在午间会议散会后，参谋长联席会议与涉及对古巴军事行动的指挥官在下午4点半会晤，麦克纳马拉5点40分加入会议，大家一致同意应攻击包括导弹发射阵地在内的所有古巴重要军事目标。与此同时，国务院主要官员也开会商讨古巴问题。大家于下午6点半在白宫会合开会，以下为白宫会议内容节译，可以看出，肯尼迪政府在继续思索和探讨种种解决问题的办法，讨论各种选项的利与弊，尤其尽可能考虑它们所造成的影响，但似乎政治解决方案与军事解决方案间有着不可调和的矛盾与冲突，参谋长们从军事角度出发，力促肯尼迪尽早做出决定，而麦克纳马拉则竭力分析种种需考虑的因素。
卡特（中情局副局长）：……我们目前有了比原先更精确的图像判读。在三处发射阵地上，各有四具发射器，且每具发射器都有备用的导弹，所以大约能发射16到24枚间的导弹。根据我们现有的情报，这些应该是使用固体火箭发动机、惯性制导、射程为1100英里的导弹，而非使用液态火箭发动机和雷达制导的导弹，因为我们并未发现任何雷达或液氧设备。从情报分析的角度来看，他们费如此周章，肯定会使用射程1100英里的导弹，这样才能造成更大的威胁。
……这种使用固体火箭发动机和惯性制导的导弹在两周内便可投入使用，一旦投入使用，它们很快就能发射，发射后每具发射器需要四到六小时的时间再装填。
红场阅兵仪式上展示的苏联弹道导弹
肯尼迪：这种导弹应对*弹子**攻击的能力如何？
卡特：它们非常脆弱，尽管不如液态火箭发动机来得脆弱，但仍在普通的步枪*弹子**面前无能为力。我们没有发现发射场周围有储藏*弹核**头的设施。但自今年2月开始，我们便注意到一处异常的设施，那里现在有着自动防空*器武**的保护……
其中一处发射阵地可以很快投入使用。我们的人认为它在九月初便部署在那里了，因为一艘有着巨大容积的苏联船只两次造访古巴，一次是在8月底，另一次是在9月初……
麦克纳马拉：我们已经准备好了七架U-2侦察机，其中两架是高空侦察机，另外五架是飞行高度较低的侦察机。六架配备着老式胶卷，另一架则装备有新型的试验性胶卷，希望这能增加照片的清晰度。假如明天天气良好的话，两架飞机足以完成任务。假如天气不好的话，我们会先派出两架飞机，并让其它飞机待命，以便在天气改善后出动……我们在未来相当长一段时间内都会保持这样的出动能力。
U-2高空侦察机
……腊斯克：……我想指出我们关注的几点。一是卡斯特罗知道他处于极度危险之中，是否会因此与莫斯科决裂，这或许只有百分之一的可能。但无论如何我们还是想探究向卡斯特罗直接传信的可能，也希望赫鲁晓夫在空袭进行前能够恢复理智。马丁先生会向您展示给卡斯特罗口信的大纲。
马丁（负责美洲事务的助理国务卿）：这将是一份通过第三方传递的口信。首先，描述我们所知的关于导弹阵地的情况，好让他知道我们了解那里正在进行的事情。其次，指出它对美国安全构成的威胁，违反了您曾公开明确表态的两个问题，一是地对地导弹，二是古巴出现由苏联人操控的基地。接着，向卡斯特罗指出他所面对的困难，苏联人此举使得卡斯特罗面临来自美国攻击、进而*翻推**其政权的危险。与此同时，苏联人也在讨论用这些导弹换取西方在柏林和其它问题上让步的可能……接着说我们会让我们的人民知晓他们所面临的威胁，并在第二天采取行动。要让他知道，除非他开始把苏联人赶出基地，否则我们就必须采取行动。他必须不仅通过声明，还要通过行动来向我们显示诚意。我们打算经常飞越导弹阵地以监测拆卸工作的进展……我们将给他24小时的时间来回复。
腊斯克：事先提出警示的不利之处在于……或许会致使卡斯特罗在这些导弹周围布设移动防空*器武**，或采取其它类似行动，导致我们的空袭变得更为困难……另外还有两个问题。假如我们空袭这些导弹，我们预计拉丁美洲的*产党共**会剧烈反应。就其中六个政府而言，倘若政府首脑不能事先准备，进行威压，它们中的一些政府很可能会被*翻推**，比如委内瑞拉或者危地马拉、玻利维亚、智利甚至是墨西哥。因此问题在于我们是否应该通过某种方式向他们传达局势的严重性，从而使他们能够采取预防性措施。
拉丁美洲的反美*行游**
另一个问题在于北约。我们可以预计，苏联人肯定会在其它地方展开某种行动。我们倘若要采取军事行动，又不让亲近的盟友知晓它们可能面临的巨大危险，这是个重大的决策问题。我们将被盟友所孤立，联盟也会迅速崩塌，正如苏伊士运河事件之后一段时间里那样，且比起苏伊士事件，古巴局势更为凶险。
……肯尼迪：我们能更详细地讲清楚军事行动是什么样子的吗？……
麦克纳马拉：好的，总统先生。泰勒将军一直在与参谋长们商讨，指挥官们详尽地研究了该行动。如果只是摧毁导弹，或者说摧毁导弹、米格战机和我们所能找出的相关*弹核**头储藏设施，那么在决定做出后的二十四小时内便可实施……但参谋长们强烈反对此类攻击，认为它会留下太多古巴的军事实力安然无恙……
泰勒：……假如苏联人愿意为这些导弹配上*弹核**头，那么他们也有理由为这些基地配备核打击能力。倘若我们丧失了先发制人的突然性的话，那么再也没有机会摧毁它们了。我们的建议是在接下来的两到三天获取全面的情报资料，拿到所需的全部图像，然后检视该目标系统。假如它真的威胁到美国了，那么就一次性彻底将其摧毁。
肯尼迪：那意味着摧毁那些战机、轰炸机。
苏联在古巴基地的分布图
麦克纳马拉：总统先生，我能够指出我们现已考虑的三条道路，并简要地评述每一项选择吗？首先是政治行动，我们遵循腊斯克国务卿今晨提到的一些方法，接触卡斯特罗，接触赫鲁晓夫，并与我们的盟友磋商……在我看来，这不大可能产生令人满意的结果，并且会阻止接下来军事行动的实施。因为要是在他们获得进行核打击的能力后开启军事行动，危险实在是太大了，我们绝不会这样做的……
我们尚未谈论第二条道路，它介于军事行动与政治行动之间。我们宣布对古巴进行监视，声明我们将立即进行*锁封**，阻止进攻性*器武**在未来进入古巴。结合未来无限期维持的侦察监视项目，我们向苏联方面表示，一旦古巴做出任何针对美国的攻击性举动，我们会立即准备进攻苏联……
第三条道路便是针对古巴的各种军事行动……参谋长们强烈反对有限的空袭。但即便是有限的空袭也是非常广泛的空袭。它不是20或50或100架次，很可能是数百架次……如果发动针对米格战机、可能存在的*弹核**头储藏设施、雷达设施、萨姆防空导弹的攻击，意味着每天700至1000架次的空袭，且持续五天……在我看来，任一形式的直接军事行动都会招致苏联在世界其它地方的军事回应，这或许是值得付出的代价……在进行空袭的同时，我们必须做好准备，尤其是在大规模空袭的情况下，古巴人民可能会爆发起义，这将束缚我们的手脚。我们要么接受一场无法令人满意的起义，进而招致所有的负面评价，要么被迫入侵古巴，以支持起义。
腊斯克：总统先生，我能否发表简要的看法？我认为任何行动都涉及重大的政治介入，它们会影响各种政策、立场和战略态势。我认为我们也必须考虑，在进行空袭或其它军事行动前，应做哪些政治准备。
……麦克纳马拉：……我们不知道苏联人已经把导弹部署在古巴多久了，也不知道他们有什么样从空中发射*弹核**头的能力。我们也不知道他们有什么样的空投烈性*弹炸**的能力。他们几乎肯定拥有在东海岸某处扔下一枚、两枚、十枚*爆高***弹炸**的能力。这是我们事先发出警告所必须承受的最低风险。
泰勒：总统先生，我想强调最后这点。我们的佛罗里达地区面对常规的低空轰炸异常脆弱。我们的整个防空系统重点都在它处，从未为我国建立低空防空体系。所以米格战机很可能携带常规*器武**突破防空体系，造成一些损伤
为应对古巴威胁匆匆在佛罗里达海滩上架设的防空导弹
……狄龙：假如米格战机携带核*器武**呢？
肯尼迪：将军，你认为他们不会这样做吧。
泰勒：我认为它们只会携带常规*器武**。
……邦迪：我想问的问题是……中程导弹出现在古巴，这对美国的战略态势有何影响？它是否严重地改变了战略平衡？
麦克纳马拉：麦克，事实上，我下午问了参谋长们这个问题。他们说这极大改变了战略平衡。在我个人看来，这并未改变战略平衡。
……泰勒：总统先生，你说这只是多了几枚瞄准美国的导弹，这没错。可它们却能极大地增强苏联的核打击能力。我们不知道它们能打到多远的地方……
肯尼迪：我们假设一下……这些导弹带有*弹核**头，我们就无法摧毁它们，因为这是一项巨大的赌博。他们接下来就会进一步建设那里的空军基地，部署更多的战机……当他们准备就绪后，就会在柏林问题上向我们施压……但你也可以说，被从苏联飞来的洲际导弹炸飞和被从90英里外发射的导弹炸飞，两者间没啥区别。
……罗伯特：另一个问题是，一年以后，在南美洲可能出现的情况。古巴人手里有这些导弹，假设委内瑞拉出现问题，卡斯特罗会说，假如你们派*队军**前往委内瑞拉，我们便会发射这些导弹。
……肯尼迪：这就使他们看起来和我们平起平坐，并且……
狄龙（接话）：我们害怕古巴人。
……
麦克纳马拉：在我们表明我们将进行空袭，与我们切实开展空袭间，这些导弹也可能准备就绪，对东海岸构成严重威胁……它们很有可能是*战野**导弹，在他们决定将其投入使用后便能尽快准备就绪。
卡特：这些是*战野**导弹，有着机动车辆的支持。
泰勒：我们估计它们在40分钟内便可准备就绪。
鲍尔（副国务卿）：所以说空袭应先于任何政治讨论前进行？
麦克纳马拉：我认为是这样子的。在你发表任何公开声明前，你应该决定是否进行空袭。假如决定进行空袭，那么你就不应该发表声明。
……鲍尔：……在我看来，小规模的空袭有着巨大的政治优势。用政治术语来说，惩罚与所犯的罪行相当，我们只是在做我们反复公开警告过的事情。我们不扩大化攻击……
肯尼迪：就今晚而言，在我看来，我们预计会进行第二选项的空袭，即大规模空袭……
……麦克纳马拉：总统先生，目前除了已经开启的进程，无需额外的行动，你可以在周六或之后的任何时间前做决定。
……泰勒：总统先生，问题在于我们会通过那些侦察飞行收到新的情报，并把它们纳入正在准备的空袭计划中进行考量，这就涉及时间问题。国防部长已经跟您说过时间问题了，必须现在做决定，这样我们才能通知飞行员们，再接收新的情报……
设想的给飞行员做关于古巴的任务简报的场景
麦克纳马拉：我们现在无需决定要进行什么样的空袭。我们所要决定的只是是否进行空袭。
泰勒：是这样子的
……麦克纳马拉：斯威尼（注：战术空军司令，值得一提的是，他也是驾机在长崎上空投下原*弹子**的飞行员）已经表示，他会审阅明天送来的侦察照片，在周四和周五处理上面的信息，并在周六或周日晨准备好任务简报。
泰勒：问题在于我们必须告知飞行员们，而我们一直尚未做这件事，大约将有400名左右的飞行员需要接受任务简报……
肯尼迪：我们什么时候开始给飞行员们任务简报呢？
泰勒：他们至少需要二十四小时时间
……麦克纳马拉：……总统在空袭前二十四小时才需做出决定，在此之前，只需决定进行准备即可。
……泰勒：……总统先生，飞行员们有越多时间越好，因为这样子他们能做更多演练和审视……
……麦克纳马拉：……在我看来，我们作为一个政府，应该考虑行为的后果。我认为我们尚未考虑后果问题，也正因为我们尚未考虑后果，我们或许没有采取一切应采取的措施使后果最小化。我不知道在我们空袭古巴后，世界会怎样……在我们进行50至100架次的空袭后，世界会变得怎样呢？我们如何能就此罢手呢？我不知道答案，我认为今晚国务院和国防部应该研究任何行动所可能导致的后果……
泰勒：总统先生，参谋长们和指挥官们强烈认为，有限的空袭行动有着巨大危险，他们更愿意不发动空袭，而非发动有限的空袭。他们认为，有限的空袭行动将使美国置于被攻击的危险之中……
肯尼迪：是的，可我认为随着空袭规模的增强，冲突范围就会扩大，这将给美国造成更大的威胁……
……麦克纳马拉：这就是为什么我们必须思考后果。我认为在大规模空袭后，我们会被迫入侵，以协助起义，这是非常可能的结果……
马丁：……我相信，即便是持续几天的主要针对军事目标的空袭不会导致大范围的动荡。人们会呆在家里，避免麻烦。
……罗伯特：总统先生，我们今晚考虑这一问题时，我认为也应该考虑古巴一年后两年后会是什么样子的。假设我们进行空袭，摧毁了这些导弹阵地，我不知道有什么能够阻止他们六个月后再重新建设导弹基地的……假如我们进行空袭，摧毁这些导弹阵地，我们六个月后是会处在更好的位置上，还是会处于更糟糕的位置上呢？
……麦克纳马拉：在进行有限的空袭后，你必须设立起*锁封**。
……罗伯特：那么我们就必须击沉苏联船只，以及潜艇了。
……邦迪：我坚持认为，赫鲁晓夫不会把*弹核**头交给菲德尔卡斯特罗……
肯尼迪：那他为什么把导弹运到古巴呢？
邦迪：*弹核**头应该还是处于苏联人控制之下？
肯尼迪：是的，可这样做到底有什么好处呢？这就好比我们把大量中程导弹部署到土耳其。我认为那将是十分危险的。
邦迪：总统先生，我们的确把导弹部署到土耳其了。
……我相信赫鲁晓夫的将军们过去一年多肯定一直和他讲，他失去了一个增加自身战略实力的黄金机会。
……约翰逊：我们现在将这些视为是苏联的导弹，苏联的进攻性*器武**
……罗伯特：我们需要考虑的另一件事是关塔那摩湾是否会被卷入此事，或者说是某些船只，即“缅因”号事件的重演（注：1898年，访问古巴哈瓦那港的美国战舰“缅因”号在港内爆炸沉没，美国以此为借口对西班牙宣战）
沉没的“缅因”号
泰勒：我们认为，无论是进行哪一种军事行动，关塔那摩肯定会遭到火力袭击。他们在射程内有火炮和迫击炮。无论我们采取哪一项军事行动，都必须向关塔那摩提供空中支援，甚至增援驻军。
肯尼迪：这就是为什么在我看来，如果我们决定在周六或周日进行有限的或大规模的空袭，那么视情况如何发展，我们或许会因关塔那摩遭受袭击而开启入侵行动。
……
麦克纳马拉：我们要做什么以防止他们发射呢？首先，我们执行侦察监视，以了解他们在干什么。二十四小时监视，永不停歇。我们还能做什么呢？我们阻止更多的进攻性*器武**被运进来。换言之，我们进行*锁封**。
邦迪：我们如何做到这一点呢？
麦克纳马拉：我们搜查每一艘船只。
……邦迪：你必须让对方停船，才能搜查它，假如它不愿停船的话，你必须开火，对吧？
……麦克纳马拉：……与这两项行动相联系，应该要有一项对世界的最后通牒，尤其是给赫鲁晓夫的，称我们已经发现了这些进攻性*器武**，正在密切监视它们。假如有任何迹象表明它们会射向这个国家，我们便不仅会针对古巴展开攻击，也会直接对苏联发动全面核打击……
……吉尔帕特里克（副国防部长）：有一种谋划是我们今天未曾公开谈论的，是检视我们在世界各地的薄弱点，不仅在柏林，还有土耳其、伊朗……
麦克纳马拉：韩国。
吉尔帕特里克：那我们应该采取什么样的预防性措施呢？
……麦克纳马拉：……我们的所有部队应该进入警戒状态。在此之外，还有动员、重新部署、调动等……
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