关于淋病的病因，祖国医学曾从运气学角度论述了淋病的病因。"初之气，地气迁……其病中热胀，……小便黄赤，甚为淋。"二三气，阳气布，风乃行，春气以正，……其病淋，指出了一定的气候因素与疾病的发生有着内在的联系。《素问.本病论》说"厥阴不迁正，即风喧不时，民病淋溲。""太阳不退位，而取寒暑不时，泄注淋满。"阐述了自然界六气的异常变化，节令不时，寒暖失常对淋病发生直接有影响的观点。
《华氏中藏经》提到淋病与脏腑气血失调有关，降育。巢元方在《诸病源候论. 诸淋病候》对淋病的病位，病因航机阐发更为详尽。巢氏指出∶"诸淋者，由肾虚而膀胱热故也""若饮食不节，喜怒不时，虚实不调则膀胱不和，致肾虚而膀胱热也。"结果则导致"肾虚则小便数，膀胱热则水下涩，数而且涩则淋漓不宣，故为之淋。""气淋者，肾虚膀胱热气胀所为也。""其状膀胱小腹皆满，尿涩常有余沥是也。""劳淋者，谓劳伤肾气而生热生淋也。引小腹痛，小便不利，劳倦即发也。"揭示了淋病有"劳倦即发"的复发特点。
对淋病的病因病机从古至今经各代医家不断充实、提高，已形成一个比较完整的理论体系。现代医学对淋病的认识更加深入、广泛，认为下焦湿热，脾肾虚损或气血瘀滞影响脾、肾、膀胱等脏腑气化功能，致使三焦水道通调不利为淋病的主要病因病机，常见有三类∶
（1）下焦湿热
湿热之邪受自于外，或由内而生。由外者多因移浊之邪从孔窍侵入膀胱，或感受湿热邪气由其脏腑传入膀胱。生于内者多由身体湿热内盛，或恣食辛热肥甘，损伤脾胃，运化失常，酿成湿热，湿热之邪下注膀胱，气化失司则水道排失序而发为淋。
（2）脾肾虚损
先天禀赋不足，身体虚弱或因房事伤肾，或久病及肾，或年老肾气虚衰招致外邪所侵，引起下焦气化失常。水道不畅而成淋.或饮食不节，劳倦过度，脾失运化，湿浊不流，影响膀胱气化而成淋。
（3）气血郁滞
情志不调或七情过度则肝失疏泄、日久气郁化火，火邪下犯膀胱致气化不行，或因思虑操劳太过，伤及心脾致气血流行不畅，脉络阻滞，气滞血瘀则三焦水道不利而发为淋。 236
淋病在病因病机上有其共性，但又有不同的病机变化和发展规律，因此掌握各种淋病的特征，详细辨别其属性，方能正确诊断与治疗。