浙大人来回答这个问题吧。
按照排名，浙大算第三。已经三了好多年了，当然，不同版本的排名可能会略微有点出入。毕竟排名这个东西，不同版本的侧重点是不一样的。
浙大，其实非常不容易。刚开始，国家其实并不是非常待见浙大。毕竟，浙大，在浙江……您懂的！当年民国时期还有中央大学不也……
然后把浙大给拆了，拆了几十个部分。包括复旦当年的核心学术力量其实来自浙大。还有很多大学和科学院的学术底子也是如此。
当时，被拆分后的浙大，在老校长的带领下，一步一步重新回到顶尖大学系列。回到了全国第三。我觉得能回归，主要有三个原因吧：
1、教学严谨。当时浙大对学术的严谨性要求极高极高。什么考试作弊？当场开除！平时对学术要求极高极高，但是学校对学生的人文关怀非常到位。让学生觉得温暖，但是严苛。加上浙大在杭州，远离大城市的喧嚣，相对还算是个安静做学问的地方。
2、人才集中。浙大的一个诟病就是浙江本地招生多。但是江浙自古产状元呀，本来浙江的人才比例就不算太弱。江苏还很多好大学呢，浙江当时牛校除了浙大，也没什么了（艺术类等除外），所以虽然算本地生多，但是生源质量其实也还好。
3、地方上支持。可能浙大算是浙江唯一的985吧，所以当地人也喜欢支持浙大。虽然国家对浙大的经济方面拨款不算特别多（当年），但是不少当地人，或浙商，会支持浙大。比如邵逸夫等……当然，邵逸夫不只是支持浙大哈，全国到处支持的。就是浙大可能支持力度也不算弱。
但是呢，说浙大是第三，不过在北京的认可度，未必比人大高，甚至有时候会不如北理工。核心未必是学术能力问题，而是城市吸引力。比如上海的学生，也许宁可去同济也未必优先考虑浙大。北京的孩子，也许会优先考虑北航也未必先考虑浙大。类似道理。因对于选择一个大学来说，还有很多参考因素：
1、城市吸引力。就如前面说的那些问题。浙大虽然排名还算靠前，但是杭州和上海、北京相比，城市吸引力相对弱一些。因此，在相近排名的情况下，很多人会优先考虑上海北京的学校。
2、专业特色。浙大有几个专业的确是全国领先的，但是很多学科不如别的学校。不只是清北，还有很多其他C9，甚至985，也许某些专业方面会比浙大强，这其实很正常。从国家对大学建设角度，也是希望未来大学更重视学科建设。
因此，浙大在大学排名，大致情况下是第三。但是那只是一个参考，其实实际意义并不大。还是要更细分角度去看问题。