一、济宁医学院附属医院
医院拥有两个院区，即院本部和太白湖院区，开放床位4100张，在职人员5700人，博士、硕士1966人，承担着鲁西南地区2000多万人口的医疗保健任务。
二、济宁市第一人民医院
济宁市第一人民医院始建于1896年，目前， 医院分总院区、东院区和西院区，设置床位4200张，开设临床医技科室59个，就诊病人辐射山东、江苏、安徽、河南4省的30个县市区，是济宁及周边地区医疗急救和保健康复中心。
三、济宁市中医院
济宁市中医院始建于1959年，是国家三级甲等中医医院，省级区域中医医疗中心建设单位，拥有总院区、康复分院两个院区，是济宁市集中医、中西医结合医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的大型综合性医院。总院、分院融合发展，倾力打造区域龙头中医医院。
四、山东省戴庄医院
山东省戴庄医院（山东省安康医院、济宁市精神卫生中心）始建于1952年，医院为山东省精神专科区域医疗中心，连续2年荣获全国三级公立医院绩效考核*级A**，位列精神类专科医院前十名。占地220余亩，建筑面积12万余平方米，开放床位2200张，现有在岗职工1118人。
五、曲阜市中医院
曲阜市中医院始建于1987年，现已发展成为一所占地49.4亩，业务用房4.5万余平方米，集医疗、预防、教学、科研、保健和康复为一体的综合性三级甲等中医医院。
六、兖矿新里程总医院
兖矿新里程总医院是新里程医院集团旗下医院，是当地唯一一家国家三级甲等综合医院。医院是中国科学院大学附属医院、济宁东部区域医疗中心、济宁医学院附属医院及国家矿山救护中心兖州分中心。医院设院本部、东院区，下辖7家直属分院、9家直属卫生服务站，总床位近2000张。
七、济宁市妇幼保健计划生育服务中心
济宁市妇幼保健计划生育服务中心创建于1964年，隶属于济宁市卫生健康委员会，中心占地面积2.14公顷，建筑面积2.2万平方米，现有职工420余人，其中专业技术人员380余人，副高以上职称50人。设置保健科室6个，临床医技科室12个，社区卫生服务中心1个，开放床位150张。
