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张帆
关键词:NF-κB;基金;临床科研
导言:
NF-κB家族有五个成员 (RelA(p65)、RelB、c-Rel、p50/p105(NF-κB1)和 p52/p100 (NF-κB2)) ;
NF-κB信号传导主要通过经典和非经典两个主要途径调节,尽管在信号传导机制上存在差异,但两者对于调节免疫和炎症反应都很重要。
NF-κB几乎存在于所有动物细胞中,并参与细胞对压力、细胞因子、自由基、紫外线和抗原等刺激的反应;在心血管发育和稳态、应激反应、炎症反应中发挥核心作用,还参与与突触可塑性和记忆相关的过程;NF-κB中最经典的生物学过程研究是免疫、肿瘤发生和发育。
NF-κB 调节障碍与 癌症 、 炎症与自身免疫性疾病 、 病毒感染、感染性休克 和 免疫系统的异常发育 有关。

(NF-κB家族的五个成员:RelA(p65)、RelB、c-Rel、p50/p105 (NF-κB1) 和 p52/p100 (NF-κB2)。 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17183360/ )

(经典NF-κB信号通路和非经典NF-κB信号通路。
根据细胞核中 NF-κB 的组成,不同的基因会被主动转录。基因靶标的这种变异和特异性进一步由不同亚基的翻译后修饰决定,例如 p65 的磷酸化。*经典NF-κB信号通路的触发信号包括先天性和适应性免疫受体介导的信号;涉及由Tak1激活IKK复合物、IKK介导的IκBα磷酸化及随后的降解,引起原型NF-κB异二聚体RelA/p50的快速和瞬时核转位。*非经典NF-κB通路依赖于磷酸化诱导的p100加工,这是由来自TNFR成员子集的信号触发的;p100 被降解为 p52,从而使 RelB/p52 复合物从细胞质转移到细胞核;该途径依赖于NIK和IKKα,但不依赖于三聚体IKK复合物,并介导RelB/p52复合物的持续激活。 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3193406/ )

(NF-κB 靶向参与炎症相关因子:NF-κB 是一种诱导型转录因子,激活后,它可以激活各种基因的转录,从而调节炎症。NF-κB不仅通过增加炎性细胞因子、趋化因子和粘附分子的产生直接靶向炎症,而且还调节细胞增殖、凋亡、形态发生和分化。 https://www.nature.com/articles/sigtrans201723 )

(NF-κB调节炎症小体 NLRP3 。 https://www.nature.com/articles/sigtrans201723 )

(炎性疾病中的NF-κB靶向治疗。
https://www.nature.com/articles/sigtrans201723 )

(NF-κB通路和肿瘤抑制因子p53之间的串扰调节细胞凋亡。 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24333502/ )

(靶向肿瘤、肿瘤干细胞中的NF-κB信号传导的生物制品 (抗IL1β、抗PDL-1) 和小分子 (如RTK*制剂抑**(RKI)) 概述。 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35203471/ )

(靶向肿瘤中的NF-κB信号传导的药物影响肿瘤干细胞中NF-κB的抗炎信号。 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35203471/ )
NF-κB信号通路的研究在肿瘤(如骨髓增生性肿瘤、淋巴瘤、白血病、胰腺癌、结直肠癌、乳腺癌、肝癌等),感染、自身免疫病和退行性病变相关疾病(如噬血细胞综合征、自身炎症性关节炎、急性痛风性关节炎、急性肺损伤等)领域都有进展;除了经典抗炎药物阿司匹林、水杨酸钠、柳氮磺吡啶、地塞米松等对NF-κB信号通路明确的抑制作用外,还有治疗多发性骨髓瘤的NF-κB*制剂抑**硼替佐米(Bortezomib);另外,多种免疫疗法(如 PDL-1抑制 )对NF-κB信号通路的影响机制也是抗癌治疗的攻坚要点。
NF-κB研究一直以来都是顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点 。
NF-κB研究成果10.8%发表在9分+期刊 ,1.4%发表在24分以上期刊;并且最近几年的论文发表数量增速堪比火箭。绝对是万众瞩目的热点。

(NF-κB研究发表的期刊分布及时间分布)
为了解目前在NF-κB领域的研究进展,我们对发表的论文做了全面解读,以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢NF-κB研究,目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。
检索数据库: Medline 检索工具: 文献鸟 /PubMed
检索时间: April 08, 2022
检索及分析机构: Healsan Consulting LLC(美国恒祥咨询); Stork(文献鸟)
检索词: NF-κB*[Title/Abstract]
一,NF-κB研究论文大数据分析NF-κB 论文发表的
时间和国家分布

(SCI论文的时间和国家分布)
学术机构排名
南方医科大学 、浙江大学、山东大学、复旦大学、中南大学等所在大学发表的论文最多。

郑州大学第一附属医院 、华中科技大学同济医学院同济医院、华西医院、温州医科大学附属第二医院(育英儿童医院)、武汉大学人民医院等是发表论文最多的医院。

(全球发表论文的机构排名)
研究热点基因和相关疾病
如下图所示,显示 TLR4、 NLRP3 、MYD88、SIRT1、 STAT3 等是 NF-κB 研究中最受关注的位点。
结肠炎、关节炎、乳腺癌、骨关节炎、糖尿病 等是 NF-κB 研究中最关注的疾病。
NF-κB 研究也涉及类风湿关节炎、溃疡性结肠炎、肺癌、胃癌、败血症、中风白血病等疾病。

(NF-κB研究相关的基因和疾病)
NF-κB研究 的 关键词
包括 炎症、损伤、癌症、抑制、压力应激 和 自噬 等。

哪些期刊喜欢NF-κB研究?
可以看到发表 NF-κB 相关研究最多的五个杂志是 Front Pharmacol (IF=5.8) 、 Int J Mol Sci (IF=5.9)、 Front Immunol (IF=7.6)、 Int Immunopharmacol (IF=4.9) 、 J Ethnopharmacol (IF=4.4) 等。

(发表论文的杂志分布)
这些期刊的影响因子、分区、接受时间等如下所示。

最有影响力学者 及其关系网。 国际 NF-κB 研究论文中最有影响力的学者。

(学术大咖及其关系网。)
学者影响力是基于
学者在该领域的论文影响因子总分。
其中 青岛大学附属医院 的 Zhang, Wei ;德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心的Sun, Shaocong;安徽医科大学的Li, Jun;扬州大学的Zhao, Xin;天津医科大学肿瘤医院的Wang, Wei;Otto von Guericke University(德国)的Naumann, Michael;成均馆大学(韩国)的Cho, Jae Youl;安徽医科大学的Wei, Wei;南昌大学附属口腔医院的Wu, Jun;成都中医药大学的Li, Yunxia等在NF-κB研究领域最为活跃。




二,NF-κB研究领域的经典论文
除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外(数量+质量),单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。所以我们通过大数据分析找到高引用论文,即领域内的经典论文。从下图可以看出 NF-κB 研究领域论文的爆发,及经典论文的分布。

涉及的研究方法、研究重点包括TONIC试验、光热疗法、乳腺癌淋巴结转移、NF-κB1的缺失导致胃癌、细胞特异性Imd-NF-κB反应、PD-1阻断剂的敏感性、NR4A转录因子限制实体瘤中的CAR-T细胞功能、CARD-BCL-10-MALT1信号、cGAS-STING信号、TASL是TLR7-9激活IRF5的SLC15A4衔接子、肌球蛋白II的区域激活通过与免疫微环境的分泌交互作用、STING和NF-κB依赖性抗病毒反应途径、成纤维细胞重编程为光感受器、抑制LTβR信号激活WNT诱导的肺再生、炎症激酶IKKα磷酸化、稳定c-Myc、11q13.5的远端增强子促进Treg细胞抑制结肠炎、肝细胞特异性GP130信号、CARMA1-BCL10-MALT1-TRAF6信号体、T细胞免疫抑制功能、Treg细胞介导的肿瘤免疫逃逸、先天免疫反应、细胞溶质先天免疫受体、编码V140A的复发性ECSIT突变触发过度炎症、脂毒性与自噬和细胞死亡受损、巨噬细胞表型和尿酸的产生、TBK1是脂肪组织炎症和能量稳态调节的关键、Th9细胞与根除晚期肿瘤、细胞特异性Imd-NF-κB反应、转录因子IKZF3、IL-33、STAT1、STAT6。这些论文是 NF-κB 研究的经典论文,也是必读和必引论文。






如果我们只看 最近发表 的重要论文时,可以看到2021、2022年新发表的论文中, 既有对疾病的长期跟踪临床研究,也有新药研发、基础医学技术、机制研究 , 涉及的病症主要包括 动脉粥样硬化、COVID-19、乳糜泻、溃疡性结肠炎、弥漫性大B细胞淋巴瘤、急性髓系白血病、淋巴瘤、胰腺癌、胰腺导管腺癌、结直肠癌 ;
涉及的研究方法、研究重点包括儿童COVID-19多系统炎症综合征的免疫病理学特征、T细胞增殖的合成驱动因素的基因组规模筛选、活性氧与非编码RNA之间的串扰、K2P18.1将T细胞受体信号转化为胸腺调节性T细胞、NF-κB亚基RelB、IRAK4信号通路、双特异性FLT3scFv/NKG2D-CAR T细胞、吉瑞替尼(Gilteritinib)、TBK1缺乏导致由TNF诱导的细胞死亡驱动的自身炎症、E2泛素结合酶UbcH5c、锌指蛋白Miz1、肝细胞驱动的巨噬细胞活化和炎症与肝脏肿瘤发生、T细胞的代谢适应性、转录因子IKZF3、免疫检查点治疗、m6A独立的全基因组METTL3和METTL14、衰老相关的分泌表型等。




三,如何开启自己的NF-κB研究
除了前面内容,您已经深信不疑的是: NF-κB 研究很值得做。尤其是研究生选题,可能这是一辈子课题的好起点。问题是: 如何开始呢?
最简单的方法: 从模仿,到超越。
基础研究学者:
比如德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心的Gu, Meidi;广州医科大学的Imler, Jeanluc;耶鲁大学医学院的Jane-Wit, Dan发表的NF-κB信号与肿瘤免疫中的 T 细胞代谢适应性作用机制相关的系列研究论文。



临床科学家:
可以参照温州医科大学附属第二医院(育英儿童医院)的Xu, Jiake;清华大学医学院的Lin, Xin;澳门科技大学的Li, Ting;剑桥大学的Rodrigues, Paulo发表的关注NF-κB与骨质疏松、心律失常性右心室发育不良/心肌病、协同抗炎、肾癌转移作用的系列研究论文,机制结合临床研究,由浅入深。




如果要 做转化 ,
则可以参照;St. Boniface Hospital Research(加拿大)的Albensi, Benedict C,致力于神经退行性疾病、关节炎的药物基础研发到临床应用探索。


而最容易的切入点还是经典一套: A因子/蛋白 通过 B信号通路 途径调控了(抑制/增强) NF-κB 从而抑制/增强了 C疾病/细胞 的 D功能 。比如这篇文章标题的描述。

小结:
通过针对 NF-κB 论文的大数据分析,我们可以快速了解该领域研究的总体势态、研究热点、重要机构、突出学者、经典论文及这些论文发表的期刊分布。
1) NF-κB研究,目前是医生科学家最好的切入时机 。一方面, NF-κB 的机制已经比较清楚;另一方面,目前针对 NF-κB 在不同类型的肿瘤、副作用-耐药-生存-预后的干预效果研究还远远不够。2)针对 NF-κB 研究,目前发表了93,614篇Medline论文,且 论文数量快速增长 。且有非常高的比例发表在 高质量期刊 上。中国、美国、印度、 日本和埃及在 NF-κB 研究中处于领先。3) NF-κB 研究发文最多期刊是 Front Pharmacol (IF=5.8) 、 Int J Mol Sci (IF=5.9)、 Front Immunol (IF=7.6)、 Int Immunopharmacol (IF=4.9) 、 J Ethnopharmacol (IF=4.4) 等。有10.8%的研究发表在影响因子大于9分的期刊,1.4%发表在24分以上期刊。
4) NF-κB研究领域广泛,除了不同类型的肿瘤,还包括炎症反应性疾病、退行性神经疾病,如 脉粥样硬化、COVID-19、乳糜泻、溃疡性结肠炎 ,帕金森病等领域。5)针对 NF-κB 研究 最有影响力的论文,已经由机制探索、细胞和动物实验,转向临床转化和研发。