厦门大学（Xiamen University），简称厦大（XMU），由著名爱国华侨领袖陈嘉庚先生于1921年创办，是中国近代教育史上第一所华侨创办的大学，也是国家“211工程”和“985工程”重点建设的高水平大学。拥有5个一级学科国家重点学科和9个二级学科国家重点学科（涵盖38个二级国家重点学科），46个福建省一级学科重点学科，9个国家基础科学人才培养基地。拥有31个博士后流动站，31个博士学位授权一级学科，50个硕士学位授权一级学科，9个交叉学科专业授权点；23个专业学位授权点。
一级学科国家重点学科（5个）
理论经济学（0201）、应用经济学（0202）、化学（0703）、海洋科学（0707）、工商管理（1202）
二级学科国家重点学科（不含一级学科覆盖）（9个）
国际法学（030109）、高等教育学（040106）、专门史（060105）、基础数学（070101）、凝聚态物理（070205）、动物学（071002）、水生生物学（071004）、细胞生物学（071009）、环境科学（083001）
福州大学是国家“211工程”重点建设高校，福建省人民政府与国家教育部共建高校。创建于1958年，现已发展成为一所以工为主、理工结合，理、工、经、管、文、法、艺等多学科协调发展的重点大学。现有国家重点学科1个、国家重点(培育)学科1个、省级优势学科创新平台5个、省级特色重点学科6个、省级重点学科26个;化学、工程学和材料科学3个学科进入国际ESI学科排名前1%。共有博士后流动站11个，一级学科博士点9个、二级学科博士点62个、一级学科硕士点35个、二级学科硕士点152个、专业学位授权点12个(其中工程硕士专业学位授权点含23个工程领域)，本科专业78个。
福建农林大学是农业部、国家林业局与福建省政府共建大学，是福建省重点建设的三所高水平大学之一,在培养高质量人才、开展高水平科学研究、提供高效益的社会服务等方面取得了丰硕的办学成果。学校现有2个国家重点学科、2个农业部重点学科、7个国家林业局重点学科，9个福建省特色重点学科、21个福建省重点学科和3个省级优势学科平台。在全国第三轮学科评估中，1个学科进入全国前5名，4个学科进入全国前10名，8个学科进入全国前20名，均占福建省属高校50%左右，排名第一。植物学与动物学学科（PLANT& ANIMAL SCIENCES）进入ESI全球前1%学科行列。
华侨大学是中国著名高等学府，创办于1960年，校区分别坐落于中国著名侨乡福建省厦门市和泉州市，学校直属国务院侨务办公室领导。学校现有国家重点学科、省部级重点学科共41个；有国家级实验教学示范中心、教育部工程研究中心、国务院侨办侨务理 论研究基地、中国旅游研究院旅游安全研究基地、福建省“2011协同创新中心”、福建省社会科学研究基地、福建省高校人文社会科学研究基地、博士后流动站、福建省商务研究基地、省级重点实验室、省级工程技术研究中心、省高校重点实验室、省级实验教学示范中心、省研究生教育创新基地等国家级和省部级教学科 研平台55个。
集美大学地处福建省厦门市，是福建省重点建设高校，是交通运输部与福建省、国家海洋局与福建省、福建省与厦门市共建高校，博士学位授予单位，面向全国招生。有8个福建省一级重点学科（其中2个特色重点学科），1个水产学科博士后科研流动站；水产、船舶与海洋工程等2个一级学科博士点；水产、船舶与海洋工程、食品科学与工程、交通运输工程、应用经济学、体育学、数学、中国语言文学、生物学等9个硕士学位授权一级学科点（覆盖56个硕士二级点）；有30个硕士专业学位领域，分布在农业、工程、教育、税务等4个类别。
福建医科大学创建于1937年，前身是福建省立医学专科学校，首任校长侯宗濂（1900年-1992年），系中国近现代著名生理学家和医学教育家。。临床医学、口腔医学、预防医学、护理学等专业学生在历年国家执业医师（护师）资格考试通过率名列全省前茅。
福建中医药大学原名福建中医学院，创建于1958年，是我国创办较早的高等中医药院校之一，是福建省重点建设高校，2010年3月经教育部批准更名为福建中医药大学。目前，学校拥有3门国家级精品课程、2个国家级教学团队、4个国家级特色专业、1门国家级双语教学示范课程、1个国家级人才培养模式创新实验区、2门国家级精品视频公开课、3门国家级精品资源共享课、1个国家级专业综合改革试点、2项国家级卓越医生（中医）教育培养计划改革试点项目、1个国家级大学生校外实践教育基地和92项国家级大学生创新创业训练计划项目。
福建工程学院是福建省人民政府举办的以工为主，涵盖工、管、文、理、经、法、艺等多学科的全日制普通本科高校，是入选教育部首批“卓越工程师教育培养计划”的试点高校，是福建省重点建设高校，现有52个本科专业，拥有1个省级特色重点学科：材料科学与工程，5个省一级重点学科:交通运输工程、材料科学与工程、土木工程、机械工程、管理科学与工程。有学术型硕士授权一级学科3个：材料科学与工程、交通运输工程、土木工程；硕士专业学位授权点3个：工程硕士（机械工程领域）、工程硕士（电气工程领域）和工程管理。
厦门理工学院位于中国东南海滨城市——厦门。1981年建校（前身鹭江职业大学），是福建省属公立本科大学，实行省市共建、以市为主的管理体制。2004年经教育部批准升本并更名为“厦门理工学院”。现有国家级特色专业1个，国家级综合改革试点专业1个，省级特色专业9个，省级综合改革试点专业7个，国家“卓越工程师教育培养计划”实施专业5个，省级6个，省级人才培养模式创新实验区9个，省级精品课程29门，国家级大学生创新训练项目144项。