朱棣起兵之初凭借对北平一带的多年经营，迅速控制了北平附近州县。然而相较于掌握全国的建文帝他仍然是实力单薄，因此靖难之役的第一阶段朱棣不得不采取守势和内线防御和袭扰作战。在朱棣反叛的消息传到京师后建文帝立刻调集兵马平叛。由于朱元璋大肆清除开国功臣，建文帝只好让少数幸存的老将耿炳文出山主持平叛工作。
然而朱棣在耿炳文立足未稳的情况下偷袭雄县并击败了耿炳文主力。耿炳文随即采取守势带领大军在真定坚守不出，朱棣*攻围**数日不克只好撤回北平。之后建文帝又派曹国公李景隆代替耿炳文主持平叛工作。然而李景隆是个草包没能打下北平，只好在朱棣回北平的路上打算盘，于是在朱棣回来的时候在郑村坝与朱棣展开了激战但李景隆被打败了。
之后李景隆与朱棣再次相遇于白沟河，这次李景隆让朱棣着实吃了一番苦头。因为李景隆一方使用了火器，这个火器不是大家以为的枪支什么的，而是一个名叫一窝蜂的类似于地雷的一个东西。然而幸运的是在其中的一次小战役时突然刮起了一阵强烈的东北风，原本扔到燕军阵地的一窝蜂现在也让官军好好吃了一次苦头。
虽然李景隆使用火器给朱棣带来了很大的困扰，但朱棣仍然取得了靖难之役的胜利。朱棣的战争路线主要从北京出发向南进攻南京。在战争过程中朱棣的*队军**经历了多次战争，路线也出现了多次调整。
起初朱棣的部队主力集中在北方打着清军侧的旗号进行谋反叛逆，得到了很多响应和支持。随后朱棣便开始南下攻打了多个城池，包括通州和蓟州等重要城市。在南下的过程中朱棣的*队军**与明军进行了多次大战。在雄县的时候朱棣的*队军**偷袭了明军取得了胜利，之后双方在镇定开战结果以明军的失败告终。
随后朱棣的部队继续南下，在大宁的时候曾返回到北平与明军进行恶战。次年朱棣的*队军**再次与明军在白沟河作战，明军再次大败。之后朱棣便向济南发起了猛烈的进攻，最终成功地占领了济南城。最终朱棣顺利南下占领了沿途的大小城池，并得到了相关情报最终攻下了南京城。这就是靖难之役。