治病求本，首见于《素问·阴阳应象大论》的"治病必求于本"。告诫医者在错综复杂的临床表现中，要探求疾病的根本原因，宜采取针对疾病根本原因确定正确的治本方法。是几千年来中医临床辨证论治一直遵循着的基本准则。治病求本的具体应用，除了必须正确辨证外，在确定治则时，必须明确、的概念。
中医治病，有同异治，异病同治的原则性。此法则，是建立在对病因认识的基础之上的。病因相同，症状虽有万殊，可用同一方药治之，此谓治病求本。病名虽同，症状虽同，如果病因不同，治法即有天地之别，有水火之异，叫做同病异治，也是治病求本之故。
关于同病异治，有两种含义：
第一种，病的症状虽同，但病因不同，因而治法用药，就绝然不同。比如同是高血压，肝火者泻其火，肝寒者去其寒，水邪者利其水，阳虚者扶其阳，此皆所谓治病求本。这属于中医常说的同病异治的主要含义。
西医不究病因，只要一量出是高血压，就一律盲目降压。病因不除，降而复升。还以科学姿态自居，此生民之哀也。
第二种，病因症状虽同，所用治法与方药却可以不同，可以五花八门，同样可以取效，也属于殊途同归的一种情况。比如同是湿热引起的小便不利，只要是清热利水药，都能治疗。车前滑石通草鱼腥草，任何一种药物，都可随意取用，应时取效。还可以或点穴按摩，或针灸推拿，这也是属于同病异治的一种情况。
总之在抓住病机，在温凉补泻的大方向相同的前提下，各个医生，所用治法与方药，可以不拘一格，各显神通。麻桂可去风寒，荆防也可取效。芩连能去火邪，栀柏未必无功。张锡纯在其《参西录》中说，茅根石膏同用，可代替羚羊角。比如北京到广州，只要往南的方向没有走错，所走路线，尽可不同。可走小路，可走大路，可坐班年，可坐飞机，同样可到。所用工具虽异，殊途可以同归。这也是中医治病的灵活性的一个方面。
所以当今中医的一个重要任务，在于用浅显明白的科学常识，去阐释中医高深奥妙的科学道理。不如此，发扬中医，就永远只是一句空话。
寻求疾病的根本原因，也就是说病根在什么地方，是什么原因引起的，并针对根本原因进行治疗的辨证论治原则。标与本是一个相对的概念，有多种含义，而且在一定条件下可以相互转化，只有掌握标本转化的规律，始终抓住疾病的主要矛盾，才能做到治病求本。任何疾病的发生、发展，总是通过若干症状而显示出来，但这些症状只是疾病的现象而不是本质。只有通过综合分析，透过现象寻找到本质，找出原因，才能确立相当的治疗方法。例如，头痛症状可由多种原因引起，肝阳上亢所致要用平肝潜阳法，外感头痛用解表法，痰湿头痛用燥湿化痰法，瘀血头痛用活血化瘀法等。临床运用治病求本这一法则时，还须正确掌握"正治与反治"，"治标与治本"。
正治是临床常用的治疗方法。多数疾病的症象与疾病的性质相符，采用"寒者热之，热者寒之，虚则补之，实则泻之"，即逆者正治。反治通常指一些复杂、严重的疾病所表现出的假象而言，其实质还是正治，如外感热病，里热极盛，阳盛格阴所见到的四肢厥冷的寒象，仍需用寒凉药物治疗，叫"寒因寒用"，即从者反治。一般情况下，治本是一个根本法则。但如标病甚急，则应采取"急则治标，缓则治本"的法则。如大出血病人，无论何种出血，总以止血为应急措施，待急症缓和后再治本病。病有标本缓急，治有先后。如标本并重，则应标本同治。如外感热病过程中的"急下存阴"法，表证未解里证又现的表里双解法等。