初代复仇者被全歼
漫威动画《假如（What if …?）》播出到第3集，前两集描绘了漫威宇宙重要事件发生改变时所创造出的不同故事：第1集里是卡特特工代替史蒂夫·罗杰斯成接受超级士兵实验，成为了卡特队长；第2集里是特查拉代替彼得·奎尔成为星爵。这一集里则搞出更大的事件：初代复仇者们在集结之前就覆灭殆尽，从钢铁侠到雷神，鹰眼和黑寡妇，乃至最难被杀绿巨人，都遭到*杀暗**，只有还在沉睡中的美国队长幸免于难。
黑化的蚁人
造成这种变化的原因，也就是这一集的“假如”，竟然是源自初代蚁人的女儿，也就是二代黄蜂女霍普。在《蚁人》1、2里，霍普的母亲初代黄蜂女珍妮特·范·戴因失踪后，霍普一直伴随在初代蚁人汉克·皮姆身边，之后和二代蚁人斯科特·朗搭档，成为黄蜂女，也参加了终局之战。
而在《假如》第3集里，霍普则在母亲失踪后加入了神盾局（之前皮姆和珍妮特都与神盾局有合作），随后在一次行动中丧生，这使得原本心理就不太稳定的汉克·皮姆彻底黑化，把所有的罪责都怪在神盾局头上，化身黄衫怪策划了对初代复仇者的攻击。其实在漫画里，皮姆的第一代蚁人，就是复仇者的建立者之一。
初代黄衫怪
黄衫（Yellow Jacket）在漫画中原本就是皮姆多重身份之一。皮姆在最初使用可以控制大小的皮姆粒子时，化身蚁人，之后发现可以皮姆粒子不但可以缩小还可以放大后，化身巨化人、歌利亚，而黄衫则是代表他*力暴**的一面（漫画中皮姆是著名的家暴男），一开始也是反派的姿态登场。漫画中的三代黄衫怪达伦·克劳斯也就是《蚁人》电影中的最终反派。这次动画里皮姆以黄衫怪姿态展开报复行动，而按照MCU里的设定，皮姆曾是神盾局的科学家，也以蚁人身份作为特工参与行动，这就让他有机会了解到尼克·弗瑞的复仇者计划，获取初代复仇者名单。
钢铁侠之死
这一集开头，尼克·弗瑞和黑寡妇一同找到在甜甜圈店的钢铁侠托尼·斯塔克。这一幕出现在《钢铁侠2》里，斯塔克由于维系他生命的胸口微型反应堆同时会造成自身钯中毒，正在自暴自弃，尼克·弗瑞和黑寡妇一同来为他提供临时解毒剂，鼓励他振作起来，同时再次尝试征召钢铁侠加入复仇者。结果在动画里黄衫怪皮姆藏身于解毒剂中，杀死了斯塔克。
在这一集里随着斯塔克的死，钢铁侠一条线的故事就结束了，不过原本《钢铁侠2》中还会有鞭索安东尼·万科和生意对手汉默在暗中准备作恶，失去了斯塔克，原本的大反派鞭索要怎么处理呢？
雷神、鹰眼之死
之后被*杀暗**的雷神、鹰眼、浩克。《钢铁侠2》的故事发生在2009年前后，而《雷神》则在2011年上映，但时间点则几乎紧接《钢铁侠2》，在鞭索被处理之后，科尔森特工就前往新墨西哥州研究坠落到地球的雷神之锤，鹰眼也同时在《雷神》中登场。所以雷神被皮姆借助鹰眼的箭所杀之后，紧接着皮姆就偷袭杀死了被囚禁的鹰眼。
浩克之死
爱德华·诺顿主演的《无敌浩克》和《钢铁侠》几乎同时上映，但遭遇了失败，导致浩克再也没有个人电影，诺顿也没有继续与漫威合作（这更多是因为诺顿对于剧本有太多干涉），之后变成了马克·鲁法克出演的搞笑版浩克。所以这次登场的布鲁斯·班纳和诺顿、鲁法克都不太像，更像是结合了两人特点的动画人物。
动画中浩克登场的剧情设定在《无敌浩克》中班纳回到卡尔弗大学寻求女友贝蒂·罗斯帮助的时间点。随后贝蒂的父亲罗斯将军帅军赶来抓捕班纳。原本应该是班纳变身成浩克击溃*队军**，打败了还没有变成憎恶的布朗斯基，到了动画这一集里，则是被皮姆直接攻击心脏而死。
黑寡妇之死
黑寡妇和鹰眼一样，原本就是神盾局特工，所以也不会有加入复仇者联盟的专门情节节点，于是她在发现了真相后被遭到皮姆攻击。黑寡妇和皮姆的对战，很像《美国队长3》里她和二代蚁人斯科特·朗的对战，在能随意变小还能保持攻击力的黄衫怪/蚁人勉强，黑寡妇也很难对抗，这次黄衫怪没有下限，毫不留情，最终杀死了黑寡妇。
彩蛋碎碎念
除了以上提到的，这一集里还有很多其他的彩蛋，不过都很琐碎，就简单写了。
拘捕黑寡妇的是神盾局突击队，在《美国队长2》里已经展现出他们其实都是九头蛇成员，领头的是朗姆洛，后来成为反派交叉骨，杰克·罗林斯也登场了。
黑寡妇前往卡尔弗大学寻找贝蒂·罗斯帮助时发现了班纳就躲在一旁。让班纳暴露的是一个“斯坦利披萨店”的棒球帽，这也是班纳在《无敌浩克》里使用的伪装。
雷神被杀后，洛基率领阿斯加德的*队军**来到地球，面对神盾局时要求尼克·弗瑞和他的手下下跪，“在神的面前跪下”，和他在《复仇者联盟》里在德国说的一样。
当洛基要因雷神之死报复地球时，他使用一个蓝色发光的盒子放出冻气攻击了神盾局的特工，这应该是寒冰之匣（Casket Of Ancient Winters）。这是洛基的家乡约顿海姆的宝物，奥丁击败了约顿海姆的冰霜巨人后把寒冰之匣放入了自己的宝库中，在《雷神3》中占领了阿斯加德的死亡女神海拉在检视宝库是看到寒冰之匣，认为它“弱爆了！（Weak！）”
科尔森的神盾局登陆密码是“#SteveSteveSteveIHeartSteve0704”，“史蒂夫史蒂夫史蒂夫我爱史蒂夫0704”，科尔森真的非常喜欢美国队长，另外0704是美国队长史蒂夫·罗杰斯的生日。
登陆神盾局系统后，黑寡妇看到了一份人员名单，除了菲尔·科尔森和尼克·弗瑞之外，这些文件还包括玛丽亚·希尔（弗瑞的副手）、亚历山大·皮尔斯（神盾局负责人），以及珍妮特·范·戴恩，也即是皮姆的妻子，1987年失踪的一名神盾局特工。
尼克·弗瑞被洛基限时交出杀死雷神的凶手，当时限将到时，还没查出真相的弗瑞几乎要求助惊奇队长，他拿出了在汽车储物箱里的一个传呼机，这是惊奇队长留给他紧急联系用的，能穿越宇宙传递紧急信号。在《惊奇队长》里交给弗瑞，在《复仇者联盟3：无限战争》最后的彩蛋里被弗瑞拿出来，但没来得及使用弗瑞就化成了灰，之后在《复仇者联盟4：终局之战》中被残余的复仇者发现，终于叫来了惊奇队长。
当尼克·弗瑞查明了真相后，按照约定会见洛基，在洛基的临时基地外，他见到了毁灭者，也就是《雷神》最后的对手，由奥丁制造，漫画中最早是准备用来对抗天神组的——就是即将上映的《永恒族》中制造永恒族和异常族的天神组。
危险的结局
洛基协助弗瑞抓捕到了黄衫怪，但他没有立刻离开，而是借着自己带领的阿斯加德*队军**进驻联合国、在全球各地开始对地球强行接管。和前两集一样，主线的问题解决后，总是有更严重的问题出现。第1集里我们不知道具体有什么危机，但尼克·弗瑞不会无缘无故用宇宙立方打开空间门带回卡特队长。第2集最后伊戈终于找到了彼得·奎尔，这代表着他会开始实行同化宇宙的计划。
洛基直接来占领地球了，而且已经没有复仇者来阻止洛基，所以在片尾弗瑞开始寻找新的复仇者，首先找到了被冰冻的美国队长，之后来到弗瑞身边的就是惊奇队长，其实有她在，就相当于一个联盟。但是洛基没有带来心灵宝石，那么在这个世界里不会有红女巫，没有斯塔克和班纳，也不会有奥创，也不会有幻视，二代蚁人也不会有。好在按照这个时间点，《钢铁侠2》里斯塔克已经把MK2钢铁战衣交给了罗迪，所以战争机器应该可以加入进来，黑豹也能加入。
演员回归
斯嘉丽·约翰逊没有回归配音黑寡妇，这是显而易见的，毕竟现在她和迪士尼闹得不可开交。其他有大量的演员回归他们的角色，包括塞缪尔·杰克逊（尼克·弗瑞）、克拉克·格雷格（菲尔·科尔森）、杰里米·雷纳（鹰眼）、马克·鲁法洛（布鲁斯·班纳）、汤姆·希德勒斯顿（洛基）和迈克尔·道格拉斯（汉克·皮姆），还有给出演交叉骨的弗兰克·格里洛、出演希芙女士的杰米·亚历山大。
小罗伯特·唐尼也没有回归，给钢铁侠托尼·斯塔克配音的是迈克·温格特，他多次在漫威的各种动画里给钢铁侠配音。罗斯将军父女的演员也没有回归，惊奇队长的配音则是亚历山德拉·丹尼尔斯，最惨的是雷神，演员克里斯·海姆斯沃斯没有回归的原因是，雷神没来得及说话就被杀了。