马耳他共和国在2016年1月至6月期间共发行6套新邮。
近年来，马耳他邮政每年都发行一套《马耳他花卉》邮票，已形成系列。1月22日发行该套邮票的第3组，全套3枚，总面值2.04欧元，邮票规格为20×38毫米，发行量分别为252万枚、63万枚和9万枚。马耳他据南欧、北非和中东三地海上要冲的特殊地理位置，这里生长的花卉近似西非、东非和北非地中海花卉的特色，但更多则倾向于意大利西西里岛的花卉。2016年发行的花卉邮票展示了白阿福花、倒距兰和蜘蛛兰花。其中蜘蛛兰花也称“马耳他蜘蛛兰”，是生长于矮灌木和干岩石牧场内的稀有植物，“马耳他蜘蛛兰”是1992年被正式命名的，在此之前它一直被记载为早已在马耳他绝迹的“早期蜘蛛兰”。马耳他蜘蛛兰主要在每年的3月和4月开花，花状如蜜蜂一类的昆虫。
3月28日发行《瓦莱塔建城450周年》小型张，面值4.25欧元，规格为120×80毫米，小型张中邮票规格为35×35毫米，发行量2.5万张。瓦莱塔是马耳他的首都，它于1566年由击败奥斯曼土耳其帝国大举进攻的“圣约翰骑士团”团长让·帕里索·瓦莱塔决定建立，米开朗琪罗的助手弗朗西斯科·拉帕莱利负责设计，在1566年奠基并于5年后竣工，它是马耳他战后建立的新都，被命名为“瓦莱塔”。当时的马耳他人对这座新都的建设赋予了极大的热情，瓦莱塔城中所有12岁至60岁的居民，不分性别和等级，都义务参与各项建设活动，如果某一天因故未能参加劳动，则会自愿捐出1塔里（当时的马耳他骑士团硬币）作为补偿。瓦莱塔被称为“堡垒之城”、“欧洲之城”和“世界遗产之城”，这些城市头衔印证了瓦莱塔的城市特色，城中建筑布局整齐，城街狭直，拥有欧洲最好的教堂和宫殿建筑，各类历史遗迹都保存完好。瓦莱塔已被欧盟确定为“2018年度欧洲文化之都”。本次发行的小型张边纸左右两侧分别展示了瓦莱塔建城时的地图和奠基人瓦莱塔的形象，小型张中的邮票图案则为印有瓦莱塔侧身肖像的骑士团硬币。
4月15日发行《世界自然基金会（WWF）专题邮票：海鸥》小全张，包含4枚邮票，小全张规格为120×80毫米，小全张中邮票规格为35×35毫米，发行量2.52万张。世界自然基金会（WWF）专题邮票是由各国（地区）申请并经过世界自然基金会这个非官方国际组织批准、各国自行设计印刷而带有“WWF”会徽的邮票。会徽以我国国宝大熊猫为主图，下置WWF标志，“WWF”专题邮票是动物邮票中的一个重要分支。马耳他本次发行的邮票图案选用了该国常见的海鸥，小全张中的海鸥或擦海面展翅飞翔，或在水中安详畅游。在马耳他科米诺岛的悬崖峭壁和戈佐岛的维拉湾矗立的菌石上常见正在交配和孵化的海鸥。