磁力搅拌器温度控制方式一般有二种，一种是电接触汞温度，另一种是通过控制温度传感器（电动），接触汞和电力在使用过程中传感器的一端进入测量液体，另一端连接到机器上，在这个过程中当液体温度低于设置温度，加温板会加热，当温度达到设置温度的液体，然后由电点水银温度计或传感器信号到主机磁搅拌器，加温板会停止加热，再当温度低于设置温度，加温板的继续加温，这是磁性的原理，混合器温度控制。
磁力搅拌器温度控制措施，首先，加温板有一个热惯性，温度控制可能高于设置温度，若要求较高，要注意控制温度的加温板（即加温电压）。第二，使用电接触汞温度，当温度高于电点水银温度计设置温度，传感器温度控制方法是在主机上设置温度，因此，温度控制传感器更方便。但传感器采用金属材料，要注意防腐蚀。
磁力搅拌器的使用把装有溶液及搅拌子的试瓶（或其它器皿）放置在工作面顶板上。连接电源，开启电源开关，指示灯亮。选择加热，合上加热开关，指示灯亮，此时为加热状态。把传感器插入到溶液中，调节温控旋钮到所需温度刻度。调节调速旋钮，升至所需转速。工作结束后，将调速旋钮旋最小位置，加热开关、温控旋钮处于非工作状态，关闭电源开关，切断电源。把工作面顶板、传感器等擦拭干净，不要有水滴、污物残留。
磁力搅拌器使用注意事项，磁力搅拌器使用前地线要妥善接地。磁力搅拌器在运转时要把转速旋钮调到最小，连接电源并逐渐调至到合适的速度，加速太快会使搅拌转子不停跳跃，此时要立刻把转速调回“低位”，待转子停止跳动后再缓慢加速。间歇使用磁力搅拌器能够延长仪器的使用寿命。
连续工作时间若超过2小时，请用低速搅拌，这样可连续工作4-8h以上。工作时请把容器放置在金属托盘上合适位置，以便搅拌桨在旋转时不会碰到容器壁，否则搅拌会忽快忽慢影响到搅拌效果。当液体洒在托盘上时，要立即断电清除，防止腐蚀或影响电热元件，阻碍电机正常工作。测定时应使电极对在搅拌转子上方一定距离处，避免二者发生碰撞而损坏电极，保持容器外壁干燥，磁力搅拌器停止工作时请及时切断电源。