在现代的考古过程中已经运用到许多高科技手段，据国外媒体报道考古人员使用雷达扫描技术在墨西哥的南端发现一处3000年前的玛雅遗址，这是通过激光雷达在高空对地面进行扫描绘图后发现的，这处新发现的玛雅主城建筑的长度大约在一公里左右，在主城周围还能看到一些房屋和道路的痕迹，研究人员认为这座古城是目前所有玛雅文明中规模最大和最古老的遗迹，其中可能还包括一座最古老的阶梯形金字塔。
如果直接看该区域是无法知道这里有一座玛雅古城，可以说雷达技术能发现许多人工难以发现的细节，由于中美洲地区遍布热带密林，而玛雅文明的建筑就处于这些密林深处，发现玛雅文明的考古人员形容主要是依靠当地人在森林里劈出一条道路，才发现那些覆盖在雨林里的玛雅遗迹，而且许多遗迹已经很难辨认，比如在这次新发现的玛雅遗址上已经被农田和道路改变原来的样子，如今通过激光雷达完成的工作需要人工数十年才能做到。
事实上早在多年前就通过雷达在森林中发现过玛雅古城群，随着玛雅遗迹不断被发现，关于这个在密林中消失的古文明的谜团也越来越多，人们无法想象玛雅人是怎么在热带雨林中建造了上百座城市的，而且玛雅城市中的建筑风格不同于地球上其它任何文明，玛雅人会把金字塔直接建在城市中的各处，在下图中甚至能看到一些房屋旁边就是小型的金字塔建筑，似乎古玛雅人对待金字塔比古埃及人要随意得多。
这次墨西哥南端发现的玛雅古城虽然年代久远，但地位可能曾属于玛雅文明的核心，在古城中有一座1.4公里长10米高的矩形平台，然而对这座平台进行考察以后发现其作用特殊，是用来追踪太阳在一年中的位置变动和举行各种大型仪式的场所，玛雅人有极其丰富的天文知识，他们在数千年前就知道地球并不是宇宙中心，而且还精确地算出地球周围行星的运行周期，在这个巨大矩形平台上依稀还能看出当时玛雅人祭祀的宏大场面。
在此之前最大的祭祀平台是在提奥提华坎遗迹中的，这座巨大的古城有玛雅遗迹中最大的两座金字塔和最宽的街道，当阿兹特克人在墨西哥密林中发现这座空无一人的古城时，认为是找到了天神居住的地方，对这座城市进行考古研究后认为这里至少能容纳两万人以上，即便是现在来看提奥提华坎古城也会觉得奇怪，虽然古城中的建筑基本保持原样，但这些建筑的构造却看不出是给人类居住的，但城市中也找不到人类居住的痕迹，而新发现的祭祀平台规模比提奥提华坎古城更为庞大，为什么没有代表性的金字塔建筑呢？
在中美洲所有的玛雅遗迹中都有金字塔建筑，这曾是人们在密林中寻找玛雅遗迹的方式之一，玛雅金字塔与古埃及金字塔非常外表相似但作用却不一样，在玛雅金字塔的顶部还建有一座神庙，通常也是玛雅人举行仪式和祭祀的场所，虽然这些建筑的材料都是从很远的采石场采集出来的，但没有发明车轮的玛雅人是如何在密林中运输石料的还是个未解谜团，而且也没有找到玛雅人为什么要在森林中建造城市的原因。
考古人员相信许多玛雅遗迹还隐藏在中美洲的热带雨林中未被发现，关于玛雅文明的许多答案就在这些未被发现的遗迹中，不过随着时光的流逝一些遗迹已损毁得非常严重了，在秘鲁的卡华驰沙漠中发现的玛雅遗迹就是这样，考古人员在飞机发现了这些痕迹，却因为损毁严重而找不到任何有价值的信息，不过随着这些遗迹的发现，之前认为只存在于中美洲的玛雅文明似乎已延伸到了南美许多地区。
运用先进的技术能解开更多关于玛雅文明的谜团，但是关于玛雅人的去向却可能永远也无法得知了。