一、运行方式不同
微商城只能基于微信公众号内部运行，属于一个子菜单，脱离公众号就不复存在。而微信小程序是一个独立运行的程序，相当于一个应用，营销功能媲美APP，或更优于APP。
二、进入商城方式不同
小程序商城自带社交属性，即用即走。强大的社交属性推动了小程序的分享功能，进而裂变大批用户，用户直接分享商城商品，激发用户消费潜力。虽然目前公众号商城也支持好友分享，但需要先关注公众号，才可以进入微商城，而关注行为就会流失大量的用户，不能直接触达微商城。小程序无需关注就可直接进入商城页面，简化流程，防止用户流失。
3、 流量入口不同
公众号微商城的流量入口主要是公众号菜单栏、朋友圈、微信群等。而小程序的流量入口高达60+。除了以上三种方式，小程序能够与公众号对接，将公众号作为流量入口外，还拥有附近小程序、搜一搜、朋友分享、群分享、历史记录等众多入口，多渠道获取流量。
四、营销方式不同
小程序商城兼容多种营销方法。分销是一个重要营销玩法，基于商品分享推广，订单完成而结算佣金，分销商可以独立运营一个分销店铺，自己营销定价。目前大火的直播带货，也能在小程序上实现，进而引领新一轮购物风潮。除此之外，拼团，秒杀，优惠券，积分等等营销插件，成熟完整，可极速搭建并转化盈利。公众号微商城营销方式单一，不具备分销模式，不支持直播购物，营销方式过于简单粗暴，转化效果不佳。
五、运营方式不同
微信公众号商城的宣传、推广，首先要利用公众号发布软文，吸引粉丝关注，然后再将粉丝引流到商城，只能在内部宣传，导流，推广面狭窄。而小程序商城运营方式更多元。商家可以借助线下活动，通过扫码的方式，邀请用户在小程序商城消费获得优惠，线下用户转化为线上粉丝。"附近的小程序"、"搜索"等功能，提高小程序曝光率，快速、直接触达用户。
六、实现技术不同
小程序基于微信自身开发环境与开发语言。小程序是微信内的云端应用，因此无需*载下**。公众号是基于传统H5开发与运行，传统H5运行环境是浏览器，系统权限方面，微信小程序能够通过微信获得更多的系统权限，比如网络通信状态、数据缓存能力等，在此微信相当于架在原有系统中的新的操作系统，小程序借助微信与系统间接交互，使得能够拥有原生APP的体验。
写在最后
虽然小程序商城与公众号微商城有众多的不同，却不影响二者的组合使用。小程序+公众号的组合营销，能够弥补双方的不足，借助公众号软文的引流模式，提高小程序商品转化率，同时小程序为公众号营销软文实现内容付费的可能。
