西南区，包括重庆市、四川省、贵州省、云南省、*藏西**自治区共5个省市自治区。是国家战略“西部大开发”主要区域之一，肩负着西部崛起，中国全面现代化重任。
在西部，科教文卫全面落后东部沿海是不争事实，但也不能一概而论，至少西部有顶尖医院不输东部就是亮点，西北的西京医院、西南的华西医院都是综合实力常年居于国内前十，特别是华西医院，长期稳坐国内第二，有力保障西南甚至整个西部地区人民生命安全。
西南地区，四川华西医院无悬念独一档，重庆表现也亮眼，有陆军军医大学、重庆医科大学坐镇，无愧为直辖市，不输天津。云南、贵州地处偏僻，历来缺医少药，表现中规中矩，相对弱势。
西南地区有我国多所知名的医学院校，四川大学华西临床医学院、陆军军医大学、重庆医科大学、昆明医科大学、贵州医科大学等。每所学校都直属好几所实力雄厚的附属医院，四川大学、陆军军医大学都是医学院校上的皇冠，堪称医学阵营第一梯队。当然还有西南医科大学、川北医学院、遵义医科大学等地方独立医学院校，都是医学特色，办学突出的省属高校。
华西医院、西南医院、重庆医科大学附属第一医院应该是排名前三甲，而且优势十分明显，都是国内极具竞争力医院，常位居国内各大医院综合排行榜前列。昆明医科大学附属第一医院、贵州医科大学附属医院也实力不俗，各自代表云南、贵州两地最强医疗水平。
如果以国家级重点临床学科（专科）来代表国内一流医学学科实力，来量化比较的话，西南区的重点学科基本集中在四川、重庆两地大医院手中。前三甲医院自不必说，多如牛毛。后面的陆军军医大学的第二、第三附属医院新桥医院、大坪医院各都有10个，重庆医科大学附属第二医院有7个，四川省人民医院也有6个，都是总体实力在西南前列，全国响当当。
还有专科医院的强势专科，如华西第二医院在国家卫健委三级公立医院绩效考核中位列妇产医院专科系列第1名，华西口腔医院是国家口腔医学中心的主体建设单位，重庆医科大学附属儿童医院是国家儿童区域医疗中心建设单位，这些专科医院都是在西南数第一，全国名列前茅，专科排行榜单上前三的常客。
讲到西南地区，西南医科大学也是不可忽视的力量。虽然西南医科大学更名过程闹得沸沸扬扬、更名后校名太大被人吐槽，但是除了泸医，还真谁也戴不了，身处川渝滇黔西南四省市结合区域冠名西南医科大学也不为过。
其本身实力也不弱，临床医学在ESI全球排名在前1%，临床医学、药学、中西医结合都是极具竞争力的优势学科。虽然现在的发展在独立医学院校中比较一般，但长远看，凭借区域优势地位，有朝一日学科发展不能同年而语。
西南医科大学
西南地区医院，有7家医院上榜复旦版医院百强，既有医院金字塔尖的四川华西医院，有*队军**系统的西南医院、新桥医院、大坪医院，还有地方医学院校的附属医院，共同组成了西南健康防线，保障西南地区生命健康安全。