新乡医学院第二附属医院始建于1951年6月，前身是中国人民解放军平原军区后方医院三分院。1957年5月，定名为河南省精神病医院。1994年3月增名新乡医学院第二附属医院。2010年增名河南省精神卫生中心。医院从战火中诞生，在磨砺中成长，从最初仅有150张床发展到有1500张编制床位享誉全国的省内唯一一所三级甲等精神专科医院，承担着全省精神疾病的医疗、教学、科研、预防、康复、司法鉴定以及医疗质量控制等任务，是河南精神卫生事业的发源地，河南精神卫生人才培养的摇篮。河南省精神卫生医疗质量控制中心、河南省心理咨询中心、河南省精神卫生研究所等12个机构均设在我院。
医院占地面积133.65亩，建筑面积7.17万平方米，年门诊量28万余人次，住院病人1.3万余人次。目前有在职职工1253人，卫生专业技术人员1041 人，高级专业技术人员187人，博士后14人，博士38人，硕士276人，高级职称和硕博人才数量位居中原城市群前列。近年来，共柔性引进特聘兼职教授12人，医院有享受国务院特殊津贴专家、中原名医，全国优秀医院院长，省政府特殊津贴专家，省政府优秀专家等各类人才40余人，河南省高校科技创新团队1个。
在国内及省内学术团体担任主委、委员二百余人。医院是国家住院医师规范化培训基地、国家药物临床试验机构，办有面向国内外公开发行的国家级学术期刊《临床心身疾病杂志》。是中华医学会行为医学分会认知应对（CCT）学组组长单位、河南省医师协会精神科分会会长单位，是河南医院协会精神专科医院管理分会等4个学会的主委单位，3个国家精神心理疾病临床医学研究中心核心单位，国家老年疾病临床医学研究中心协同网络核心单位，中华护理学会京外临床教学建设基地，首批全国“强迫症诊疗示范基地”“精神康复示范基地”，被中国卒中学会、中国卒中中心联盟授予“卒中中心”，入选“国家高级认知障碍诊疗中心（建设）”。
2022年10月，国家发展改革委办公厅、国家卫生健康委办公厅国家中医药局办公室印发《第四批国家区域医疗中心建设方案要点》，“北京大学第六医院河南医院”项目成功获批，该项目的输出医院为北京大学第六医院，依托医院为我院，是全国首个、目前唯一的国家精神区域医疗中心。
近年来，随着经济社会快速发展及疾病谱的变化，人民群众对精神卫生医疗服务需求日益增大。为满足广大人民群众需求，医院积极实施名院、名科、名医“三名”品牌建设工程，实施专病专治，设置特色门诊6个，诊疗中心9个，为患者提供更加优质、高效的医疗服务。医院具有完备的二级分科设置，有精神科临床科室20个，神经内科2个，内科1个，神经外科1个，医技科室12个，教学、科研、防治机构5个。深入落实公立医院功能定位，连续两年国家公立医院绩效考核等级为A，其中2020年我院位列精神专科类医院全国第七。
医院精神病与精神卫生学是省级重点学科，8个省级医学重点学科，2门省级精品课程，9个教研室，8个硕士学位授予点。在精神分裂症分子病理与临床、物质依赖与精神药理、心理应激与行为障碍、器质性精神障碍等方向成果丰硕。