乙肝两对半第三项e抗原阴性的慢性乙肝是“小三阳”的一种，是指表面抗原（HBsAg）阳性、e抗原（HBeAg）阴性、e抗体（抗HBeAb）阳性和核心抗体（抗HBcA）阳性的慢性乙肝。
e抗原阴性慢性乙型肝炎是如何形成的？
在多数患者长期的慢性乙肝病毒感染过程中，通过治疗或者自身免疫逐渐清除病毒，随之变为感染静止的小三阳肝功能正常,血液中检测不到乙肝病毒(HBV-DNA)；但另外的一些患者血液中乙肝病毒浓度并未降低，也出现了e抗原（HBeAg）转阴，这些患者就称之为e抗原阴性的慢性乙型肝炎。这些患者按传统的说法也是“小三阳”，但与静止的“小三阳”却不同，这类患者仍需要积极治疗。
e抗原阴性的慢性乙型肝炎一般发生在慢性乙肝病毒感染的后期。乙肝两队半显示为：乙肝表面抗原HBsAg(+)、而乙肝e抗原HBeAg(–)、乙肝e抗体HBeAb(–)或(+)，这种状态超过半年；乙肝病毒持续复制，血清HBV DNA水平高于1E+003 IU/ml（一般常规病毒检查范围）；病情长期活动变化，转氨酶持续或间歇性大于正常值的1.5倍以上。
e抗原阴性慢性乙型肝炎是病毒与人体免疫系统斗争的结果
e抗原阴性的慢性乙型肝炎一般都由发病多年的e抗原阳性病情转变而来。患者体内的乙肝病毒在与人体免疫系统的长期“斗争”中，为逃避免疫清除，发生了变异。这种变异的病毒不易被免疫系统识别，清除起来也是非常难的。慢性乙肝病毒感染在血清e抗原（HBeAg）转阴的同时或其后病变活动，也有静止多年后才活动的，病变活动就成为e抗原阴性的慢性乙型肝炎。
为什么e抗原阴性的慢性乙型肝炎常被忽视？
e抗原阴性慢性乙型肝炎的转氨酶往往只是轻度增高，也没有明显症状，不定期检查常不被发觉；即时发觉了用一些保肝降酶药物短期内就可降至正常，误认为病情已经控制了；血液内病毒水平也较低，口服核苷类似物药物，在不长的时期病毒就能转为阴性，误认为病情已经“痊愈”了。但停药后非常不稳定，病变常持续低度活动、或间歇性活动，也可能长期静止后“忽然”急性加重。这种变异后的病毒复制活性不是很强，“毒性”也相对较低，因此感染水平不高，炎症反应也不很严重，所以大多数医生和患者都不容易重视。
为什么许多e抗原阴性慢性乙型肝炎的病情更严重？
e抗原阴性慢性乙型肝炎的病情一般可以暂时控制病情，但很少有能自发性痊愈。
e抗原阴性慢性乙型肝炎的严重性：
1、变异病毒的复发率非常高，抗病毒治疗的效应短暂，持续作用率很低；
2、病情易隐匿，病变逐渐积累，可在“无症状”或“轻度肝炎”的过程中发展成晚期肝病，发生肝硬化的几率较高，根据以往发展成晚期肝病的患者中大多数为e抗原阴性慢性乙肝。
要对e抗原阴性慢性乙型肝炎的病症做出准确的判断是要比e抗原阳性病例困难得多。据不完全统计100例e抗原阴性慢性乙型肝炎中，大约有30例已经是早期肝硬化或轻度肝硬化了。