增镜》的记述称，北条政子曾向西园寺公经表示想迎一名皇子坐镇镰仓，于是西园寺公经便遵照北条政子的想法，开始着手操办此事。在此过程中，西园寺公经的女婿藤原道家建议，可以让其子藤原赖经担任幕府将军，西园寺公经认为此事亦可，于是选了藤原赖经。
不过，这件事对西园寺公经和藤原道家来说或许是千载难逢的好机会，但对于北条政子和北条氏来说情况就有所不同了。藤原赖经虽是摄关家与源家的后裔，但他却与北条氏毫无血缘关系上的纠葛。如此一来，源赖朝至源实朝三代将军的外戚——北条氏，将丧失其原有的地位与权力。不仅如此，如果藤原赖经与源氏的相关势力结合，那么北条氏将陷入更加不利的境地。
而且，仅凭源赖朝远亲的身份，在武士社会中，藤原赖经将难以主张其具有继任幕府将军的绝对合法性。据《明月记》的记载称，嘉禄二年（1226）正月，佐佐木信纲作为使者前往京都，申请任命藤原赖经为征夷大将军，他来到藤原氏守护神所在的春日社，询问神明是否可以让藤原赖经改姓为源赖经，结果天意不允，故而藤原赖经无法改姓。恐怕天意即为抽签的结果吧。不过，我们亦可从中窥见，幕府希望藤原赖经改源姓的诉求，以及藤原氏方面碍于脸面所持有的反对态度。不过，经由此事，我们可以看到幕府方面对藤原赖经的合法性多少持有些危机意识。正是为了弥补这种合法性上的缺陷，藤原赖经的名字才与源赖朝、源赖家保持一致，取了其中的“赖”字。此后，由于天气无常的宽喜二年（1230）闹灾荒，人们对将军合法性的怀疑也好像烟消云散一般，藤原赖经与源赖家之女、源实朝妻子的养女竹御所成婚。也就是说，藤原赖经以源氏养子的名义继承了将军之权。
承久之乱的导火索
另一方面，随着源实朝的离世，源赖朝一脉绝嗣，幕府的向心力也开始减弱。于是，后鸟羽院决定趁机*翻推**幕府。如此一来，镰仓初期政治史的分水岭式事件——承久之乱爆发了。
承久之乱爆发的直接原因，前文亦有提及，即承久元年（1219）三月，后鸟羽院在吊唁源实朝之际，向幕府提出撤销其赐予宠妾白拍子龟菊的摄津国长江、仓桥两处庄园的地头职务，因为这些地头拒绝服从龟菊的命令。但北条义时却断然拒绝了后鸟羽院的请求，他认为纵使下达院宣，亦不可收回源赖朝作为战功奖励赏赐给功勋者的地头职务。另一方面，被赐予这两处庄园的龟菊又称伊贺局，据说她曾是平安时代淀川与神崎川交界处繁华的江口、神崎码头的一名*女妓**，故而可能与该地区有着千丝万缕的联系。但是，笔者认为不论后鸟羽院如何宠爱龟菊，单单此事也似乎很难成为后鸟羽院决意*翻推**幕府的契机。我们稍后将会讨论，在此事件背后，恐怕还隐藏着某些尚未浮出水面的理由。此外，如果将此事作为承久之乱的导火索，那么从此事发生直至举兵，中间间隔了近两年的时间，笔者认为这样的时间间隔未免过长。
总之，在此事之后，后鸟羽院开始实施倒幕计划。首先，他唤来藤原秀康，命令他制订计划讨伐违背院宣的北条义时。藤原秀康受命，并建议拉拢在京都的三浦胤义加入，三浦胤义是相模三浦氏之人。于是，藤原秀康便假借酒宴之名邀请三浦胤义，并一面向三浦胤义打听其留守京都的真实目的，一面向其不经意地透露后鸟羽院的决定以寻求配合。由于三浦胤义原本就受后鸟羽院之命，企图在幕府中掀起叛乱，故而此院宣可谓正中下怀。于是，三浦胤义向藤原秀康提议：“如果你写信给我的兄长三浦义村，三浦义村必会响应，待到那时讨伐北条义时，将会变成小菜一碟。这种计划不能耽误，事不宜迟，你们应该尽快展开商议。于是，藤原秀康把这些情况禀报了后鸟羽院，后鸟羽院火速下令，召开军事会议。
就这样，承久三年（1221）四月二十八日，朝廷一方面宣称要在伏见的城南寺举办骑射比武大会，并以此为名召集了各地的武士，另一方面又向坊门忠信、叶室光亲、源有雅、中御门宗行、一条信能、高仓范茂、僧正长严、法印尊长等人直接传达了旨意。据通行本《承久记》记载，共有大和、山城、近江、丹波、美浓、尾张、伊贺、伊势、摄津、河内、和泉、纪伊、丹后、但马十四国的武士，共计一千七百骑参加了此次骑射比武大会。据慈光寺本《承久记》记载，则有大和、近江、丹波、美浓、尾张、伊势、摄津、纪伊、丹后、但马、播磨、三河、伊豫十三国，共计一千余骑加入其中。其中的主要人物有藤原秀康、佐佐木广纲、大内惟信、后藤基清、三浦胤义、河野通信、大江亲广等。
在此之前，后鸟羽院向金峰山供奉了一件淡绿色丝线的腹卷以祈祷计划成功。与此同时，四月二十日，基于与后鸟羽院齐心迎战的考量，顺德天皇悄悄将皇位让与仲恭天皇。于是，以后鸟羽院为首，包括土御门、顺德在内的三位上皇，以及六条宫、冷泉宫皆聚于高阳院之中，他们命诸国士兵把守四面大门，准备迎接战斗。
盲目乐观的京都一方
战斗伊始，后鸟羽院命令藤原秀康讨伐北条义时的亲族——身处京都的京都守护伊贺光季。于是，藤原秀康前去跟三浦胤义商议，伊贺光季十分勇武，若是直接冲入其住所，恐难实现将其剿灭的目的，于是二人决定，先将伊贺光季唤至高阳院，然后再在前庭将其杀死。万一伊贺光季不从，则视情况而动。藤原秀康与三浦胤义将行动日期定为五月十五日。到了那日，伊贺光季三次无视了院宣传召，据说是因为佐佐木广纲无意间向伊贺光季走漏了风声，又或者是因为西园寺公经曾因后鸟羽院不寻常的动向提醒过伊贺光季要提高警惕。总之，最后藤原秀康、三浦胤义、大江亲广等后鸟羽方面的*队军**，为了剿灭伊贺光季，全部涌进了高辻京极的住所。
因为身负京都守护的身份，伊贺光季放弃了逃往镰仓的念头，他决心以不足三十人的兵力迎战。据说，后鸟羽院方面来了八百骑到一千余骑的士兵，抵达战场后，双方展开激战，大概过了两刻钟时间，伊贺光季手下的兵将几乎全军覆没，伊贺光季本人也身负重伤。最终，被逼入绝境的伊贺光季与次子伊贺光纲一起，点燃居所自杀了。此外，在此之前，朝廷中的亲幕府派——西园寺公经、西园寺实氏父子也被召入宫中软禁。伊贺光季的手下为了把消息送往镰仓一路疾行，但三浦胤义在结束战斗后便依照商议结果，遣使给兄长三浦义村送了一封信，劝他投靠后鸟羽院一方。此外，后鸟羽院又再次命令藤原秀康，向五畿七道诸国下达追讨北条义时的院宣，尤其是对镰仓的武田信光、小笠原长清、小山朝政、宇都宫赖纲、足利义氏、北条时房、三浦义村等实力派武将，为了传达后鸟羽院的旨意，还特地派遣了部下押松赶往镰仓。
此时，后鸟羽院问：“在关东有多少人会与北条义时同生共死？”三浦胤义回答说：“不会超过一千人，因为恐怕无人愿与朝廷的敌人结盟。”然后，恰好也在场的另一位武士却直言道：“恐怕不止一千人，无论如何也不会少于一万人，倘使我也置身关东，应该会加入北条义时一方。”此番发言引得后鸟羽院大为不快。该故事表明京都方面的认知不过如此。
五月十九日，伊贺光季的信使到达镰仓，西园寺公经派遣的信使几乎同时抵达，京都方面的严重事态也都为镰仓众人所知。于是，幕府方面在镰仓搜寻押松，并成功将其擒获，没收了其所持之宣旨。另一方面，三浦义村并未给三浦胤义的使者回信，而是将其直接赶了回去。而后，三浦义村拿着三浦胤义寄来的书信去找北条义时，以示对镰仓方面的忠诚。京都方面企图通过怀柔政策笼络镰仓幕府的实力派将领，来从内部瓦解镰仓幕府，实现倒幕大业。然而，这一设想却将京都方面盲目乐观、过于天真的姿态暴露在大众眼前。
此时，镰仓诸将集中在北条政子处共商对策。北条政子历数了源赖朝自开创幕府以来对诸位将领的恩情大义，她指出了京都方面下达“不义”的纶旨，讨伐幕府的不公，并敦促御家人们决定到底是投靠京都，还是留在镰仓战斗。在北条政子慷慨激昂的陈词之下，没有一人表示愿意投靠京都一方，于是众人同仇敌忾，前往北条义时的宅邸共商军务。在会议中，诸位将领各抒己见，其中“固守足柄、箱根两个关口，静待京都方面进攻”的意见占据了绝对的优势。但是针对此意见，大江广元表示，如果不团结一心，只一味守关，不出几日，镰仓方面定会败北。所以，大江广元积极主张应火速派遣*队军**攻进京都。于是，北条义时就“应该采取哪一种方案”向北条政子征询了意见，北条政子赞同大江广元的看法，她任命北条泰时为大将，待武藏国*队军**到达，便即刻出兵京都。
东国武士十九万骑开拔
据《吾妻镜》记载，这一天，北条义时颁布指令，要求东国诸国率领族人参加远征军，指令下达的对象包括远江、骏河、伊豆、甲斐、相模、武藏、安房、上总、下总、常陆、信浓、上野、下野、陆奥、出羽等。
二十一日，军事会议再次召开，出兵京都的积极对策又一次遭到了部分与会人员的质疑。大江广元表示，都已经决定派兵且已过了一段时间，又重新出现这样的反对意见，即说明等待武藏*队军**本身，就是一个错误的决策，而且如果再这么继续等下去，武藏*队军**也难免会心生变节。如果北条泰时独自一人出兵，东国势力必定汇聚、跟随。北条义时认为大江广元言之有理。而后，北条义时又向幕府宿老入道善信（三善康信）征求了意见，结果入道善信与大江广元的意见高度统一。
既然如此，北条义时便下定决心让北条泰时率兵在深夜开拔，无论如何，当日之内先赶往稻濑河的藤泽清近家即可。第二天即二十二日，北条泰时大军总算正式向京都进发。那时，北条泰时的主要追随者有包括其子北条时氏在内的十八名将领。而后，北条时房、足利义氏、三浦义村等人也相继出兵，朝京都方向进发。另一方面，北条朝时也作为北陆道大将挺进京都。
承久之乱：幕府军的进攻路线
二十三日，北条义时、大江广元、入道善信、小山朝政、宇都宫赖纲等宿老留守镰仓，负责部署*队军**并为前线将士祈祷，而其他的东国武士，在二十二日至二十五日清晨之间，也都陆续出发。一时间东国兵力总计约达十九万人。他们兵分三路：东海道由北条泰时、北条时房、足立义氏、三浦义村带领，有十万余人；东山道以武田信光为大将，由小笠原长清、小山朝长、结城朝光带领，有五万余人；北陆道由北条朝时、结城朝广等人带领，有四万余骑。据古活字本《承久记》记载，当时幕府*队军**的组编已存在“父亲前往京都则儿子留守东国，儿子前往京都则父亲留守东国”的趋势，换言之即已有父子兄弟各自分离以留下“人质”的设置，不过该记载真伪不明。
另一方面，携带院宣而来的后鸟羽院部下押松，被幕府暂时扣留，有人建议先让押松看看东国*队军**的壮观场面，随后再令其返回京都，恐怕更为妥当，所以押松并没有被立即释放。终于到了二十七日，押松带着北条义时回应院宣的信，踏上归途。据慈光寺本《承久记》记载，在这封信中，北条义时无所畏惧地表示：“每年进贡两三次染绢、金银、鹫羽及马匹，朝廷有何不足，需要颁布此等院宣？倘若朝廷想要召见武士，吾将派遣东海道、东山道、北陆道共计十九万武士与西国武士战斗，以供御览，倘若如此仍不足够，请再次派遣押松这样的官吏前来送信，到时北条义时自会再领十万武士参见。”
在此之前的十九日，为了防备镰仓方面的进攻，京都方面在各处排兵布阵。二十六日，被派遣至美浓的藤原秀康之弟藤原秀澄向京都报告说，东国*队军**犹如黑云压城之势袭来。院中众人顿时慌作一团。二十八日，清水寺的僧人将后鸟羽院的祈愿文放入新造好的胜军地藏、胜敌毗沙门像内供养，以祈祷战争能够获得胜利。
六月一日，押松回到高阳院。他带回了北条义时的回信，并将镰仓的情况及归途中所见无数东国*队军**的情景传达给众人。此时，院中“上下万人，皆俯首，目光低垂”，人人垂头丧气，被吓得魂飞魄散。纵使如此，万般无奈下，京都方面仍然不得不想办法部署防卫。于是，藤原秀康受后鸟羽院之命开始部署，他将大内惟信、藤原秀康、藤原秀澄、三浦胤义、佐佐木广纲等主力军一万二千人派往东山道、东海道，将宫崎左卫门尉等七千人派往北陆道，京都方面兵力总计一万九千人。剩下约七百人则负责固守宇治、势多。较之此前以城南寺骑射比武大会为名召集而来的兵力，此时京都方面的兵力还多出了增援部队，但目前增援部队的人数、出身地域均不详。只不过，在追讨伊贺光季的战斗结束后，后鸟羽院方面也仍不放弃召集兵力。据《吾妻镜》记载，宫中曾派遣过五名使者前往但马的法桥昌明处，召集武士奔赴京都，但法桥昌明将其全部斩首，表示自己誓不从命。为此，法桥昌明遭到了但马国内追随京都方面势力的袭击。
美浓、尾张三川地区的攻防战
六月五日，东海道幕府军的先头部队抵达尾张一宫，幕府军向木曾川、长良川等多处渡河地点派兵布阵：鹈沼渡方面由毛利季光等人负责，池濑方面由足利义氏负责，板桥方面由和狩野介入道负责，大豆户方面由北条泰时、三浦义村等人负责，墨俣方面则由北条时房和安达景盛等人负责。另一方面，与东海道军并行、向偏北方向进发的东山道军，则于木曾川的河合、大井户等渡口处与京都方面军交战。当日晚，大井户之战吹响了战斗的号角，东西两军在周边各渡口展开激战，战斗持续至第二日。京都方面的山田重忠等人虽一度浴血奋战，但大多数的京都军仍选择不战而逃。于是，幕府军长驱直入、势如破竹。
据慈光寺本的《承久记》记载，当时藤原秀澄曾提出可以将一万二千人的大军分别布置在大井户、板桥、伊义、大豆户等十几处战略要地，但山田重忠却反对该计划，他认为这一万二千人的*队军**应该横渡墨俣，一口气打下尾张国的国府，拿下东海道军的首领北条泰时和北条时房，继而突入镰仓。藤原秀澄素来胆小，因害怕山田重忠这种积极应战的策略会遭到北陆道军和东山道军的包抄，他最终还是选择坚持自己的持久战策略。不过，由于此事并无其他的史料记载支持，所以事实如何，真假难辨。但是，考虑到该地区的战事对整个承久之乱而言极为重要，所以上述记载恐怕也并非无稽之谈。
从地势上看，东山道军及东海道军都受到了木曾川、长良川及揖斐川这三大河及其中小支流的阻挡，所以在这一地区幕府军难以摆开阵势。然而，只要通过墨俣，便会有能让东山道军、东海道军汇合后排开阵势的地理条件。所以，对于京都方面军而言，想要更加有效地守住西侧，比起将兵力分散至各个中小渡口，不如集中全力死守墨俣。此外，若是想用少量兵力进攻东侧，就应该趁东山道军和东海道军汇合前，选择其中一路军，将其击破。撇开山田重忠的策略不谈，藤原秀澄这种兵分几路的做法，反而更容易让敌方逐个击破。因此，无论怎么考虑，藤原秀澄的计谋都不是上策。
从兵力上看，纵使数据存在一定的误差，但东国方面的兵力毫无疑问占有绝对优势。但是，东国大军果真如我们所见这般团结吗？例如，在美浓东大寺的对话中，东山道的大将武田信光就曾向小笠原长清表示，身为武士自当是京都和镰仓哪一方获胜了就跟随哪一方。由此可见，武田信光的自我盘算可谓相当清晰。正因抱着这种“识时务”想法的人影响力十分巨大，所以大江广元、入道善信和北条政子等人及经历过治承寿永之乱的人才会不约而同地主张早日攻打京都。
正如后续章节将会提及的，京都方面军几乎全都来自畿内近国，若是来自中国、四国及九州的兵力支援能够及时赶上，想必承久之乱的结局也就不如今天这般了。因而，为了争取时间，在美浓和尾张的三川地域打一场漂亮的攻防战，对京都军而言本就十分重要，但相当遗憾的是，京都军的第一道防线，很快就被幕府军攻破了。六月七日，东山道军、东海道军两军合流，共同驻扎在野上和垂井。两军在当日即举行了军事会议，商讨攻打京都的人员配置问题。最终会议决定：势多由北条时房负责，手上由安达景盛和武田信光负责，宇治由北条泰时负责，芋洗由毛利季光负责，淀由结城朝光、三浦义村等人负责。
最终防线——宇治川渡河
八日，京都方面的藤原秀康、筑后有长等人，身负战伤，返回京都，并带回了六日战败的消息。院中闻讯之后，一片骚动。仲恭天皇与三位上皇及二位亲王，移驾法印尊长的押小路河原宅邸，紧接着又借助比叡山的力量，转移至坂本。然而，比叡山的兵力并不足以抵御幕府方面军。十日，他们不得不再返高阳院（或四辻殿）。
十二日，京都军将兵力分散配置到以宇治为中心的三穗崎、势多、真木岛、芋洗及淀等地，以迎接幕府方面军的攻击。可以说，这已经是京都军的最后一道防线了。
在小路上稍作休息后，幕府军在十三日的大雨之中，按照计划奔向了各自负责的地点。山田重忠及其手下将桥上的木板拆了做盾牌，他们与比叡山僧众组成的*队军**联合，和幕府军方面负责势多的北条时房*队军**展开对峙。毛利季光与三浦义村等人则分别前往芋洗和淀，北条泰时也在栗子山布下了军阵。
然而，负责宇治的足利义氏和三浦泰村并未征得北条泰时的同意，便在宇治桥周边开战，该决定导致多人丧命于京都军的箭雨之中。当日深夜，收到宇治战报的北条泰时大为震惊，于是连夜冒着大暴雨赶赴宇治，命令幕府军停止战斗。次日即十四日，整夜的暴雨使得宇治川水位上涨，众多准备渡河与京都军展开战斗的幕府军将士被湍急的河水冲走，一时间死者超过八百人。身着铠甲一路杀向京都的幕府军，原本就已经十分疲劳，再加上粮草补给的不足，一旦丧失士气，劣势必将逐渐扩大，甚至将会面临溃不成军的危险。一面犹豫是否要渡过宇治川，一面眼睁睁地看着湍急的水流冲走士兵，北条泰时甚至一度做好了“大将军将葬身于此”的思想准备。
距离承久之乱已过了半个多世纪时，高僧日莲这样记述在承久之乱中前往宇治和势多的东国*队军**：“同年六月十三日夜晚戌亥时，乌云压顶，宛如车轴声般轰鸣的雷声在武士的头顶响起，随即大雨如注，从天而降。十九万士兵长途跋涉，已然兵荒马乱、弹尽粮绝，乡间的屋舍皆不见人，头盔被大雨淋湿犹如棉花一般。”作为后世之人，日莲对那时发生之事不可能知道得如此详尽，毫无疑问这些内容应该都来自传闻，不过其中对东国将士的描写，应该写得八九不离十。正如日莲所言：“过了今日，将士之心恐生叛变。”当时，若是再过数日仍无法横渡宇治川，那么庞大的*队军**将被层层瓦解，甚至如雪崩般四散分裂。因此，幕府军的胜利并不是易如反掌的。
北条泰时为了闯出一条新路，决意渡河。于是，他派芝田兼义先去探明各处河水的深浅。在此基础上，佐佐木信纲、中山重继及其率领的武士得以成功渡河。而后，幕府军拆了许多民房，做成木筏，并凭借这些木筏成功渡河。一时间两军局势发生逆转。京都方面，源有雅、高仓范茂及安达亲长等将领，纷纷逃窜。剩下的藤原朝俊、八田知尚等人不是被杀，就是溃败而逃。于是，承久之乱中规模最大的战事，就此落下帷幕。
毫无大义可言的战争结果
京都军全线溃败后，藤原秀康、三浦胤义、山田重忠等将领返回上皇御所门前，报告了战败的情况。谁知得到的却是无情的回答：“若武士皆聚于此处，镰仓方面定将*攻围**此处，尔等还是尽早散去罢。”听闻此言，三浦胤义不禁自嘲，当初自己为何要背叛幕府，跟随一个毫无责任感的主君。随后，京都方面的将士各自散去，三浦胤义在木岛自杀，山田重忠在嵯峨的般若寺山自尽，而藤原秀康则被敌军擒获并处死。
六月十五日巳时，北条泰时、北条时房等人进入六波罗，从北陆道进军的北条朝时也于十七日午时，抵达六波罗。而早在北条泰时等人尚未进入六波罗之前，后鸟羽院便已经派遣敕使大夫史国宗，前往樋口河原解释：“此次战争，绝非吾之计谋，而系谋臣之意。吾已命人下达院宣，望东国*队军**绝不要在京都寻衅滋事。”北条泰时和北条时房等人抵达六波罗后，一面搜查、处死京都军余*党**，一面派遣使者火速赶回镰仓传达战报，以便询问北条义时如何*功论**行赏，如何处置后鸟羽院等上皇及仲恭天皇。虽说承久之乱中的死伤者人数并不确定，但根据慈光寺本《承久记》记载，约有一万三千六百二十名从东国出发进攻京都的幕府军将士战死或溺亡。而之所以会有这样惨烈的结果，全是因为专横的后鸟羽院引发了这场毫无大义可言的战争。
谋划了承久之乱的公卿和僧侣：叶室光亲、中御门宗行、源有雅、高仓范茂、坊门忠信、一条信能、长严、观严等人在被送往六波罗后，皆被处以死刑或流刑。后鸟羽院的宠臣叶室光亲，因为是下达追讨北条义时院宣的责任人，因而遭到问罪。但实质上叶室光亲曾多次劝阻后鸟羽院，放弃这种轻率鲁莽的计划，无奈后鸟羽院依然一意孤行，叶室光亲只得被卷入其中。据说，后来当北条泰时看到留在御所中的叶室光亲的数十通劝谏奏折，一度为当初自己所下之决断感到分外后悔。
七月七日夜，关东派出的使者二阶堂行盛抵达藤原基通的宅邸，向其传达了镰仓方面的请求，即罢免九条道家摄政一职，并让前关白近卫家实担当摄政和氏长者。于是第二日即七月八日，近卫家实就任摄政一职。七月二十日，根据幕府的奏请，朝廷给予前内大臣源通光、权大纳言源定通、权中纳言源通方、参议藤原亲定、参议藤原信成、前权大纳言藤原定辅、前权中纳言藤原教成等人“禁闭”处分。另一方面，素来亲近幕府的西园寺公经，在这样的新朝廷体制下，成为内大臣，手握实权。
另一方面，搜查在逃的尊长、藤原秀康、大内惟信等人的工作仍在继续。藤原秀康与藤原秀澄两兄弟在逃往奈良后一度销声匿迹，后来当他们逃到河内时被擒获，随即就地处决。大内惟信则在隐姓埋名近十载之后，因假扮僧人藏身于日吉八王子的庵室之事暴露，于1230年12月被比叡山恶僧擒获，送交武家。最终，大内惟信死罪得免活罪难逃，被判流放西国。至于尊长的结局，此处暂且不说。
而这一连串事件的焦点，毫无疑问落在了如何处置后鸟羽院等三位上皇及仲恭天皇的问题上。幕府在这一点上态度十分强硬。纵使后鸟羽院在院宣中宣称：“此次战争，绝非吾之计谋”，幕府也没有让后鸟羽院免除问责。最终，后鸟羽院被流放隐岐，土御门院被流放土佐（后称阿波），顺德院被流放佐渡，而被迫退位、年纪尚小的仲恭天皇则被交由九条家抚养。后鸟羽院的宠妾龟菊，一度被视为承久之乱的祸首之一，直至延应元年（1239）后鸟羽院离世，龟菊一直侍奉左右。
此时，高仓院的皇子，即安德天皇之弟、后鸟羽院之兄——守贞亲王，逐渐步入舞台的中心。守贞亲王原本是随安德天皇去了平家一方，并且从一开始他就没有被列入安德天皇的继承人候选之列。所以，当他平安返回京都时，人们几乎已经忘了他的存在。然而，在突如其来的情况下，已被人们遗忘的守贞亲王之子，当时仅有十岁的茂仁亲王，却于承久三年（1221）七月九日，经镰仓幕府批准后，即位成为新任天皇。其已经出家的父亲守贞亲王，也由此直升为上皇（法皇）。而此处的茂仁亲王即是后来的后堀河天皇，其父守贞亲王便是后来的后高仓院。