刀剑神域动画故事发展到现在，也算步入了正规。桐人已经给拐卖到了“海龟”上，在UW世界中和优吉欧同学卿卿我我中，而我们的亚丝娜同学也寻夫成功。在神代凛子的帮助下，成功混入拉斯的总部“海龟”上。也从菊冈口中得知了“Alicization”计划。
然而实际上，故事发展到现在，为了加快进度，制作组没能忠实的还原原作，删除并改变了部分剧情。就让我们来看下，动画对比小说，究竟删除了什么。
1.比试
优吉欧在砍倒恶魔之树，完成天职之后，村子给予了他重新选择天职的机会。在动画中看上去是顺风顺水的。然而实际上在宴会上，优吉欧面对了现任侍卫长吉克的挑战（就是拦着桐人，不让桐人入村的那个）
在比试中，优吉欧使用了蓝蔷薇之剑（用神器是作弊的，优吉欧同学），并且当场宣告蓝蔷薇之剑是自己的所有物（因为禁忌目录的关系，UW世界只要宣告了所有权，就是属于自己的东西，不用担心被偷窃）。理所当然的，优吉欧用桐人教的剑术和*器武**的优势（其实没有*器武**优势也没关系）击败了吉克。
2.桐人的誓约之吻
桐人在原文中，亲吻了赛鲁卡的额头，并且谎称是剑士的誓约之吻。并且约定一定和尤吉欧一起救出爱丽丝，回到村子里。（桐姥爷，我知道你是想吃豆腐），目的是为了测试自己是不是也会受到禁忌目录的制约。
3.夜空之剑
桐人在上一代伐木工卡利塔爷爷的提点下，利用蓝蔷薇之剑砍下了基家斯西达最尖端的树枝，这是神器夜空之剑的锻造材料。不过按照常理来说，这把*器武**是后期极其重要的道具，不可能什么都没交代，很有可能是后期通过回忆的形式呈献给观众。
4.桐人被拐卖的方式
在动画里，是菊冈主动找到桐人的家属（养母、直叶、明日奈），并且提出了更好的治疗方式。希望桐人转院。在转院的途中，桐人被菊冈滥用职权转移到海龟上。
但是实际上在原作小说中，菊冈可没有和桐人家属商量。直接将桐人转移到海龟上。亚丝娜他们发现桐人不见后，可是真的一点头绪都没有。最后亲女儿结衣直接黑进政府系统，调查了AI相关的预算内容，结合桐人有关打工的事，才将矛头指向拉斯。
5.AI研发的真相
在动画中，为了节省篇幅，将这部分内容直接让菊冈口述出来。实际上这些内容在原作中全是结衣通过政府的数据推测出来的，包括菊冈他们想要研发怎样的AI,以及这些AI的作用是投入战争当中。
原作中有一段结衣自己对于AI类型的探讨，虽然结衣说过自己只是AI,是一种和车载导航没有什么区别的存在。不过光提出这一点，我们就可以知道，结衣已经不仅仅是个AI了，说她是真正的人也是可以的。可惜的是这部分内容被制作组无情的剪去了。
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