这时的西班牙已经倒向法国，与英国处于交战状态。2月14日凌晨，杰维斯率领15艘战舰与西班牙的27艘战舰在大西洋圣文森特角海区遭遇，杰维斯果断地决定以一路纵队切断敌舰队前后的联系，打乱敌阵线，然后集中力量围歼敌后续编队。可是杰维斯没有考虑到一些变化着的因素。当时的军舰实际上都是武装帆船，所以受风力影响很大，速度亦很慢，杰维斯的舰队按预定方案从西班牙舰队队列中实施穿插，将其一分为二后，前列掉头缓慢，如果等整个舰队全部掉回头来，西班牙舰队就有脱逃的可能。
这时纳尔逊的军舰正好在整个舰队的尾部，他见状不妙，于是断然地违背了当时严格的作战条令，在没有得到舰队司令同意的情况下，擅自率舰冲出队列，一举截断了西班牙舰队主力的逃路。在杰维斯的主力赶来援助之前，纳尔逊同时受到七条敌舰的攻击，但他毫不惧怕，勇敢指挥，终于以近战打垮了敌人的反抗，并且还俘虏了两艘敌舰。他的行动对英国舰队赢得胜利起了决定性的作用。当战斗结束后，纳尔逊前往旗舰晋见杰维斯。杰维斯非常激动地拥抱着他说：“我真不知道该怎样感谢你。”圣文森特海战后，纳尔逊荣获了少将军衔。
1797年7月，纳尔逊奉命进攻西属加那利群岛的特拉里夫岛。当时战斗异常激烈。纳尔逊指挥部队登陆时，敌人的一颗*弹子**击中了他的右肘，使他最后失去了整个右臂。由于他在皇家海军奋战多年，四次参加舰队作战，三次参加小艇作战，占领过三座城市，俘虏过7艘敌舰，6艘巡逻炮舰，实际参战120余次，战功颇多，在战斗中失去了右眼和右臂，为此，英国国会通过了给他每年1000英镑的伤残奖金的议案，并封他为巴斯爵士。
当纳尔逊第一次去领取伤残奖金时，海军部的一个办事员因纳尔逊没有证明文件而拒绝办理。纳尔逊只好去办有关手续，当他把右眼伤残证明交给那个办事员时，那个人很惋惜地对纳尔逊说：“钱确实太少了，只相当一个上校的年金。”纳尔逊幽默地说：“不忙，这只是一只手的数目，我还有一只手的，将来还可以加上一条腿。”说完，就把那张右臂负伤的证明掏出来扬了扬，好像那是一个有趣的东西。