抚仙湖的美不仅美在风光，更美在水很清、很干净。抚仙湖的水质长期持续保持Ⅰ类标准，2020年在中国81个水质良好湖泊保护绩效考评中名列第一。
那么，抚仙湖的水为什么这么清呢？
第一个是自然原因。原因一：抚仙湖湖水主要来自 雨水 聚积。
原因二：流入抚仙湖的梁王河、东大河、西大河，源头都在沿湖一带山脉，长度都没有超过10公里，无浑浊之泥沙。洪水季节会带一点泥水，但雨过即停。从南边汇入抚仙湖的水，先是注入星云湖进行了沉淀，再经1公里长的海门河流放入抚仙湖，已经很清了。
原因三：其他抚仙湖接纳的补给入多为山泉水，清澈干净。比如西大河水源主要是西龙潭泉水，这股泉水每天以5万多立方米的水量涌出，流程也只4公里左右。又如热水塘的泉水就在湖边，有的就出在湖底，更是没有任何泥沙。
原因四：抚仙湖为深水湖，平均深度近100米，最深处159米，接受沉积泥沙能力强，大风大浪也难以翻起浊水。加之抚仙湖地处云贵高原，湖水温度较低，湖中的 挺水植物 和浮游植物不易生长， 浮游生物 以及底栖生物如螺蛳、蚌、虾也很少，只在沿湖浅水一带才有生长，这也使湖水更清更净。
第二个是当地政府的保护。抚仙湖储备的Ⅰ类淡水资源量占国控重点湖泊水Ⅰ类水资源的91.4%，是国家水Ⅰ类水资源的重要宝库。近年来，云南省和玉溪市政府对抚仙湖的保护力度很大，采取了很多行之有效的措施。
举措一：2017年，抚仙湖地区被纳入中国山水林田湖草生态保护修复工程试点，云南省、市、县各级围绕突出问题，推动抚仙湖流域整体保护、系统修复和综合治理，探索生态产品价值实现机制。
举措二：实施了抚仙湖环湖生态移民，搬迁3万余人，采取“进城、进镇、进项目”的方式进行集中安置，将腾退空间用于还湖、还水、还湿地。
举措三：治理过程中还探索出生态型产业发展之路，将水、肥、农药需求量大的农作物全部替换为低污染农作物，重点发展蓝莓、荷藕等特色农业，以旅游重大项目为切入点，发展高原特色生态观光休闲农业和旅游艺术衍生品制造加工业，打造农业观光体验、健康养生、商务会议、运动休闲4类品牌。
正是由于得天独厚的天然优势和当地政府的不解保护，才使云贵高原这颗“蓝宝石”般的湖泊的水更清更净，永远保持着它纯净美好的面貌。
