上海航天电子有限公司，又称“上海空间电子设备研究所”（代号“五三九厂”），隶属于中国航天科技集团公司航天时代电子技术股份有限公司，*党**群工作由上海航天局代管，是国内最早从事航天产品研制，集研究、设计、试制、生产以及环模试验。公司股东为两家，航天时代电子技术股份有限公司出资6050万元，占公司注册资本的90．03％，航天长征火箭技术有限公司出资670万元，占公司注册资本的9．97％。地址：上海市嘉定区叶城路1518号，占地面积12万余平方米。
该公司前身是中国科学院上海办事处器材厂，创建于1957年5月26日，厂址为上海市徐汇区岳阳路320号，主要承担科学实验仪器修配的精加工任务；1958年9月，在淮海中路1800号扩建电子车间，12月改名为“中国科学院上海分院科学仪器厂”。1960年，该厂与上海分院科学仪器二厂合并，定名为中国科学院上海科学仪器厂，由中国科学院新技术局领导。1961年3月，该厂迁至嘉定，主要承担电子测试仪器、近代物理仪器和电子模拟计算机的研制生产。1968年3月，该厂划归国防科委第五研究院（以下简称“五院”）。1973年7月，五院划归第七机械工业部建制，该厂改为国营五三九厂。1978年1月，该厂恢复上海科学仪器厂名称；10月起，由第七机械工业部五院和上海机电二局双重领导；1979年1月，单位性质由事业单位变更为企业单位。
1989年9月，该厂以上海科学仪器厂名称正式工商注册；1992年经航空航天部核准，开始使用上海空间电子设备研究所名称，实行企业化管理，与上海科学仪器厂为一套班子、两块牌子。2002年，该厂整建制划入中国航天科技集团公司所属的航天时代电子技术股份有限公司，部分资产与火箭股份（股票代码6008791）相关资产进行置换，成立上海航天电子有限公司，2003年1月8日依法完成工商注册。2009年6月，该公司从上海市嘉定区环城路1600号旧址搬迁至现址。
该公司致力于成为国内外有影响力的以综合电子产品为主、精密机械产品为辅的制造供应商，主要提供宇航、综合电子和*器武**系统的测控、数据处理，通信、天线及微波、信号处理，系统集成、计算机以及相关精密机械设计、加工制造等专业产品，同时为用户提供增值服务。该公司于1978年研制的磁芯存贮器，解决了某卫星运行中延时遥测信息的重大难题；1982年研制的某系统中的遥控发射机、遥控台、外控台、同控台和测轨终端，应用于中国第一颗通信卫星；1988年研制的新一代中低轨道卫星和运载工具的超短波统一测控系统，其技术先进性和可靠性达到国际同类产品水平；2004年通过对某型号遥控接收单元的开发，实现用同样线路和接口完成不同卫星的遥控数据和指令处理；2005年成功开发定型ＵＳＢ1应答机产品，广泛应用于后续型号；2009年成功开发ＵＸＢ应答机，直接运用于嫦娥系列型号，迅速占有该领域市场；自主研制的第一台带下位机功能的非相干体制扩频应答机，随某型号卫星成功发射；以测控通信机为技术基础，整合测控、星务、数据传输等相关功能模块，极大地提高卫星的集成度。至2010年末，该公司通过不断延伸原有专业技术领域，以增量技术促进市场拓展，做到星上遥控设备100％、星（船）上温控设备及Ｓ波段应答机90％以上的市场占有率。
该公司自1979年起，贯彻“军民结合”方针，利用军工技术优势，开发生产一系列民用产品。1983年开发生产盔式无线对讲机。1984年研制生产油罐区测控设备，安装于上海金山石化总厂和南京扬子石化公司，达到国内先进水平；成功研制生产Ｓ—201型袖珍式调幅调频立体声收音机。1987年开发生产气象警报接收机获国家专利，被航空航天工业部评为优质产品和科技进步二等奖，获国家三委一部（国防科工委、国家计委、国家科委和外经贸部）*转军**民高技术产品银质奖。1988年研制开发的浸渍复合机，在国内居于领先地位，应用于家具行业材料封边的加工。1988—1990年研制生产甚高分辨率气象卫星云图接收设备，分别安装在全国多处地面站，跟踪接收太阳同步轨道气象卫星和地球同步轨道气象卫星所发射的云图信息，用于气象预报，该设备性能、指标均达国际同类产品水平。1989年为国内自行设计、制造的第一座核电站———秦山核电站生产制造主控室控制盘台和功能分区板，在核电行业得到较高评价，取得进入核电领域设备生产的“核质保”证书。2002年起，该公司改制后实施产业结构调整，逐步收缩民品产业，主要发展军品产业项目。
2010年末，该公司总资产8亿元，职工800余人，其中工程技术人员约占60％；拥有8个职能部门、3个电子事业部、1个电子装联中心、1个机械制造部、1个产品试验中心；配备有完整的设计开发仿真设备及实验室，拥有国内先进的环境试验等仪器设备设施及检测手段，综合研制生产能力强，每年可为各型号卫星配套研制生产千余套电子产品和机械产品。
